More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0005 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_00040  DNA gyrase subunit B  47.72 
 
 
806 aa  689  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2054  DNA gyrase subunit B  75.39 
 
 
770 aa  1189  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4272  DNA gyrase subunit B  47.12 
 
 
811 aa  668  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.540261 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4150  DNA gyrase subunit B  48.34 
 
 
804 aa  700  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0128391  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0003  DNA gyrase subunit B  70.44 
 
 
769 aa  1140  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0004  DNA gyrase, B subunit  46.29 
 
 
795 aa  648  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.904157 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0004  DNA gyrase subunit B  48.71 
 
 
803 aa  711  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.428577  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0139  DNA gyrase subunit B  44.86 
 
 
807 aa  658  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837084  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0004  DNA gyrase, B subunit  47.61 
 
 
805 aa  700  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.986187  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0004  DNA gyrase subunit B  47.97 
 
 
806 aa  684  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0004  DNA gyrase, B subunit  46.89 
 
 
807 aa  687  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0620606  hitchhiker  2.88479e-10 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3220  DNA gyrase subunit B  47.53 
 
 
811 aa  671  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0007  DNA gyrase, B subunit  46.34 
 
 
814 aa  673  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  1.27648e-15 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1873  DNA gyrase, B subunit  45.89 
 
 
813 aa  656  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0004  DNA gyrase, B subunit  47.61 
 
 
805 aa  700  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.801274  hitchhiker  0.00617019 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3355  DNA gyrase subunit B  48.38 
 
 
805 aa  677  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.784759 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0095  DNA gyrase, B subunit  46.47 
 
 
814 aa  663  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0142901  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0004  DNA gyrase, B subunit  48.34 
 
 
813 aa  714  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.821769  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0035  DNA gyrase subunit B  48.95 
 
 
804 aa  710  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.373833  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0009  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  47.41 
 
 
813 aa  697  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.983538  hitchhiker  7.05515e-09 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1850  DNA gyrase subunit B  75.55 
 
 
769 aa  1203  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4209  DNA gyrase subunit B  49.38 
 
 
804 aa  716  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00242077  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3912  DNA gyrase subunit B  49.38 
 
 
804 aa  716  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.139583  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00445  DNA gyrase subunit B  48.27 
 
 
805 aa  704  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0005  DNA gyrase subunit B  48.77 
 
 
810 aa  707  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.124529  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03526  hypothetical protein  49.38 
 
 
804 aa  716  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0004  DNA gyrase subunit B  49.75 
 
 
803 aa  718  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0004  DNA gyrase, B subunit  48.83 
 
 
805 aa  713  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.279894  hitchhiker  7.31139e-05 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0003  DNA gyrase subunit B  46.1 
 
 
822 aa  653  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0101  DNA gyrase subunit B  46.1 
 
 
822 aa  653  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0087  DNA gyrase subunit B  46.1 
 
 
822 aa  653  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0004  DNA gyrase, B subunit  47.72 
 
 
805 aa  699  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0004  DNA gyrase subunit B  71.48 
 
 
768 aa  1126  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0782517  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0015  DNA gyrase subunit B  46.86 
 
 
811 aa  664  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2235  DNA gyrase subunit B  46.1 
 
 
822 aa  653  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0003  DNA gyrase subunit B  45.99 
 
 
851 aa  641  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1224  DNA gyrase, B subunit  48.15 
 
 
807 aa  709  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.060887  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0029  DNA gyrase subunit B  70.7 
 
 
769 aa  1146  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.147794  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0006  DNA gyrase subunit B  47.11 
 
 
811 aa  667  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  3.11968e-05 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0004  DNA gyrase subunit B  49.19 
 
 
804 aa  705  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.083955  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0004  DNA gyrase subunit B  49.32 
 
 
805 aa  714  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.777143  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0004  DNA gyrase subunit B  47.7 
 
 
806 aa  684  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.045671  normal  0.178752 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2802  DNA gyrase subunit B  47.13 
 
 
826 aa  691  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0885593 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0121  DNA gyrase subunit B  45.23 
 
 
810 aa  663  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.853058  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0008  DNA gyrase subunit B  46.93 
 
 
812 aa  676  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2886  DNA gyrase, B subunit  45.78 
 
 
812 aa  663  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0004  DNA gyrase, B subunit  48.91 
 
 
794 aa  741  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2504  DNA gyrase subunit B  47.85 
 
 
805 aa  710  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.892795  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0004  DNA gyrase, B subunit  50.25 
 
 
796 aa  740  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.783567 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0004  DNA gyrase subunit B  47.77 
 
 
806 aa  688  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0004  DNA gyrase, B subunit  47.78 
 
