More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0024 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0024  ABC transporter related protein  100 
 
 
254 aa  507  1e-143  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000767046  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2757  ABC transporter related  46.99 
 
 
253 aa  225  6e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2368  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  45.71 
 
 
249 aa  216  2e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1802  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.63 
 
 
307 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0111168  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2990  ABC transporter, ATPase subunit  42.64 
 
 
559 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1111  ABC transporter related  44.53 
 
 
551 aa  212  4.9999999999999996e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.778341 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1451  ABC transporter related  42.26 
 
 
555 aa  211  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1017  ABC transporter related  44.13 
 
 
551 aa  209  3e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0546481 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0560  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.31 
 
 
334 aa  209  5e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.204279  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1234  ABC transporter related  43.51 
 
 
270 aa  207  1e-52  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0347  ABC transporter related  42.91 
 
 
320 aa  207  2e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5293  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  48.5 
 
 
294 aa  206  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1176  ABC transporter ATP-binding protein  41.8 
 
 
551 aa  206  4e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000161898  normal  0.341996 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2490  ABC transporter related  45.81 
 
 
249 aa  204  1e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2539  ABC transporter related  45.81 
 
 
249 aa  204  1e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000292803  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0386  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.64 
 
 
313 aa  204  2e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00722146  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0189  ABC transporter-related protein  43.53 
 
 
257 aa  202  4e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1540  ABC transporter related  42.86 
 
 
533 aa  202  5e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.478578 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2743  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.36 
 
 
320 aa  201  7e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1722  ABC transporter related  41 
 
 
544 aa  201  7e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.185167  normal  0.489331 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6371  ABC transporter related  41.6 
 
 
544 aa  201  8e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1707  ABC transporter related  41.6 
 
 
544 aa  201  8e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4132  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  41.63 
 
 
322 aa  201  9e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0541  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.52 
 
 
335 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.517893 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1711  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.1 
 
 
325 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000180218  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6006  ABC transporter related  41.08 
 
 
257 aa  199  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3218  ABC transporter related  41.63 
 
 
585 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4998  ABC transporter, ATPase subunit  41.5 
 
 
547 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.465618 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0126  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.03 
 
 
347 aa  199  3.9999999999999996e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110005  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4339  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.4 
 
 
708 aa  199  5e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.108178  normal  0.933802 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3130  ABC transporter related  41 
 
 
552 aa  198  5e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.713797  normal  0.141253 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3487  ABC transporter related  40.22 
 
 
552 aa  199  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3447  ABC transporter related  45.69 
 
 
282 aa  198  6e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.491828 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6018  ABC transporter related  41.84 
 
 
540 aa  198  6e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.685553  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2059  ABC transporter related  41.84 
 
 
540 aa  198  6e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0427547  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0417  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.84 
 
 
327 aa  198  7e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.777417  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1380  ABC transporter related  40.76 
 
 
539 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0115992  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5079  ABC transporter related  42.42 
 
 
307 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.377061  hitchhiker  0.00966966 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2826  ABC transporter related  38.61 
 
 
572 aa  197  1.0000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0515832  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_928  ABC-type oligopeptide transport system, ATPase component  42.58 
 
 
329 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.536054  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2624  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 
331 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.591413  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0956  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.7 
 
 
339 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.960319  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1961  ABC transporter related  42.26 
 
 
540 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.323177  normal  0.323319 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2528  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  41.92 
 
 
335 aa  196  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.376167  hitchhiker  0.00943552 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2091  ABC transporter related  42.26 
 
 
540 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.160498  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37840  putative ATP-binding component of ABC transporter  40.93 
 
 
536 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000360917  normal  0.225303 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4045  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.57 
 
 
336 aa  197  2.0000000000000003e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2498  ABC transporter related  40.34 
 
 
544 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000299365  normal  0.0176936 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0065  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.87 
 
 
444 aa  196  3e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0310035 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0847  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  44.54 
 
 
325 aa  196  3e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1981  ABC transporter, ATP-binding protein  39.92 
 
 
544 aa  196  3e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000154276  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  41.27 
 
 
539 aa  196  3e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2398  ABC transporter related  41.2 
 
 
310 aa  196  3e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1340  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like protein  41.96 
 
 
342 aa  196  3e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.801873 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1371  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.22 
 
 
338 aa  196  3e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.116668  normal  0.025409 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2078  ABC transporter related  41.42 
 
 
540 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0240438  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1217  ABC transporter related  42.26 
 
 
540 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.322449  normal  0.502892 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0615  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.91 
 
 
327 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5368  ABC transporter, ATPase subunit  41.42 
 
 
540 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.181181  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0939  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.35 
 
 
329 aa  195  6e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2574  ABC transporter related  40.31 
 
 
552 aa  195  6e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0248  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.93 
 
 
443 aa  195  6e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6267  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.18 
 
 
330 aa  195  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.787873 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04940  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.15 
 
 
326 aa  195  7e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00804417  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2487  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.06 
 
 
465 aa  195  7e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.282444  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0389  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.94 
 
 
321 aa  194  9e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0190  ABC transporter related  45.42 
 
 
530 aa  194  9e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0196  ABC transporter related  45.42 
 
 
530 aa  194  9e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0425  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.74 
 
 
323 aa  194  1e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2490  peptide/opine/nickel uptake ABC transporter ATP-binding protein  39.53 
 
 
549 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0280689  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2851  ABC transporter related  42.73 
 
 
310 aa  194  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.148442  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0222  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  41.18 
 
 
336 aa  194  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0818  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.41 
 
 
362 aa  194  1e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0816  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.7 
 
 
339 aa  194  1e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0235  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  41.18 
 
 
336 aa  194  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6444  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.57 
 
 
330 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.116745  normal  0.247483 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2143  ABC transporter-related protein  42.08 
 
 
549 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0481  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.86 
 
 
333 aa  194  1e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000513097  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0394  ABC-type oligopeptide transport system, ATPase component  42.08 
 
 
312 aa  194  1e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1062  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.84 
 
 
336 aa  194  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3544  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.08 
 
 
328 aa  194  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1172  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.76 
 
 
333 aa  193  2e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0249  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  40.78 
 
 
321 aa  193  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00158966  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5904  ABC transporter related  42.19 
 
 
555 aa  193  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.969657  normal  0.702258 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0212  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.78 
 
 
321 aa  193  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3207  peptide/opine/nickel uptake ABC transporter ATP-binding protein  39.53 
 
 
549 aa  193  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000664332  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7123  ABC transporter related  41.51 
 
 
629 aa  193  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.333209  normal  0.399658 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1227  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.86 
 
 
339 aa  193  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1604  ABC transporter, ATP-binding protein  39.53 
 
 
549 aa  193  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000882575  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0223  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.18 
 
 
321 aa  194  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2126  ABC transporter related  39.77 
 
 
556 aa  193  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.562113  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3076  ABC transporter-like  43.98 
 
 
524 aa  193  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0245  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  41.18 
 
 
321 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4592  ABC transporter related  42.57 
 
 
629 aa  193  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.390249  normal  0.807513 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5076  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  40.78 
 
 
321 aa  193  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.831918  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2544  peptide/opine/nickel uptake ABC transporter ATP-binding protein  39.53 
 
 
549 aa  193  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303665  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1379  peptide/opine/nickel uptake ABC transporter ATP-binding protein  39.53 
 
 
549 aa  193  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2106  peptide/opine/nickel uptake ABC transporter ATP-binding protein  39.53 
 
 
549 aa  193  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00388823  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6874  ABC transporter related  41.8 
 
 
555 aa  192  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2015  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.98 
 
 
329 aa  192  3e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.471661  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>