More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3791 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_3791  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  100 
 
 
317 aa  659    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3254  glycosyl transferase, group 2 family protein  42.66 
 
 
314 aa  229  3e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.106646  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1327  hypothetical protein  38.87 
 
 
338 aa  172  5e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0232591  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0830  glycosyl transferase family 2  39.09 
 
 
321 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.0971382 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0343  glycosyl transferase family protein  32.33 
 
 
302 aa  139  6e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00301214  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00155  putative fucosyl transferase  37.09 
 
 
311 aa  133  5e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.749849  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1888  glycosyl transferase family protein  31.1 
 
 
324 aa  125  8.000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.826317  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001770  probable glycosyl transferase  36.68 
 
 
292 aa  125  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0798  glycosyl transferase family protein  35.71 
 
 
316 aa  119  4.9999999999999996e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0913386  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  36.62 
 
 
308 aa  119  9e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  33.62 
 
 
313 aa  117  3e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  33.51 
 
 
289 aa  112  6e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5782  glycosyl transferase family 2  36 
 
 
317 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0633  glycosyl transferase family 2  35.08 
 
 
345 aa  110  3e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.810954  normal  0.460894 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2822  glycosyl transferase family protein  32.34 
 
 
317 aa  109  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  31.96 
 
 
310 aa  108  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  36 
 
 
300 aa  108  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  29.05 
 
 
331 aa  107  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  32.59 
 
 
344 aa  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  35.44 
 
 
314 aa  103  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2010  glycosyl transferase family protein  32.27 
 
 
305 aa  103  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.887395 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  36.96 
 
 
398 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  31.36 
 
 
316 aa  100  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4914  family 2 glycosyl transferase  32.55 
 
 
306 aa  100  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1364  glycosyl transferase family protein  29.28 
 
 
348 aa  100  3e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000343006 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  32.74 
 
 
326 aa  100  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  35.1 
 
 
302 aa  98.2  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1811  glycosyl transferase family protein  33.17 
 
 
294 aa  97.8  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0703738  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  27.13 
 
 
1035 aa  97.4  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  32.2 
 
 
672 aa  97.1  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  32.47 
 
 
324 aa  97.1  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  29.68 
 
 
333 aa  97.1  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  32.29 
 
 
326 aa  96.7  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  31.16 
 
 
1015 aa  96.3  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  31.84 
 
 
326 aa  96.3  7e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  31.71 
 
 
320 aa  95.9  8e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  31.51 
 
 
326 aa  95.9  8e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  35.71 
 
 
386 aa  95.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  31.51 
 
 
326 aa  94.7  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  31.65 
 
 
318 aa  94.4  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  28.33 
 
 
341 aa  94.7  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  36.3 
 
 
1032 aa  94  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  30.77 
 
 
312 aa  94  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  34.07 
 
 
397 aa  94.4  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1381  glycosyl transferase family protein  33.17 
 
 
326 aa  94  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  30.21 
 
 
330 aa  93.2  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0301  glycosyltransferase  33.5 
 
 
309 aa  93.2  6e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.4815  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  29.25 
 
 
333 aa  92.8  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2372  glycosyl transferase family 2  37.5 
 
 
379 aa  93.2  6e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2951  glycosyl transferase family 2  32.96 
 
 
357 aa  92.4  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.788698 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  29.13 
 
 
544 aa  92  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  28.81 
 
 
337 aa  92.4  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  26.96 
 
 
337 aa  91.7  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  30.95 
 
 
310 aa  92.4  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3199  glycosyl transferase family 2  30.56 
 
 
349 aa  91.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  30.26 
 
 
334 aa  92  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  30.34 
 
 
235 aa  91.3  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4074  glycosyl transferase, group 1  31.68 
 
 
773 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0793  glycosyl transferase family 2  32 
 
 
390 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568999  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  30.26 
 
 
322 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  26.38 
 
 
597 aa  90.9  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  31.52 
 
 
344 aa  90.5  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1267  putative glycosyl transferase  30.81 
 
 
300 aa  90.1  4e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  31.28 
 
 
305 aa  90.1  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2017  glycosyl transferase family 2  27.51 
 
 
324 aa  89.4  8e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000864394 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  37.98 
 
 
347 aa  89.4  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2003  glycosyl transferase family 2  39.66 
 
 
230 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2014  glycosyl transferase family protein  40 
 
 
303 aa  88.6  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0488163 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3678  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  29.15 
 
 
466 aa  89  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1566  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
333 aa  89  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12320  glycosyl transferase  41.03 
 
 
343 aa  89  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  24.88 
 
 
299 aa  88.6  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3028  glycosyl transferase family protein  46.94 
 
 
704 aa  88.6  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1962  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.94 
 
 
312 aa  87.8  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0309  glycosyltransferase  30.53 
 
 
318 aa  88.2  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1741  glycosyl transferase family 2  31.84 
 
 
275 aa  88.2  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.675758 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  40.71 
 
 
321 aa  87  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  31.47 
 
 
268 aa  87  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  32.02 
 
 
334 aa  86.3  6e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  32.34 
 
 
330 aa  86.3  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2006  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
351 aa  86.3  7e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0755344 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  42.57 
 
 
390 aa  85.9  8e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3362  glycosyl transferase family 2  36.03 
 
 
235 aa  85.9  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0060739  normal  0.350588 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1092  glycosyl transferase family protein  30.52 
 
 
315 aa  85.9  8e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.221871  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3355  glycosyl transferase family 2  46 
 
 
233 aa  85.9  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1309  glycosyl transferase family 2  39.05 
 
 
272 aa  85.5  9e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2024  glycosyl transferase family 2  29.39 
 
 
333 aa  85.9  9e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00394379 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1727  glycosyl transferase family 2  31.53 
 
 
689 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.158076 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1059  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  41.23 
 
 
326 aa  85.1  0.000000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.113475  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3834  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.91 
 
 
327 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000153474  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3305  glycosyl transferase family protein  46.53 
 
 
342 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.240811 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03431  hypothetical protein  31.55 
 
 
327 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1979  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.55 
 
 
327 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  43.43 
 
 
374 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  41.41 
 
 
318 aa  84.3  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3933  glycosyl transferase, group 2 family protein  46 
 
 
329 aa  85.1  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0430  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  28.95 
 
 
642 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0086  glycosyl transferase family protein  40.91 
 
 
327 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142969  normal  0.0610644 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0938  glycosyl transferase family protein  33.06 
 
 
317 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  31.63 
 
 
276 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>