26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3813 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_3813  hypothetical protein  100 
 
 
187 aa  386  1e-106  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00350231  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2693  CBS domain-containing protein  39.44 
 
 
215 aa  150  8e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2459  CBS domain-containing protein  40.45 
 
 
185 aa  138  3.9999999999999997e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03825  CBS domain protein  34.25 
 
 
187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1349  CBS domain-containing protein  35.71 
 
 
186 aa  118  3.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.735809  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3704  signal transduction protein  34.24 
 
 
195 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000122502  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1518  CBS domain-containing protein  33.52 
 
 
186 aa  106  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000300284  hitchhiker  0.000492354 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1244  CBS domain-containing protein  32.26 
 
 
186 aa  105  6e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2237  CBS domain-containing protein  30.48 
 
 
197 aa  94.7  7e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.303434  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0664  hypothetical protein  29.08 
 
 
216 aa  77  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.358372  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0061  CBS domain containing protein  29.03 
 
 
201 aa  61.2  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1720  putative signal-transduction protein with CBS domains  25 
 
 
197 aa  60.8  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.346801 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2062  CBS domain protein  25 
 
 
197 aa  60.8  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.628455  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2035  hypothetical protein  27.06 
 
 
203 aa  56.2  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0102  CBS domain-containing protein  23.84 
 
 
209 aa  55.1  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.653521  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0342  CBS domain containing protein  30.07 
 
 
200 aa  54.7  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.292321  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0454  CBS  27.44 
 
 
218 aa  53.9  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4280  hypothetical protein  38.2 
 
 
251 aa  53.1  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2957  CBS domain-containing protein  27.61 
 
 
196 aa  51.2  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2064  hypothetical protein  26.32 
 
 
195 aa  49.7  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0577346  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1857  CBS domain-containing protein  26.83 
 
 
197 aa  47.8  0.00009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0333  CBS domain-containing protein  26.22 
 
 
197 aa  47.4  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0420  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  31.51 
 
 
487 aa  42  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2628  IMP dehydrogenase family protein  31.31 
 
 
479 aa  42  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146734  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0310  hypothetical protein  29.17 
 
 
284 aa  41.6  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1825  signal-transduction protein  29.56 
 
 
139 aa  41.6  0.007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>