99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3920 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3920  helix-turn-helix, AraC type  100 
 
 		 367 aa  743    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.597723 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1507  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  37.3 
 
 		 825 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000204604 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1231  hypothetical protein  31.76 
 
 		 570 aa  76.6  0.0000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  30.5 
 
 		 1363 aa  76.6  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  41.94 
 
 		 947 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1304  protein kinase  35.81 
 
 		 664 aa  75.5  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1279  protein kinase  35.81 
 
 		 664 aa  75.5  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  28.15 
 
 		 1348 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2378  WD-40 repeat protein  32.26 
 
 		 1016 aa  72.8  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2429  WD-40 repeat protein  32.26 
 
 		 1016 aa  72.8  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2703  putative signal transduction protein with Nacht domain  37.36 
 
 		 880 aa  70.1  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3400  putative signal transduction protein with Nacht domain  37.36 
 
 		 880 aa  70.1  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2375  hypothetical protein  33.59 
 
 		 303 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000173875  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4184  sensor protein  33.33 
 
 		 1048 aa  66.6  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00072831 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0066  hypothetical protein  33.63 
 
 		 384 aa  66.2  0.0000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1565  restriction endonuclease  28.78 
 
 		 290 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.380893 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0786  serine/threonine protein kinase, putative  32.12 
 
 		 666 aa  65.5  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  33.86 
 
 		 1656 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  34.95 
 
 		 1373 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517344 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1951  tetratricopeptide TPR_4  28.57 
 
 		 358 aa  63.9  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.202218  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3012  hypothetical protein  29.27 
 
 		 314 aa  63.9  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1258  hypothetical protein  29.1 
 
 		 431 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0255884 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4288  TIR protein  28.46 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2995  Toll-interleukin receptor  28.95 
 
 		 374 aa  62.8  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.462352 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5120  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  36.97 
 
 		 490 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3566  hypothetical protein  27.52 
 
 		 272 aa  59.7  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  26.53 
 
 		 398 aa  59.7  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0746  TIR protein  30 
 
 		 598 aa  58.9  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  34.58 
 
 		 517 aa  58.5  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  25.71 
 
 		 398 aa  57.4  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1939  glycoside hydrolase family 16  31.43 
 
 		 566 aa  56.6  0.0000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000600804  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1486  hypothetical protein  28.57 
 
 		 705 aa  56.6  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4289  hypothetical protein  30.53 
 
 		 137 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2941  hypothetical protein  32.14 
 
 		 286 aa  54.7  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4630  TIR protein  30.61 
 
 		 291 aa  54.3  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.788158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0017  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.08 
 
 		 658 aa  54.3  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0961  WD-40 repeat protein  29.41 
 
 		 1279 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.919157  normal  0.503746 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0055  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  30.65 
 
 		 615 aa  53.9  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6751  WD-40 repeat-containing protein  31.82 
 
 		 540 aa  53.9  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0934  WD-40 repeat protein  29.41 
 
 		 1279 aa  53.9  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0766  hypothetical protein  33.66 
 
 		 290 aa  53.5  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0063  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.47 
 
 		 594 aa  53.1  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0545  hypothetical protein  32.73 
 
 		 969 aa  53.1  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.963711 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3998  hypothetical protein  35.14 
 
 		 478 aa  52.8  0.000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3804  TIR protein  30.51 
 
 		 374 aa  52.4  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.213149  normal  0.0124229 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1625  hypothetical protein  33.59 
 
 		 290 aa  52.4  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2653  TIR protein  39.56 
 
 		 354 aa  52.4  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3066  serine/threonine protein kinase  25.31 
 
 		 598 aa  52.4  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370725  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0104  hypothetical protein  29.82 
 
 		 386 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  35.24 
 
 		 586 aa  52.8  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0667  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.96 
 
 		 652 aa  52.8  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0537547  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3808  PASTA domain-containing protein  28.72 
 
 		 485 aa  51.6  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.309387 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00750  probable pknB serine-threonine protein kinase  31.54 
 
 		 758 aa  51.2  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  29.13 
 
 		 1526 aa  50.8  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0269  hypothetical protein  32 
 
 		 195 aa  50.1  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.108769  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0204  TIR protein  32.41 
 
 		 360 aa  50.1  0.00006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00447425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1639  PASTA domain containing protein  28 
 
 		 501 aa  48.9  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.81867  hitchhiker  0.00180269 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.37 
 
 		 718 aa  48.9  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000581309  hitchhiker  0.000240605 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0031  TIR protein  30.77 
 
 		 544 aa  48.5  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0893  pentapeptide repeat-containing protein  30 
 
 		 357 aa  47.8  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.417756  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0036  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.52 
 
 		 626 aa  47.4  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.202905 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  27.4 
 
 		 911 aa  47.4  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1263  TIR protein  39.39 
 
 		 255 aa  47  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0901664  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0319  TIR protein  27.03 
 
 		 157 aa  47  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0023  hypothetical protein  29.93 
 
 		 320 aa  47  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0986  serine/threonine protein kinase  27.27 
 
 		 612 aa  46.6  0.0006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.640766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1222  pentapeptide repeat protein  33.78 
 
 		 331 aa  46.6  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.154284  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0257  hypothetical protein  35.21 
 
 		 404 aa  46.6  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.32081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  26.39 
 
 		 785 aa  46.6  0.0008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1446  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.68 
 
 		 845 aa  46.6  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0617491  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  26.06 
 
 		 850 aa  46.2  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3107  hypothetical protein  31.18 
 
 		 235 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408395  normal  0.664388 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  30.77 
 
 		 1611 aa  45.8  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1555  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.7 
 
 		 707 aa  46.2  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.556964 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  29.36 
 
 		 625 aa  45.4  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0275  SEFIR domain-containing protein  41.94 
 
 		 290 aa  45.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3409  hypothetical protein  35.29 
 
 		 796 aa  45.4  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.835686  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1337  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  27.06 
 
 		 646 aa  45.4  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00314134 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4186  tetratricopeptide TPR_4  28.87 
 
 		 963 aa  45.4  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  27.96 
 
 		 662 aa  45.8  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1783  TIR protein  28.46 
 
 		 316 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  33.78 
 
 		 441 aa  45.1  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1942  protein of unknown function DUF323  27.27 
 
 		 517 aa  45.1  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00637394  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2632  hypothetical protein  22.92 
 
 		 292 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.801014 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0804  TIR protein  29.17 
 
 		 265 aa  44.7  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.859929  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0019  serine/threonine protein kinase  34.04 
 
 		 582 aa  44.7  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1323  hypothetical protein  33.33 
 
 		 310 aa  43.9  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.165667  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0313  hypothetical protein  27.43 
 
 		 388 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3480  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.35 
 
 		 660 aa  43.9  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.939542  normal  0.0353646 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2742  TIR protein  29.41 
 
 		 320 aa  43.9  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000609469  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3232  protein kinase  30.28 
 
 		 623 aa  43.9  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0785008 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3043  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.26 
 
 		 667 aa  43.9  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.756601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2635  hypothetical protein  30.65 
 
 		 380 aa  43.9  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0162237 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2480  protein of unknown function DUF323  31.3 
 
 		 584 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0025  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.63 
 
 		 668 aa  43.5  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2448  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.03 
 
 		 641 aa  43.5  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0505628 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26990  protein kinase family protein with PASTA domain  29.82 
 
 		 736 aa  43.1  0.008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5434  TIR protein  29.58 
 
 		 413 aa  43.1  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.363832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5590  hypothetical protein  28.26 
 
 		 431 aa  42.7  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>