More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0003 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0003  chromosomal replication initiator protein DnaA  100 
 
 
441 aa  897  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00105638  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2056  chromosomal replication initiation protein  66.29 
 
 
436 aa  612  1e-174  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0001  chromosomal replication initiation protein  62.27 
 
 
436 aa  582  1e-165  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.76217  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1853  chromosomal replication initiation protein  62.19 
 
 
436 aa  563  1e-159  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0001  chromosomal replication initiation protein  56.88 
 
 
440 aa  520  1e-146  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0027  chromosomal replication initiation protein  56.21 
 
 
440 aa  516  1e-145  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.984359  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0001  chromosomal replication initiation protein  55.86 
 
 
435 aa  517  1e-145  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0001  chromosomal replication initiation protein  56.43 
 
 
440 aa  517  1e-145  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.879571  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0001  chromosomal replication initiation protein  55.2 
 
 
442 aa  487  1e-136  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  47.95 
 
 
437 aa  420  1e-116  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.11482  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0001  chromosomal replication initiation protein  39.95 
 
 
450 aa  360  3e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0001  chromosomal replication initiation protein  42.22 
 
 
458 aa  350  2e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  3.04436e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0001  chromosomal replication initiation protein  41.92 
 
 
460 aa  350  3e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0001  chromosomal replication initiation protein  39.05 
 
 
450 aa  347  2e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  4.47845e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0001  chromosomal replication initiation protein  42.18 
 
 
449 aa  343  5e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.73 
 
 
454 aa  342  5e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00039195  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0001  chromosomal replication initiation protein  40.09 
 
 
446 aa  342  6e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  3.25337e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0001  chromosomal replication initiation protein  40.36 
 
 
446 aa  340  2e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  1.84902e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0001  chromosomal replication initiation protein  40.36 
 
 
446 aa  340  2e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000594007  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0001  chromosomal replication initiation protein  42.23 
 
 
450 aa  339  5e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0001  chromosomal replication initiation protein  40.13 
 
 
446 aa  339  5e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  4.59109e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0001  chromosomal replication initiation protein  40.13 
 
 
446 aa  339  5e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.63866e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0001  chromosomal replication initiation protein  40.13 
 
 
446 aa  339  5e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  2.44098e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0001  chromosomal replication initiation protein  40.13 
 
 
446 aa  339  5e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  4.25777e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0001  chromosomal replication initiation protein  40.13 
 
 
446 aa  339  5e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0001  chromosomal replication initiation protein  39.91 
 
 
446 aa  338  9e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000585905  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5319  chromosomal replication initiation protein  39.91 
 
 
446 aa  338  1e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.679479  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0001  chromosomal replication initiation protein  40 
 
 
446 aa  338  1e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.562714  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0001  chromosomal replication initiation protein  41.65 
 
 
443 aa  335  8e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00172749  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.29 
 
 
443 aa  334  2e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0001  chromosomal replication initiation protein  39.08 
 
 
457 aa  333  3e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000458864  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0000.1  chromosomal replication initiation protein  40.19 
 
 
445 aa  333  4e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.159401  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0001  chromosomal replication initiation protein  38.86 
 
 
457 aa  332  9e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  5.97417e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.5 
 
 
453 aa  328  1e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  2.08022e-10  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0001  chromosomal replication initiation protein  39.29 
 
 
453 aa  325  1e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  7.95473e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0001  chromosomal replication initiation protein  39.29 
 
 
453 aa  325  1e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.101414  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2553  chromosomal replication initiation protein  38.93 
 
 
451 aa  323  3e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000248403  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.85 
 
 
446 aa  321  2e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  2.08181e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0001  chromosomal replication initiation protein  38.1 
 
 
459 aa  321  2e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  3.86226e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0001  chromosomal replication initiation protein  39.95 
 
 
450 aa  320  4e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  3.22878e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  46.82 
 
 
528 aa  319  6e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.561876  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2371  chromosomal replication initiation protein  40.45 
 
 
443 aa  318  1e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0166544  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0001  initiation of chromosome replication  39.81 
 
 
436 aa  318  1e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0001  chromosomal replication initiation protein  40.96 
 
 
445 aa  317  2e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00343862  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  45.07 
 
 
587 aa  317  3e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  7.18914e-09  hitchhiker  0.000588843 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0001  chromosomal replication initiation protein  38.36 
 
 
441 aa  317  3e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000247534  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  45.07 
 
 
591 aa  317  4e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.000633656  unclonable  2.92755e-08 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.6 
 
 
503 aa  316  4e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  44.9 
 
 
480 aa  315  7e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0001  chromosomal replication initiation protein  40.72 
 
 
452 aa  316  7e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98376e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0008  chromosomal replication initiation protein  37.25 
 
