39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0027 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0027  SirA family protein  100 
 
 
70 aa  145  3e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.111426  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2088  hypothetical protein  43.28 
 
 
69 aa  65.5  3e-10  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.35634  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3433  SirA family protein  44.26 
 
 
195 aa  60.8  7e-09  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  7.87487e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3495  SirA family protein  44.26 
 
 
195 aa  58.9  2e-08  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.70288e-33 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0630  selenium metabolism protein YedF  50 
 
 
198 aa  58.2  3e-08  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0025612  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2448  SirA family protein  45.9 
 
 
196 aa  58.5  3e-08  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  8.88888e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2082  SirA family protein  44.29 
 
 
72 aa  57.4  6e-08  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2521  hypothetical protein  43.55 
 
 
195 aa  57.4  7e-08  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.104075  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1439  SirA-like  46.77 
 
 
72 aa  57.4  7e-08  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  1.45745e-08  normal  0.024487 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1620  SirA family protein  41.18 
 
 
71 aa  56.2  1e-07  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.591727  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0251  SirA family protein  41.43 
 
 
202 aa  56.2  2e-07  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3402  SirA family protein  48.15 
 
 
200 aa  55.1  3e-07  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0293629 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2433  SirA family protein  41.79 
 
 
74 aa  55.1  4e-07  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1085  hypothetical protein  40.32 
 
 
196 aa  52.4  2e-06  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  5.60528e-18  hitchhiker  9.2747e-06 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1894  SirA family protein  42.31 
 
 
209 aa  51.2  5e-06  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00825245  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2054  selenium metabolism protein YedF  40.32 
 
 
196 aa  50.1  1e-05  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3077  SirA family protein  43.86 
 
 
199 aa  48.5  3e-05  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000237941 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0904  hypothetical protein  41.54 
 
 
71 aa  48.5  3e-05  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00947642  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0821  hypothetical protein  41.79 
 
 
79 aa  48.1  4e-05  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3765  SirA family protein  45.45 
 
 
193 aa  47.8  5e-05  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  7.18423e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1242  SirA family protein  35.29 
 
 
196 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2466  hypothetical protein  39.66 
 
 
69 aa  45.4  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  3.15359e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0063  SirA family protein  40.98 
 
 
69 aa  45.1  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0046  SirA family protein  34.33 
 
 
75 aa  44.3  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1708  hypothetical protein  41.18 
 
 
204 aa  44.7  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0132248  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0303  redox protein, regulator of disulfide bond formation  36.23 
 
 
199 aa  44.3  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.62968e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0361  putative transcriptional regulator  40.68 
 
 
192 aa  43.5  0.0009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0248  hypothetical protein  36.36 
 
 
73 aa  43.5  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1779  hypothetical protein  33.33 
 
 
199 aa  43.1  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2136  translation initiation factor IF-3  34.48 
 
 
200 aa  42.4  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3169  SirA family protein  39.62 
 
 
76 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0368  hypothetical protein  39.29 
 
 
214 aa  41.6  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.162867 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0124  SirA-like  36.84 
 
 
193 aa  41.6  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0144261  normal  0.614717 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1887  SirA-like protein  34.85 
 
 
195 aa  41.2  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0855  SirA family protein  40.38 
 
 
70 aa  41.2  0.005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.412959  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2100  hypothetical protein  35.71 
 
 
73 aa  40.8  0.006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2159  SirA family protein  34.38 
 
 
197 aa  40.8  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  1.02186e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2431  selenium metabolism protein YedF  38 
 
 
189 aa  40.4  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00446585  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1487  SirA family protein  37.04 
 
 
223 aa  40.4  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>