43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3889 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_3889  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  298  2e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2632  hypothetical protein  37.29 
 
 
142 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000527751  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3918  hypothetical protein  36.84 
 
 
146 aa  77.4  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4032  hypothetical protein  36.84 
 
 
146 aa  77.4  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.188724  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2825  hypothetical protein  32.59 
 
 
145 aa  74.3  0.0000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4023  hypothetical protein  30 
 
 
151 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.792226 
 
 
-
 
NC_003296  RS05215  hypothetical protein  33.03 
 
 
150 aa  67  0.00000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1595  hypothetical protein  27.27 
 
 
170 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619778  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1297  hypothetical protein  31.93 
 
 
168 aa  64.7  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1896  hypothetical protein  31.51 
 
 
151 aa  64.3  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000720474  hitchhiker  0.000884607 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1319  hypothetical protein  29.46 
 
 
152 aa  63.9  0.0000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.271113  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4915  hypothetical protein  29.85 
 
 
135 aa  62  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.226348  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1202  hypothetical protein  30.1 
 
 
172 aa  62  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0422688 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1087  hypothetical protein  30.97 
 
 
157 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1042  hypothetical protein  29.25 
 
 
156 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0670171  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3527  hypothetical protein  29.51 
 
 
151 aa  58.5  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1327  hypothetical protein  44.83 
 
 
162 aa  56.6  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0342  Protein of unknown function DUF2141  31.85 
 
 
149 aa  55.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000000103286  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1321  hypothetical protein  30 
 
 
169 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.239376  hitchhiker  0.00361617 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1243  hypothetical protein  29.69 
 
 
164 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00624627  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1287  hypothetical protein  30 
 
 
169 aa  54.3  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0738123  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4785  hypothetical protein  29.06 
 
 
153 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.719029  normal  0.162174 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1661  hypothetical protein  31.58 
 
 
142 aa  54.3  0.0000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000023194  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5198  hypothetical protein  28.12 
 
 
148 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.169893 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1117  hypothetical protein  26.36 
 
 
179 aa  53.5  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000000000688301  normal  0.70416 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3067  hypothetical protein  29.08 
 
 
164 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0110363  hitchhiker  0.00000000675932 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1194  Protein of unknown function DUF2141  29.82 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1550  hypothetical protein  26.28 
 
 
157 aa  52.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000569387  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3053  hypothetical protein  27.05 
 
 
151 aa  51.6  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2599  hypothetical protein  32.76 
 
 
170 aa  51.2  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.213082  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3039  hypothetical protein  41.07 
 
 
139 aa  51.2  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.112157 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3749  hypothetical protein  30.88 
 
 
142 aa  50.8  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.642558  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3923  hypothetical protein  31.86 
 
 
155 aa  51.2  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1469  hypothetical protein  23.77 
 
 
171 aa  50.4  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0350  hypothetical protein  29.57 
 
 
152 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1620  hypothetical protein  26.13 
 
 
171 aa  49.3  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5037  hypothetical protein  34.85 
 
 
155 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5428  hypothetical protein  30.43 
 
 
159 aa  48.9  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0357  hypothetical protein  29.57 
 
 
152 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.516954  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3440  hypothetical protein  36.23 
 
 
142 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.764522  normal  0.118261 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08966  hypothetical protein  27.54 
 
 
138 aa  46.2  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.520558  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2584  hypothetical protein  27.91 
 
 
155 aa  45.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5639  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3137  hypothetical protein  28.7 
 
 
129 aa  44.7  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.817906 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>