90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0033 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0033  protein of unknown function DUF52  100 
 
 
263 aa  541  1e-153  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1848  hypothetical protein  46.51 
 
 
262 aa  229  2e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2152  hypothetical protein  37.02 
 
 
481 aa  182  5e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.404851 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1057  hypothetical protein  38.87 
 
 
268 aa  175  8e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0897  hypothetical protein  36.67 
 
 
278 aa  172  5e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0307  protein of unknown function DUF52  36.33 
 
 
265 aa  171  1e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  3.24759e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0726  protein of unknown function DUF52  36.64 
 
 
282 aa  169  3e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.14688  hitchhiker  2.54524e-07 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0072  hypothetical protein  38.7 
 
 
267 aa  169  6e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0398  hypothetical protein  34.98 
 
 
274 aa  169  6e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1586  hypothetical protein  36.26 
 
 
464 aa  165  7e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.251003  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2215  protein of unknown function DUF52  36.96 
 
 
274 aa  165  9e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.386097  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2620  hypothetical protein  39.47 
 
 
282 aa  164  1e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.568978 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1177  hypothetical protein  34.55 
 
 
447 aa  160  2e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1171  hypothetical protein  34.55 
 
 
447 aa  159  3e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0572  hypothetical protein  35.97 
 
 
264 aa  159  4e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.277433  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1004  hypothetical protein  36.19 
 
 
270 aa  158  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1971  hypothetical protein  34.09 
 
 
267 aa  146  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.307446 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3293  protein of unknown function DUF52  31.06 
 
 
274 aa  145  5e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0448  hypothetical protein  34.34 
 
 
282 aa  144  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2429  hypothetical protein  34.22 
 
 
484 aa  140  3e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  6.52798e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2683  hypothetical protein  33.96 
 
 
274 aa  137  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.235336  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1871  hypothetical protein  32.21 
 
 
268 aa  134  2e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6306  hypothetical protein  32.95 
 
 
254 aa  133  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1996  AMMECR1 domain-containing protein  35.19 
 
 
522 aa  129  3e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1298  hypothetical protein  30.22 
 
 
276 aa  127  2e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.495257  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2214  hypothetical protein  35.14 
 
 
262 aa  127  2e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2377  protein of unknown function DUF52  34.31 
 
 
262 aa  126  4e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0146872  normal  0.265283 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0931  hypothetical protein  32.59 
 
 
266 aa  125  7e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1811  hypothetical protein  30.29 
 
 
262 aa  117  3e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2556  protein of unknown function DUF52  31.7 
 
 
268 aa  115  8e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.323501  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0477  hypothetical protein  30.58 
 
 
269 aa  114  1e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1105  hypothetical protein  33.45 
 
 
281 aa  114  2e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1590  hypothetical protein  33.57 
 
 
282 aa  114  2e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1094  hypothetical protein  32.26 
 
 
438 aa  113  3e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1313  hypothetical protein  30.91 
 
 
438 aa  112  5e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1383  hypothetical protein  29.23 
 
 
284 aa  112  6e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1422  hypothetical protein  30.66 
 
 
265 aa  112  8e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00741798 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0062  hypothetical protein  32.07 
 
 
281 aa  112  8e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.853485  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1957  hypothetical protein  31.52 
 
 
267 aa  112  9e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0594008  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1509  protein of unknown function DUF52  29.54 
 
 
269 aa  111  1e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0028  hypothetical protein  33.8 
 
 
281 aa  111  1e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0697  hypothetical protein  30.74 
 
 
284 aa  111  1e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1122  hypothetical protein  30.94 
 
 
438 aa  111  1e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1088  hypothetical protein  30.51 
 
 
274 aa  110  2e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0191  hypothetical protein  29.82 
 
 
284 aa  110  3e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.528017  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2139  hypothetical protein  30.07 
 
 
282 aa  110  3e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000979295  hitchhiker  7.10104e-05 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1286  hypothetical protein  29.43 
 
