56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0019 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0019  outer membrane porin  100 
 
 		 402 aa  806    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00360128  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0366  outer membrane porin  45.84 
 
 		 403 aa  311  1e-83  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000502534  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0474  outer membrane porin  43.47 
 
 		 407 aa  277  3e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000458474  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0469  outer membrane porin  38.95 
 
 		 432 aa  248  2e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000534788  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0715  outer membrane porin  35.99 
 
 		 451 aa  218  2e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0142723  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3627  outer membrane porin  35.18 
 
 		 435 aa  204  3e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2207  metalloid reductase RarA  36.78 
 
 		 458 aa  177  2e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0734  outer membrane porin  33.33 
 
 		 384 aa  153  5e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.536638  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2087  outer membrane porin  30.17 
 
 		 452 aa  132  6.999999999999999e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4147  outer membrane porin  28.47 
 
 		 407 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.17719 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0255  outer membrane porin  34.09 
 
 		 406 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4293  outer membrane porin  35.1 
 
 		 398 aa  108  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0195017  normal  0.981008 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1540  outer membrane porin  31.25 
 
 		 456 aa  79.7  0.00000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000339272  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0265  hypothetical protein  33.33 
 
 		 493 aa  78.6  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  unclonable  0.000000000273485  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0137  hypothetical protein  26.35 
 
 		 447 aa  77  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0760948  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0307  hypothetical protein  31.52 
 
 		 280 aa  75.9  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000284732  decreased coverage  0.00000657786 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0754  hypothetical protein  29.33 
 
 		 260 aa  75.1  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1456  hypothetical protein  31.58 
 
 		 450 aa  75.1  0.000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2788  outer membrane porin  25.28 
 
 		 413 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.149615 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3385  outer membrane porin  24.54 
 
 		 412 aa  63.2  0.000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.228993  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1497  hypothetical protein  25.28 
 
 		 442 aa  58.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.291485  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1215  outer membrane porin  25.28 
 
 		 442 aa  58.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00000387662  hitchhiker  0.0000000148872 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3175  outer membrane porin  24.14 
 
 		 420 aa  57  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.442937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1155  outer membrane porin  24.03 
 
 		 413 aa  56.6  0.0000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.864338  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1206  outer membrane porin  26.96 
 
 		 421 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1235  outer membrane porin  26.96 
 
 		 421 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188174  normal  0.966 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1660  outer membrane porin  24.21 
 
 		 428 aa  51.2  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.133249  normal  0.448938 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1991  hypothetical protein  24.21 
 
 		 428 aa  51.2  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0954759  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0135  hypothetical protein  26.67 
 
 		 388 aa  50.1  0.00007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.881577  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2024  outer membrane porin  25.17 
 
 		 417 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.68601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2101  porin  26.34 
 
 		 421 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3656  aromatic compound-specific porin, putative  27.07 
 
 		 420 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.755961  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2074  outer membrane porin  26.49 
 
 		 420 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.695569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24790  putative outer membrane porin  25.93 
 
 		 421 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2730  outer membrane porin  27.56 
 
 		 440 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1059  outer membrane porin  23.3 
 
 		 429 aa  47  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2060  outer membrane protein  27.25 
 
 		 420 aa  46.6  0.0007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000846705  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1917  hypothetical protein  25.21 
 
 		 423 aa  46.6  0.0008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.50266  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3692  outer membrane porin  26.87 
 
 		 417 aa  46.2  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.844156  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2267  hypothetical protein  26.44 
 
 		 409 aa  46.2  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00968313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4009  outer membrane porin  28.87 
 
 		 422 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246775  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2058  outer membrane porin  25.77 
 
 		 417 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.536728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5621  putative porin  25 
 
 		 417 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1577  outer membrane porin  25 
 
 		 417 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.107742  normal  0.53028 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37260  putative porin  22.09 
 
 		 409 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.618786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3198  putative porin  22.09 
 
 		 409 aa  44.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3682  outer membrane porin  25.28 
 
 		 417 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3160  outer membrane porin  24.32 
 
 		 418 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11340  outer membrane porin  26.13 
 
 		 428 aa  44.3  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.703793  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01240  OprE-like outer membrane porin  26.02 
 
 		 440 aa  43.9  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.464345  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4212  outer membrane porin  27.32 
 
 		 427 aa  43.5  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.861462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0242  porin  38.64 
 
 		 444 aa  43.1  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4878  outer membrane porin  24.1 
 
 		 448 aa  43.1  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.477958  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1419  outer membrane porin  25.29 
 
 		 429 aa  43.1  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3121  outer membrane porin  23.12 
 
 		 424 aa  43.1  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3390  porin, putative  26.18 
 
 		 426 aa  43.1  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.808043  normal  0.355784 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>