17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3843 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3843  hypothetical protein  100 
 
 		 381 aa  780    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.366486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3132  lipase, class 3  29.77 
 
 		 383 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.95393  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0870  lipase, class 3  30.81 
 
 		 384 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004314  predicted lipase  30 
 
 		 379 aa  138  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1028  hypothetical protein  29.61 
 
 		 641 aa  65.9  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2407  lipase family protein  32.85 
 
 		 357 aa  61.2  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0583209  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0272  lipase, class 3  27.36 
 
 		 266 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0816  lipase, class 3  31.25 
 
 		 726 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.229275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1892  lipase, class 3  30.99 
 
 		 378 aa  52.4  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.184018  hitchhiker  0.008794 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2065  lipase class 3  26.42 
 
 		 324 aa  52.4  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3943  lipase family protein  31.43 
 
 		 539 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0752  lipase class 3  29.19 
 
 		 258 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01560  lipase-related protein  27.56 
 
 		 262 aa  46.2  0.0009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000058  lipase-related protein  30.08 
 
 		 216 aa  45.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.161375  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_10321  predicted protein  30.84 
 
 		 234 aa  44.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000376906  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3485  lipase family protein  30.88 
 
 		 758 aa  43.5  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0992541  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46753  predicted protein  28.83 
 
 		 405 aa  42.7  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00406478  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>