 
284 aa  109  5e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0632  hypothetical protein  29.08 
 
 
284 aa  108  7e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.339724 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0933  protein of unknown function DUF52  29.93 
 
 
262 aa  108  9e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  8.7287e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2394  hypothetical protein  31.5 
 
 
264 aa  108  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00099938  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5677  protein of unknown function DUF52  30.14 
 
 
275 aa  106  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0901572 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0680  hypothetical protein  30.97 
 
 
279 aa  106  4e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0837  hypothetical protein  30 
 
 
277 aa  106  4e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.543815  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2891  hypothetical protein  30.94 
 
 
264 aa  106  5e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00545053  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2247  hypothetical protein  31.5 
 
 
267 aa  105  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0215  hypothetical protein  28.89 
 
 
275 aa  105  1e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0860  hypothetical protein  30 
 
 
277 aa  104  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.671091  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1651  dioxygenase  32.98 
 
 
267 aa  103  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  9.23672e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0272  protein of unknown function DUF52  27.72 
 
 
287 aa  103  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00648873  hitchhiker  0.000150956 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2409  hypothetical protein  28.21 
 
 
284 aa  102  7e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.156274  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0059  hypothetical protein  32.86 
 
 
282 aa  101  1e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0213251 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1742  hypothetical protein  31.39 
 
 
262 aa  101  1e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0420236  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0273  hypothetical protein  30.88 
 
 
287 aa  100  2e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3359  hypothetical protein  28.31 
 
 
271 aa  100  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1326  protein of unknown function DUF52  28.52 
 
 
282 aa  99.8  4e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0115608 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0208  protein of unknown function DUF52  29.86 
 
 
268 aa  97.8  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1046  protein of unknown function DUF52  30.42 
 
 
284 aa  97.8  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.491451  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1830  hypothetical protein  29.01 
 
 
267 aa  97.1  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1268  hypothetical protein  28.94 
 
 
265 aa  96.3  5e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1264  hypothetical protein  29.56 
 
 
267 aa  95.9  6e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  4.72011e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2994  protein of unknown function DUF52  29.89 
 
 
283 aa  95.5  8e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.255109  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1691  hypothetical protein  27.01 
 
 
267 aa  94.7  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2961  hypothetical protein  26.92 
 
 
298 aa  92  8e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2295  protein of unknown function DUF52  26.94 
 
 
266 aa  91.7  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3224  protein of unknown function DUF52  29.3 
 
 
270 aa  89.4  6e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1301  protein of unknown function DUF52  28.94 
 
 
271 aa  89  7e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0694479  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1885  protein of unknown function DUF52  29.12 
 
 
267 aa  86.3  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00286837  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0180  protein of unknown function DUF52  27.62 
 
 
285 aa  85.9  6e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.578209  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1928  protein of unknown function DUF52  26.2 
 
 
266 aa  85.5  7e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3068  hypothetical protein  25.72 
 
 
277 aa  82.8  5e-15  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.27957  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01140  conserved hypothetical protein  34.84 
 
 
346 aa  82  9e-15  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.599641  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46220  predicted protein  32.35 
 
 
356 aa  79.7  4e-14  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0715961  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0299  hypothetical protein  30.07 
 
 
282 aa  76.6  4e-13  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0469  hypothetical protein  26.94 
 
 
329 aa  73.6  3e-12  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.49668  normal  0.0956688 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2594  hypothetical protein  29.95 
 
 
265 aa  63.2  4e-09  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36516  predicted protein  27.85 
 
 
345 aa  62.8  6e-09  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1868  protein of unknown function DUF52  25.84 
 
 
298 aa  62  1e-08  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1355  protein of unknown function DUF52  29.49 
 
 
265 aa  60.5  3e-08  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.235879  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1254  protein of unknown function DUF52  29.68 
 
 
265 aa  59.7  5e-08  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.286029  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03789  DUF52 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G03970)  27.06 
 
 
366 aa  55.8  7e-07  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>