More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0025 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0025  MATE efflux family protein  100 
 
 
433 aa  873  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00700816  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2891  multidrug efflux pump  36.36 
 
 
443 aa  264  3e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.466203  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1551  MATE efflux family protein  34.98 
 
 
440 aa  259  9e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.959023  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2863  MATE efflux family protein  35.81 
 
 
445 aa  244  2e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.277434  normal  0.247685 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002151  DNA-damage-inducible protein F  34.62 
 
 
449 aa  240  3e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.539092  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0753  MATE efflux family protein  33.8 
 
 
441 aa  239  5e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.10371 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2425  DNA-damage-inducible protein F  35.15 
 
 
454 aa  238  2e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0845  MATE efflux family protein  34.81 
 
 
439 aa  236  6e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.457545  normal  0.657757 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0896  MATE efflux family protein  32.63 
 
 
460 aa  236  7e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0613531 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0439  MATE efflux family protein  34.89 
 
 
438 aa  234  2e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0110  MATE efflux family protein  33.41 
 
 
469 aa  234  2e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.372068  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0879  MATE efflux family protein  35.35 
 
 
444 aa  234  3e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.696604 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0247  MATE efflux family protein  33.96 
 
 
447 aa  231  2e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00266  multidrug efflux pump  33.74 
 
 
423 aa  228  1e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0035  DNA-damage-inducible protein F  33.26 
 
 
516 aa  224  2e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4619  MATE efflux family protein  33.66 
 
 
452 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0868  MATE efflux family protein  34.7 
 
 
440 aa  223  5e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0983692  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2204  multidrug efflux pump, MATE family  35.35 
 
 
444 aa  223  6e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.023203  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0144  MATE efflux family protein  34.58 
 
 
455 aa  222  9e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4123  MATE efflux family protein  34.58 
 
 
455 aa  222  9e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4322  MATE efflux family protein  34.58 
 
 
455 aa  222  1e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0061  MATE efflux family protein  33.1 
 
 
448 aa  221  2e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.871817  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4191  MATE efflux family protein  34.35 
 
 
456 aa  219  5e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1536  DNA-damage-inducible protein  33.64 
 
 
463 aa  219  6e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.65109  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1507  DNA-damage-inducible protein F  33.64 
 
 
463 aa  219  7e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.208132  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4009  MATE efflux family protein  34.12 
 
 
443 aa  218  2e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0794  cation efflux pump, DNA-damage-inducible protein  32.94 
 
 
434 aa  217  3e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00344653 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4459  DNA-damage-inducible SOS response protein  32.38 
 
 
454 aa  217  3e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2937  MATE efflux family protein  33.73 
 
 
451 aa  217  3e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1292  multi anti extrusion protein MatE  32.71 
 
 
455 aa  216  7e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.110492 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4849  MATE efflux family protein  32.13 
 
 
450 aa  214  2e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2844  MATE efflux family protein  33.18 
 
 
455 aa  214  2e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.94035  normal  0.605375 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0587  DNA-damage-inducible protein F  32.48 
 
 
447 aa  215  2e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0791  MATE efflux family protein  33.74 
 
 
451 aa  214  2e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3772  MATE efflux family protein  32.13 
 
 
450 aa  214  2e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0596  DNA-damage-inducible protein  33.18 
 
 
463 aa  214  2e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0179694  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4234  MATE efflux family protein  31.71 
 
 
447 aa  214  2e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3792  MATE efflux family protein  32.35 
 
 
456 aa  213  4e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1840  MATE efflux family protein  31.55 
 
 
458 aa  213  5e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308247  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0160  MATE efflux family protein  33.18 
 
 
456 aa  210  3e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.538946 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2965  MATE efflux family protein  32.95 
 
 
446 aa  210  4e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0142288 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1467  MATE efflux family protein  32.95 
 
 
441 aa  209  5e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.375826  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3527  MATE efflux family protein  33.18 
 
 
436 aa  209  8e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0248  DNA-damage-inducible SOS response protein  32.71 
 
 
439 aa  209  1e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.314498  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1707  putative membrane protein (DNA-damage-inducible protein)  32.96 
 
 
463 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0283  DNA-damage-inducible F transmembrane protein  33.02 
 
 
457 aa  207  3e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00354836  normal  0.290631 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0107  MATE efflux family protein  31.41 
 
 
448 aa  206  6e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0324  putative DNA-damage-inducible protein F  31.24 
 
 
455 aa  204  2e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.315939  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0069  MATE efflux family protein  33.65 
 
 
429 aa  204  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.380329  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4457  multi anti extrusion protein MatE  34.81 
 
