More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0016 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0016  chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
357 aa  726    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.760621  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1521  methyl-accepting chemotaxis protein  49.3 
 
 
360 aa  314  1.9999999999999998e-84  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0511  methyl-accepting chemotaxis protein  51.28 
 
 
361 aa  305  1.0000000000000001e-81  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.737393  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0520  GntT protein  52.92 
 
 
306 aa  301  1e-80  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.45 
 
 
720 aa  204  2e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0989  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.12 
 
 
720 aa  196  5.000000000000001e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1032  MCP-domain signal transduction protein  40.82 
 
 
375 aa  196  6e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.60166  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0975  methyl-accepting chemotaxis protein  38.22 
 
 
365 aa  195  9e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.245078  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0498  methyl-accepting chemotaxis protein  40.36 
 
 
365 aa  187  3e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.654005  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0473  methyl-accepting chemotaxis protein  40.36 
 
 
365 aa  187  3e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.614165  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0043  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40 
 
 
421 aa  160  3e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0157  chemotaxis sensory transducer  40 
 
 
447 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0930636  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0921  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.02 
 
 
483 aa  142  6e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0981  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.75 
 
 
635 aa  137  2e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.779847  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1496  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.29 
 
 
632 aa  135  9.999999999999999e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2026  chemotaxis sensory transducer  35.17 
 
 
440 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0367  chemotaxis sensory transducer  41.77 
 
 
483 aa  130  3e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.124323  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1498  methyl-accepting chemotaxis protein  38.54 
 
 
700 aa  125  9e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.756421  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0283  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.12 
 
 
442 aa  125  9e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0447763  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1234  methyl-accepting chemotaxis protein  34.96 
 
 
418 aa  125  1e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1679  methyl-accepting chemotaxis protein  38.05 
 
 
700 aa  124  2e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2497  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.42 
 
 
372 aa  122  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.854874 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1471  DNA processing chain A  48.3 
 
 
651 aa  122  9.999999999999999e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1858  methyl-accepting chemotaxis protein  37.38 
 
 
700 aa  122  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1856  acyl-CoA hydrolase  41.4 
 
 
654 aa  121  1.9999999999999998e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0962  MCP-domain signal transduction protein  46.53 
 
 
458 aa  120  3.9999999999999996e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3394  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.41 
 
 
664 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000171268  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0395  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase (UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanine synthetase)  48.23 
 
 
663 aa  119  6e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1961  putative DNA-binding response regulator  34.67 
 
 
421 aa  119  6e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1957  methyl-accepting chemotaxis protein  48.94 
 
 
654 aa  119  9e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0869  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  47.62 
 
 
649 aa  119  9e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1394  putative 6-pyruvoyl tetrahydrobiopterin synthase (ptps; ptp synthase)  48.94 
 
 
656 aa  118  1.9999999999999998e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1041  methyl-accepting chemotaxis protein  36.99 
 
 
731 aa  118  1.9999999999999998e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.32701  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0819  chemotaxis sensory transducer  39.67 
 
 
627 aa  117  3e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.113637  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1409  methyl-accepting chemotaxis protein  48.23 
 
 
655 aa  117  3.9999999999999997e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0397  methyl-accepting chemotaxis protein  48.23 
 
 
655 aa  117  3.9999999999999997e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1930  chemotaxis sensory transducer  39.67 
 
 
625 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1305  methyl-accepting chemotaxis protein  50.41 
 
 
652 aa  117  3.9999999999999997e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.049405  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1645  methyl-accepting chemotaxis protein  50.41 
 
 
545 aa  116  5e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0567442  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1205  chemotaxis sensory transducer  42.07 
 
 
713 aa  116  6.9999999999999995e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0416  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.33 
 
 
366 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.217637  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0113  chemotaxis sensory transducer  50.38 
 
 
563 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1144  methyl-accepting chemotaxis protein  34.93 
 
 
362 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0190  methyl-accepting chemotaxis protein  50.41 
 
 
657 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.145639  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1854  chemotaxis sensory transducer  45.07 
 
 
536 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1227  methyl-accepting chemotaxis protein  33.59 
 
 
553 aa  114  4.0000000000000004e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2196  methyl-accepting chemotaxis protein  43.04 
 
 
604 aa  113  5e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1205  methyl-accepting chemotaxis protein  39.9 
 
