More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0021 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0021  nickel ABC transporter, permease subunit NikB  100 
 
 
311 aa  629  1e-179  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00143513  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.22 
 
 
311 aa  328  6e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.184188  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0350  nickel ABC transporter, permease subunit NikB  45.45 
 
 
310 aa  313  2e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0386  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.26 
 
 
312 aa  278  8e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2034  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.55 
 
 
309 aa  273  3e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0274  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.55 
 
 
312 aa  270  2e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0369  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.66 
 
 
316 aa  266  3e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2276  nickel transporter permease NikB  42.53 
 
 
314 aa  266  4e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.293593  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7614  nickel transporter permease NikB  40.65 
 
 
314 aa  261  1e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0238  nickel ABC transporter, permease subunit NikB  40.78 
 
 
314 aa  255  6e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03279  hypothetical protein  40.78 
 
 
314 aa  255  6e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0239  nickel transporter permease NikB  40.78 
 
 
314 aa  255  6e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03326  nickel transporter subunit  40.78 
 
 
314 aa  255  6e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3761  nickel transporter permease NikB  40.78 
 
 
314 aa  255  6e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3676  nickel transporter permease NikB  40.78 
 
 
314 aa  255  6e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3959  nickel transporter permease NikB  40.78 
 
 
314 aa  255  6e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3844  nickel transporter permease NikB  40.78 
 
 
314 aa  255  6e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4817  nickel transporter permease NikB  40.45 
 
 
314 aa  253  2e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6075  nickel transporter permease NikB  39.94 
 
 
319 aa  253  3e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1322  nickel transport system permease protein NikB  40.58 
 
 
310 aa  251  9e-66  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00196564  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0803  nickel transporter permease NikB  40.72 
 
 
314 aa  249  5e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.226349  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0753  nickel transporter permease NikB  40.32 
 
 
314 aa  247  2e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2401  nickel transporter permease NikB  42.53 
 
 
313 aa  244  1e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1835  nickel transporter permease NikB  42.07 
 
 
314 aa  242  6e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.829834  hitchhiker  0.0019148 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3006  nickel transporter permease NikB  37.66 
 
 
313 aa  229  4e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0438476  normal  0.3014 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1031  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.66 
 
 
312 aa  228  8e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0169288  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2371  peptide ABC transporter, permease protein, putative  37.7 
 
 
311 aa  228  9e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.01 
 
 
306 aa  228  1e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0469  nickel ABC transporter, permease protein  38.96 
 
 
309 aa  226  4e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3343  nickel transporter permease NikB  37.01 
 
 
313 aa  225  8e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2789  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
306 aa  222  8e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2493  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.22 
 
 
311 aa  220  3e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277015  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2542  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.22 
 
 
311 aa  220  3e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000910352  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0511  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.77 
 
 
314 aa  219  6e-56  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0538  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.41 
 
 
311 aa  218  1e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.396259 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1869  ABC-type transport system protein  34.38 
 
 
324 aa  214  1e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0953  peptide ABC transporter, permease protein, putative  35.28 
 
 
333 aa  214  2e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.353357  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.77 
 
 
324 aa  213  4e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0942  nickel-transporting ATPase  35.71 
 
 
305 aa  210  2e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.541988  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1591  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.62 
 
 
326 aa  211  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.75386 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1434  peptide ABC transporter, permease protein  33.85 
 
 
326 aa  209  4e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.393954  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.52 
 
 
334 aa  209  7e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.52 
 
 
311 aa  207  2e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000854239  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3451  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.74 
 
 
309 aa  207  2e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.31 
 
 
326 aa  207  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_931  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  35.06 
 
 
305 aa  206  3e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.541229  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1235  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.92 
 
 
333 aa  206  5e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391976  normal  0.26803 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2404  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.66 
 
 
308 aa  206  5e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  3.11261e-08  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2408  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.29 
 
 
316 aa  205  6e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1978  oligopeptide ABC transporter, permease protein  33.55 
 
 
314 aa  205  9e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0581  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.6 
 
 
318 aa  204  1e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.448412  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.62 
 
 
325 aa  204  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0980  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.54 
 
 
313 aa  203  3e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0910692  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.39 
 
 
306 aa  203  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14841  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3675  oligopeptide ABC transporter, permease  33.12 
 
 
316 aa  203  4e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0490538 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0719  hypothetical protein  32.8 
 
 
316 aa  202  5e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.870853 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0245  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.63 
 
 
339 aa  202  5e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.76239  normal  0.869294 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1381  transmembrane ABC transporter protein  34.74 
 
 
307 aa  202  8e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.796345  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2031  ABC transporter, permease protein  35.78 
 
 
313 aa  201  1e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.381274  normal  0.768388 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4049  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.23 
 
 
313 aa  200  2e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1552  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.95 
 
 
306 aa  200  2e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2014  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32 
 
 
325 aa  200  2e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3728  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.28 
 
 
319 aa  199  3e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0980  glutathione ABC transporter permease  33.77 
 
 
306 aa  200  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0951  glutathione ABC transporter permease  33.77 
 
 
306 aa  200  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.258662  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1223  Nickel-transporting ATPase  31.25 
 
 
339 aa  200  3e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0308435 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4233  oligopeptide transport, system permease  34.31 
 
 
306 aa  199  4e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3004  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.42 
 
 
306 aa  199  4e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4245  oligopeptide ABC transporter, permease  34.31 
 
 
306 aa  199  4e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4610  oligopeptide ABC transporter, permease protein  34.31 
 
 
306 aa  199  5e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0918  inner membrane ABC transporter permease protein YddR  33.44 
 
 
306 aa  199  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145156  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4367  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.54 
 
 
313 aa  198  8e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.380096  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0891  glutathione ABC transporter, permease protein  33.44 
 
 
306 aa  198  9e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.976092  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0859  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.63 
 
 
333 aa  198  9e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  3.22853e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1001  glutathione ABC transporter permease  33.44 
 
 
306 aa  198  9e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.09 
 
 
306 aa  198  1e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.740963 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0882  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.48 
 
 
317 aa  198  1e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4732  oligopeptide ABC transporter permease protein  34.31 
 
 
306 aa  197  1e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4392  oligopeptide ABC transporter permease  34.31 
 
 
306 aa  197  1e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.01 
 
 
309 aa  198  1e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  1.95869e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
321 aa  197  2e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2593  oligopeptide ABC transporter, permease protein  32.71 
 
 
343 aa  197  2e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1001  oligopeptide ABC transporter, permease protein  35.11 
 
 
316 aa  197  2e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1766  peptide ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
321 aa  197  2e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.147265  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.1 
 
 
314 aa  196  4e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.44 
 
 
306 aa  196  4e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0823  oligopeptide ABC transporter, permease  34.17 
 
 
316 aa  196  4e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.164685  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
321 aa  195  7e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0692911 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0202  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.94 
 
 
313 aa  195  9e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.650812  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0568  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.2 
 
 
321 aa  195  9e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4456  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
307 aa  194  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.30112  hitchhiker  5.47502e-05 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1320  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.77 
 
 
307 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.525141  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0804  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.48 
 
 
316 aa  194  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00583871  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7327  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  34.74 
 
 
306 aa  194  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.25 
 
 
335 aa  195  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.948745  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.01 
 
 
311 aa  194  1e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.642024 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0982  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  33.65 
 
 
306 aa  195  1e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1620  peptide ABC transporter, permease protein  33.96 
 
 
321 aa  194  2e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.911317 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1925  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.42 
 
 
306 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.730701  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2958  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.91 
 
 
315 aa  194  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>