 
454 aa  204  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.13482  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1069  MATE efflux family protein  30.37 
 
 
461 aa  202  8e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.279345 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4617  DNA-damage-inducible protein F  32.94 
 
 
455 aa  202  9e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0160  MATE efflux family protein  33.65 
 
 
444 aa  201  1e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0310  DNA-damage-inducible protein F, putative  31.01 
 
 
455 aa  201  3e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1296  MATE efflux family protein  34.35 
 
 
459 aa  200  5e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2755  DNA-damage-inducible protein F  34.5 
 
 
463 aa  199  6e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0789961  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1199  MATE efflux family protein  33.64 
 
 
456 aa  199  7e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.281549  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4595  MATE efflux family protein  30.48 
 
 
445 aa  199  1e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.122276 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1314  MATE efflux family protein  34.35 
 
 
459 aa  199  1e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3501  DNA-damage-inducible protein F  31.65 
 
 
437 aa  198  2e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4581  DNA-damage-inducible SOS response protein  31.67 
 
 
441 aa  196  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.941537 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0403  MATE efflux family protein  29.77 
 
 
451 aa  196  7e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.360287  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4632  DNA-damage-inducible SOS response protein  31.67 
 
 
441 aa  196  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.251658 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03876  hypothetical protein  32.86 
 
 
459 aa  196  8e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3984  DNA-damage-inducible SOS response protein  32.86 
 
 
459 aa  196  8e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.270802 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03916  DNA-damage-inducible SOS response protein  32.86 
 
 
459 aa  196  8e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4597  DNA-damage-inducible SOS response protein  32.86 
 
 
459 aa  196  8e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4284  DNA-damage-inducible SOS response protein  32.86 
 
 
459 aa  196  9e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0223  MATE efflux family protein  31.15 
 
 
448 aa  195  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0180  MATE efflux family protein  32.07 
 
 
445 aa  195  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4506  DNA-damage-inducible SOS response protein  32.86 
 
 
441 aa  194  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4553  DNA-damage-inducible SOS response protein  32.62 
 
 
459 aa  194  3e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4495  DNA-damage-inducible SOS response protein  31.43 
 
 
441 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4580  DNA-damage-inducible SOS response protein  31.43 
 
 
441 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4430  DNA-damage-inducible SOS response protein  31.43 
 
 
441 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  5.33043e-07 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0729  MATE efflux family protein  29.84 
 
 
449 aa  193  4e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.671906  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0833  MATE efflux family protein  34.12 
 
 
459 aa  194  4e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5525  DNA-damage-inducible SOS response protein  32.62 
 
 
441 aa  193  5e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.580203  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1224  MATE efflux family protein  33.64 
 
 
456 aa  192  7e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0542  MATE efflux family protein  32.95 
 
 
454 aa  192  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.547089 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3949  MATE efflux family protein  32.38 
 
 
441 aa  191  3e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1640  DNA-damage-inducible protein F  29.68 
 
 
436 aa  190  4e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0194  MATE efflux family protein  31.79 
 
 
446 aa  190  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3875  MATE efflux family protein  32.71 
 
 
456 aa  186  7e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3802  MATE efflux family protein  32.71 
 
 
455 aa  186  7e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04000  Na(+) driven multidrug efflux pump  29.91 
 
 
424 aa  185  1e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4001  MATE efflux family protein  32.48 
 
 
455 aa  182  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1994  MATE efflux family protein  33.49 
 
 
453 aa  179  7e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0630  multi anti extrusion protein MatE  30.02 
 
 
449 aa  179  7e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4384  multi anti extrusion protein MatE  29.36 
 
 
446 aa  179  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0614  MATE efflux family protein  29.95 
 
 
445 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0166177 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4844  DNA-damage-inducible protein F  29.36 
 
 
446 aa  174  2e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.8205  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07070  Multidrug efflux protein, MatE family  29 
 
 
453 aa  172  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12454  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0519  MATE efflux family protein  30.96 
 
 
455 aa  170  4e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.49931 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3613  MATE efflux family protein  28.54 
 
 
477 aa  169  6e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.214192  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0912  MATE efflux family protein  27.9 
 
 
455 aa  166  7e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0886  MATE efflux family protein  27.9 
 
 
455 aa  166  7e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2494  MATE efflux family protein  28.31 
 
 
477 aa  166  8e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1710  MATE efflux family protein  28.38 
 
 
455 aa  162  8e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.841637  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0569  MATE efflux family protein  28.8 
 
 
445 aa  162  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.163672  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>