 
459 aa  113  5e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1324  methyl-accepting chemotaxis protein  39.9 
 
 
459 aa  113  5e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0539  methyl-accepting chemotaxis protein  47.01 
 
 
459 aa  112  9e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0793  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.76 
 
 
582 aa  112  9e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.291791 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0112  chemotaxis sensory transducer  48.85 
 
 
563 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1499  MCP-domain signal transduction protein  33.19 
 
 
694 aa  111  2.0000000000000002e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2141  chemotaxis sensory transducer  45.52 
 
 
708 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1698  methyl-accepting chemotaxis protein  50.41 
 
 
653 aa  111  2.0000000000000002e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.130314  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0140  methyl-accepting chemotaxis protein  43.64 
 
 
540 aa  110  3e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1720  methyl-accepting chemotaxis protein  43.64 
 
 
664 aa  110  3e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1915  methyl-accepting chemotaxis protein  43.64 
 
 
653 aa  110  3e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.633585  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0209  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.65 
 
 
658 aa  110  3e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.603066  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1860  chemotaxis sensory transducer  50.94 
 
 
533 aa  110  3e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00521087  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03785  methyl-accepting chemotaxis protein  32.03 
 
 
360 aa  110  3e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0312  methyl-accepting chemotaxis protein  43.64 
 
 
662 aa  110  4.0000000000000004e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0314  methyl-accepting chemotaxis protein  43.64 
 
 
659 aa  110  4.0000000000000004e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0180  methyl-accepting chemotaxis protein  43.64 
 
 
659 aa  110  4.0000000000000004e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1549  methyl-accepting chemotaxis protein  43.64 
 
 
236 aa  110  4.0000000000000004e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00107467  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0185  methyl-accepting chemotaxis protein  50 
 
 
544 aa  110  4.0000000000000004e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000579859  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1307  methyl-accepting chemotaxis protein  70.27 
 
 
596 aa  110  4.0000000000000004e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000917497  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0289  methyl-accepting chemotaxis protein  43.64 
 
 
665 aa  110  5e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1735  methyl-accepting chemotaxis protein  43.64 
 
 
651 aa  110  5e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1931  chemotaxis sensory transducer  43.14 
 
 
621 aa  109  6e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1331  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.44 
 
 
563 aa  109  8.000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.158014  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2319  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.56 
 
 
546 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.217936  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3508  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.75 
 
 
695 aa  108  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2936  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.31 
 
 
362 aa  108  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0821  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.95 
 
 
545 aa  108  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000877148  hitchhiker  0.00000558474 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0968  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.8 
 
 
362 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1826  chemotaxis sensory transducer  47.29 
 
 
650 aa  108  2e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2075  methyl-accepting chemotaxis protein  30.03 
 
 
362 aa  107  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2734  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.43 
 
 
751 aa  107  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3549  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.75 
 
 
393 aa  107  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000818802  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1035  methyl-accepting chemotaxis protein  44.93 
 
 
549 aa  107  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.640997  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3185  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.59 
 
 
360 aa  107  4e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1073  chemotaxis sensory transducer  56.7 
 
 
633 aa  107  4e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00919731  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2177  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.79 
 
 
628 aa  107  4e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1006  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.93 
 
 
362 aa  106  5e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.963071 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2902  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.48 
 
 
479 aa  106  5e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.56843  normal  0.473301 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0982  domain of unknown function DUF1745  51.35 
 
 
666 aa  106  5e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.505903  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1060  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  46.46 
 
 
673 aa  106  6e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1331  MCP-domain signal transduction protein  54.29 
 
 
678 aa  106  7e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3020  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.79 
 
 
697 aa  106  7e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0798  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.73 
 
 
541 aa  106  7e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3465  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.11 
 
 
423 aa  106  7e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3345  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.66 
 
 
542 aa  106  8e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0226154 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3397  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.62 
 
 
362 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1032  methyl-accepting chemotaxis protein  39.61 
 
 
645 aa  105  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1432  chemotaxis sensory transducer  55.67 
 
 
546 aa  105  1e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.138665  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2783  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  52.25 
 
 
439 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1055  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.62 
 
 
362 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0655525  hitchhiker  0.0000230906 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2825  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.89 
 
 
570 aa  105  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000443347 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2526  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  52.25 
 
 
439 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255481  normal  0.0913013 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>