 
460 aa  315  8e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.78 
 
 
444 aa  313  4e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  48.99 
 
 
454 aa  313  4e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  3.31762e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0001  chromosomal replication initiation protein  37.03 
 
 
460 aa  313  4e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  1.79736e-07  unclonable  3.13535e-11 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  46.38 
 
 
721 aa  313  4e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  4.23182e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.58 
 
 
463 aa  313  5e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00536902  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  47.49 
 
 
518 aa  313  5e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.7384  hitchhiker  0.00538334 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0001  chromosomal replication initiation protein  36.42 
 
 
465 aa  313  6e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00156244  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0001  chromosomal replication initiation protein  36.87 
 
 
460 aa  311  1e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  7.24276e-06  unclonable  1.76e-05 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0002  chromosomal replication initiation protein  36.95 
 
 
442 aa  312  1e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0135977  hitchhiker  1.01386e-05 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0009  chromosomal replication initiation protein  36.81 
 
 
460 aa  311  1e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  2.81375e-07  unclonable  6.00935e-11 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.35 
 
 
458 aa  311  2e-83  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0001  chromosomal replication initiation protein  36.21 
 
 
465 aa  311  2e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00429077  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0001  chromosomal replication initiation protein  45.27 
 
 
477 aa  311  2e-83  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0001  chromosomal replication initiation protein  48.06 
 
 
615 aa  311  2e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  unclonable  4.79277e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  47.46 
 
 
527 aa  310  4e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0861644  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.29 
 
 
464 aa  309  5e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00240104  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0001  chromosomal replication initiation protein  38.12 
 
 
460 aa  309  8e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.831436  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.95 
 
 
453 aa  308  1e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.26 
 
 
462 aa  308  1e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.138659  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0032  chromosomal replication initiation protein  37.23 
 
 
463 aa  308  1e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  2.17775e-05  normal  0.251102 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0001  chromosomal replication initiation protein  38.11 
 
 
440 aa  308  1e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  1.18947e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0001  chromosomal replication initiation protein  36.2 
 
 
462 aa  308  2e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  1.57699e-06  unclonable  1.21376e-05 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0001  chromosomal replication initiation protein  43.06 
 
 
478 aa  307  2e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  3.39822e-05  hitchhiker  3.14878e-05 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0001  chromosomal replication initiation protein  36.2 
 
 
462 aa  308  2e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  9.98931e-09  unclonable  3.43779e-12 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0001  chromosomal replication initiation protein  36.2 
 
 
462 aa  308  2e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  5.62887e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0001  DNA replication initiation ATPase- like protein  47.76 
 
 
582 aa  308  2e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  5.23076e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0001  chromosomal replication initiation protein  36.2 
 
 
462 aa  308  2e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  2.57358e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0001  chromosomal replication initiation protein  35.81 
 
 
472 aa  306  3e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  3.68077e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  44.81 
 
 
566 aa  306  4e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  1.50843e-05  normal  0.201816 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0001  chromosomal replication initiation protein  36.07 
 
 
461 aa  306  5e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  1.02323e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.49 
 
 
449 aa  306  5e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.41272e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  45.71 
 
 
461 aa  306  7e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  7.04659e-08  normal  0.0525005 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0001  chromosomal replication initiation protein  36.64 
 
 
462 aa  305  8e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  2.81438e-07  unclonable  1.18337e-08 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.27 
 
 
439 aa  305  9e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00780596  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0001  chromosomal replication initiation protein  36.28 
 
 
461 aa  305  1e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  2.63579e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4177  chromosomal replication initiation protein  36.23 
 
 
462 aa  305  1e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  5.10804e-08  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4153  chromosomal replication initiation protein  36.23 
 
 
462 aa  305  1e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  7.6269e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  46.57 
 
 
570 aa  305  1e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000116219  normal  0.231349 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.02 
 
 
652 aa  304  2e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  5.05913e-06  hitchhiker  0.00770539 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4230  chromosomal replication initiation protein  36.13 
 
 
466 aa  304  2e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00725647  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.29 
 
 
483 aa  303  3e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  3.28329e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0001  chromosomal replication initiation protein  36.28 
 
 
461 aa  304  3e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  5.1e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0013  chromosomal replication initiation protein  36.16 
 
 
457 aa  303  4e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  2.24276e-07  hitchhiker  0.000759559 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0001  chromosomal replication initiation protein  36.49 
 
 
451 aa  303  4e-81  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  1.23931e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4212  chromosomal replication initiation protein  36.05 
 
 
467 aa  303  4e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  2.01887e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0001  chromosomal replication initiation protein  36.49 
 
 
451 aa  303  4e-81  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00187127  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4067  chromosomal replication initiation protein  36.05 
 
 
467 aa  303  4e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  1.02031e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3915  chromosomal replication initiation protein  36.05 
 
 
467 aa  303  4e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.26813e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.25 
 
 
461 aa  303  4e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.926832  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>