 
805 aa  702  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.195183  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2850  DNA gyrase subunit B  46.1 
 
 
822 aa  653  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.60732  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2083  DNA gyrase, B subunit  48.35 
 
 
798 aa  705  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0004  DNA gyrase, B subunit  50.5 
 
 
796 aa  745  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0004  DNA gyrase, B subunit  46.67 
 
 
795 aa  650  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00006  DNA gyrase subunit B  48.59 
 
 
806 aa  733  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00261354  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1622  DNA gyrase, B subunit  48.87 
 
 
786 aa  695  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4047  DNA gyrase subunit B  48.95 
 
 
804 aa  715  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4169  DNA gyrase subunit B  48.95 
 
 
804 aa  715  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.994459  normal  0.269221 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4120  DNA gyrase subunit B  48.95 
 
 
804 aa  715  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0004  DNA gyrase, B subunit  47.82 
 
 
807 aa  699  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0004  DNA gyrase subunit B  47.37 
 
 
813 aa  681  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0004  DNA gyrase, B subunit  50.13 
 
 
802 aa  730  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0013  DNA gyrase subunit B  47.77 
 
 
811 aa  676  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4063  DNA gyrase subunit B  48.95 
 
 
804 aa  716  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.795543  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4227  DNA gyrase subunit B  48.95 
 
 
804 aa  715  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0003  DNA gyrase, B subunit  48.57 
 
 
800 aa  696  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2800  DNA gyrase, B subunit  45.51 
 
 
815 aa  665  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.376674  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0005  DNA gyrase, B subunit  49.32 
 
 
801 aa  707  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0004  DNA gyrase, B subunit  46.92 
 
 
795 aa  649  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1905  DNA gyrase, B subunit  45.6 
 
 
821 aa  672  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.222448 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0004  DNA gyrase, B subunit  47.61 
 
 
805 aa  700  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.405147  hitchhiker  3.01601e-09 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5854  DNA gyrase, B subunit  47.45 
 
 
808 aa  672  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3946  DNA gyrase subunit B  47.77 
 
 
811 aa  673  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.273076  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5127  DNA gyrase subunit B  49.38 
 
 
805 aa  716  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50645  normal  0.271851 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0012  DNA gyrase subunit B  47.46 
 
 
805 aa  699  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.100397  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0004  DNA gyrase, B subunit  48.57 
 
 
801 aa  697  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0231697  decreased coverage  0.000608059 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0964  DNA gyrase, B subunit  46.34 
 
 
812 aa  665  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.780109  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2509  DNA gyrase, B subunit  45.7 
 
 
815 aa  671  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.684538 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0319  DNA gyrase, B subunit  46.06 
 
 
814 aa  681  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0004  DNA gyrase subunit B  48.07 
 
 
806 aa  687  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.727488  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4064  DNA gyrase subunit B  49.26 
 
 
804 aa  715  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0861092  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0004  DNA gyrase subunit B  47.23 
 
 
819 aa  688  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0307059 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0004  DNA gyrase subunit B  49.38 
 
 
804 aa  716  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.873229  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0004  DNA gyrase subunit B  48.34 
 
 
804 aa  700  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0157  DNA gyrase subunit B  47.53 
 
 
830 aa  679  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.374605  normal  0.0722836 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0006  DNA gyrase subunit B  47.95 
 
 
806 aa  682  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2577  DNA gyrase, B subunit  45.51 
 
 
815 aa  665  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0788764  normal  0.769823 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4174  DNA gyrase subunit B  48.34 
 
 
804 aa  700  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.274174  normal  0.0336166 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0005  DNA gyrase, B subunit  48.89 
 
 
808 aa  710  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  6.24797e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0004  DNA gyrase, B subunit  48.28 
 
 
805 aa  702  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.545421  hitchhiker  3.87143e-06 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0003  DNA gyrase subunit B  45.48 
 
 
824 aa  651  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03480  DNA gyrase subunit B  46.16 
 
 
814 aa  657  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0003  DNA gyrase subunit B  45.13 
 
 
823 aa  642  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0806649  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4226  DNA gyrase subunit B  49.38 
 
 
804 aa  714  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.765134  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0005  DNA gyrase, B subunit  44.5 
 
 
825 aa  663  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  1.46448e-06 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0003  DNA gyrase subunit B  45.17 
 
 
823 aa  645  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.211892  hitchhiker  0.00365115 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0819  DNA gyrase, B subunit  46.35 
 
 
817 aa  668  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.829459  normal  0.98352 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0005  DNA gyrase subunit B  46.66 
 
 
814 aa  666  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0003  DNA gyrase subunit B  45.84 
 
 
824 aa  661  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.180708  normal  0.538686 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>