56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0019 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0019  outer membrane porin  100 
 
 
402 aa  806  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00360128  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0366  outer membrane porin  45.84 
 
 
403 aa  311  1e-83  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  5.02534e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0474  outer membrane porin  43.47 
 
 
407 aa  277  3e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  4.58474e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0469  outer membrane porin  38.95 
 
 
432 aa  248  2e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  5.34788e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0715  outer membrane porin  35.99 
 
 
451 aa  218  2e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0142723  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3627  outer membrane porin  35.18 
 
 
435 aa  204  3e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2207  metalloid reductase RarA  36.78 
 
 
458 aa  177  2e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0734  outer membrane porin  33.33 
 
 
384 aa  153  5e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.536638  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2087  outer membrane porin  30.17 
 
 
452 aa  132  7e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4147  outer membrane porin  28.47 
 
 
407 aa  118  2e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.17719 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0255  outer membrane porin  34.09 
 
 
406 aa  109  8e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4293  outer membrane porin  35.1 
 
 
398 aa  108  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0195017  normal  0.981008 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1540  outer membrane porin  31.25 
 
 
456 aa  79.7  9e-14  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000339272  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0265  hypothetical protein  33.33 
 
 
493 aa  78.6  2e-13  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  unclonable  2.73485e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0137  hypothetical protein  26.35 
 
 
447 aa  77  5e-13  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0760948  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0307  hypothetical protein  31.52 
 
 
280 aa  75.9  1e-12  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  2.84732e-05  decreased coverage  6.57786e-06 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0754  hypothetical protein  29.33 
 
 
260 aa  75.1  2e-12  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1456  hypothetical protein  31.58 
 
 
450 aa  75.1  2e-12  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2788  outer membrane porin  25.28 
 
 
413 aa  67.8  3e-10  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.149615 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3385  outer membrane porin  24.54 
 
 
412 aa  63.2  8e-09  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.228993  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1497  hypothetical protein  25.28 
 
 
442 aa  58.2  2e-07  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.291485  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1215  outer membrane porin  25.28 
 
 
442 aa  58.2  2e-07  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  3.87662e-06  hitchhiker  1.48872e-08 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3175  outer membrane porin  24.14 
 
 
420 aa  57  5e-07  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.442937  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1155  outer membrane porin  24.03 
 
 
413 aa  56.6  7e-07  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.864338  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1206  outer membrane porin  26.96 
 
 
421 aa  52.8  1e-05  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1235  outer membrane porin  26.96 
 
 
421 aa  52.8  1e-05  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188174  normal  0.966 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1991  hypothetical protein  24.21 
 
 
428 aa  51.2  4e-05  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0954759  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1660  outer membrane porin  24.21 
 
 
428 aa  51.2  4e-05  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.133249  normal  0.448938 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0135  hypothetical protein  26.67 
 
 
388 aa  50.1  7e-05  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.881577  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2024  outer membrane porin  25.17 
 
 
417 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.68601  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3656  aromatic compound-specific porin, putative  27.07 
 
 
420 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.755961  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2101  porin  26.34 
 
 
421 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2074  outer membrane porin  26.49 
 
 
420 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.695569  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24790  putative outer membrane porin  25.93 
 
 
421 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2730  outer membrane porin  27.56 
 
 
440 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1059  outer membrane porin  23.3 
 
 
429 aa  47  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2060  outer membrane protein  27.25 
 
 
420 aa  46.6  0.0007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000846705  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1917  hypothetical protein  25.21 
 
 
423 aa  46.6  0.0008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.50266  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2058  outer membrane porin  25.77 
 
 
417 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.536728  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2267  hypothetical protein  26.44 
 
 
409 aa  46.2  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00968313  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3692  outer membrane porin  26.87 
 
 
417 aa  46.2  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.844156  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4009  outer membrane porin  28.87 
 
 
422 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246775  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1577  outer membrane porin  25 
 
 
417 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.107742  normal  0.53028 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5621  putative porin  25 
 
 
417 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37260  putative porin  22.09 
 
 
409 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.618786  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3198  putative porin  22.09 
 
 
409 aa  44.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3682  outer membrane porin  25.28 
 
 
417 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11340  outer membrane porin  26.13 
 
 
428 aa  44.3  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.703793  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3160  outer membrane porin  24.32 
 
 
418 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01240  OprE-like outer membrane porin  26.02 
 
 
440 aa  43.9  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.464345  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4212  outer membrane porin  27.32 
 
 
427 aa  43.5  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.861462  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4878  outer membrane porin  24.1 
 
 
448 aa  43.1  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.477958  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0242  porin  38.64 
 
 
444 aa  43.1  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1419  outer membrane porin  25.29 
 
 
429 aa  43.1  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3390  porin, putative  26.18 
 
 
426 aa  43.1  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.808043  normal  0.355784 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3121  outer membrane porin  23.12 
 
 
424 aa  43.1  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>