More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0013 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0013  GntR domain protein  100 
 
 		 218 aa  451  1.0000000000000001e-126  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.913161  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3717  transcriptional regulator  44.81 
 
 		 221 aa  180  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.531066  normal  0.297823 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3548  transcriptional regulator  44.81 
 
 		 221 aa  180  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3655  transcriptional regulator  44.81 
 
 		 221 aa  179  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3549  transcriptional regulator  44.81 
 
 		 221 aa  179  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3620  transcriptional regulator  44.81 
 
 		 221 aa  179  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0556349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 234 aa  108  5e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 235 aa  105  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 235 aa  102  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2044  transcriptional regulator, GntR family  30.05 
 
 		 221 aa  102  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000328211  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 211 aa  102  6e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 223 aa  102  6e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3188  GntR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 236 aa  98.2  9e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.804639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4031  GntR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 236 aa  95.9  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4335  GntR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 236 aa  95.9  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 219 aa  95.5  5e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4225  GntR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 236 aa  95.1  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.678492 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3751  GntR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 236 aa  95.1  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  27.4 
 
 		 226 aa  95.1  7e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  28.11 
 
 		 229 aa  95.1  7e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2985  GntR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 248 aa  94.7  8e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  27.57 
 
 		 229 aa  94.4  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4275  GntR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 236 aa  93.6  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.477622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 229 aa  93.6  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  33.16 
 
 		 237 aa  93.2  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6220  GntR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 266 aa  92.4  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 240 aa  92.8  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2339  GntR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 280 aa  92.4  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0860  GntR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 238 aa  92  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2023  transcriptional regulator, GntR family  30.5 
 
 		 251 aa  92  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 226 aa  92.4  5e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0607  GntR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 221 aa  92  6e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0421705  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1038  GntR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 238 aa  92  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1124  GntR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 238 aa  92  7e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4931  GntR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 231 aa  91.7  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.558054  hitchhiker  0.000443766 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0874  GntR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 226 aa  91.7  9e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.366821  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2173  hypothetical protein  37.06 
 
 		 222 aa  91.3  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0421026  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 234 aa  90.9  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3515  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 226 aa  91.3  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.715745  normal  0.6161 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0233  GntR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 219 aa  90.5  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7238  transcriptional regulator GntR family  28.97 
 
 		 224 aa  90.5  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178912  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4086  transcriptional regulator, GntR family  29.69 
 
 		 231 aa  89.7  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 241 aa  89.4  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1701  GntR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 223 aa  89  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0631333  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  27.67 
 
 		 223 aa  89.4  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  32 
 
 		 226 aa  89  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1669  transcriptional regulator, GntR family  32 
 
 		 225 aa  89  5e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.072531  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 233 aa  88.6  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 225 aa  88.6  6e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 255 aa  88.2  9e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  29.52 
 
 		 233 aa  88.2  9e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  28.85 
 
 		 228 aa  87.8  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2160  GntR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 211 aa  88.2  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0507248  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3324  GntR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 229 aa  87.8  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.106017 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1521  GntR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 223 aa  87.8  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000831441  normal  0.527855 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2188  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 224 aa  87.8  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.927637 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7930  transcriptional regulator, GntR family  30.05 
 
 		 221 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 254 aa  87  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0483  transcriptional regulator, GntR family  33.5 
 
 		 227 aa  87  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1528  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 223 aa  87.4  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  27.96 
 
 		 227 aa  87  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 230 aa  87.4  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 227 aa  86.7  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1759  GntR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 223 aa  86.3  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000431204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1588  GntR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 223 aa  86.3  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0421437  normal  0.157754 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4297  transcriptional regulator, GntR family  28.85 
 
 		 232 aa  86.3  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.535178  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1582  GntR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 223 aa  86.7  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00672922  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2447  GntR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 222 aa  85.5  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 229 aa  85.5  5e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0104  GntR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 251 aa  85.5  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.99437  normal  0.215217 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 222 aa  85.9  5e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4095  GntR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 223 aa  85.9  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0137114 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3573  GntR family transcriptional regulator  25.59 
 
 		 237 aa  85.9  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0123  GntR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 251 aa  85.5  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.409483  normal  0.0318508 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0180  transcriptional regulator, GntR family  30.57 
 
 		 217 aa  85.5  5e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  28.02 
 
 		 227 aa  85.5  6e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  28.11 
 
 		 241 aa  85.5  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 235 aa  85.5  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5067  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 226 aa  85.5  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.722709 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0114  GntR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 231 aa  85.1  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3536  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 247 aa  85.1  7e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1711  GntR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 226 aa  85.1  8e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.968918  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3971  GntR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 248 aa  85.1  8e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1461  transcriptional regulator, GntR family  29.81 
 
 		 268 aa  85.1  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 214 aa  85.1  8e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3134  regulatory protein GntR HTH  27.27 
 
 		 238 aa  84.3  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.998254  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3082  GntR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 241 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0349212 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1848  transcriptional regulator, GntR family  28.64 
 
 		 211 aa  84.3  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  29.38 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3140  GntR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 241 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117475 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3891  transcriptional regulator GntR family  28.23 
 
 		 231 aa  83.6  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.556155  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4523  GntR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 217 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1568  transcriptional regulator, GntR family  31.77 
 
 		 219 aa  84  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3571  hypothetical protein  31.6 
 
 		 230 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792294 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3164  GntR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0161984 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 241 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2039  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 211 aa  84  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 212 aa  82.8  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2469  transcriptional regulator, GntR family  29 
 
 		 224 aa  82.8  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>