More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3725 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3359  Acyl transferase  33.36 
 
 
2220 aa  655    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  36.96 
 
 
2333 aa  851    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3921  Beta-ketoacyl synthase-like protein  36.54 
 
 
2499 aa  695    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.802024 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2384  amino acid adenylation domain protein  29.29 
 
 
2508 aa  704    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  34.71 
 
 
1867 aa  655    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31 
 
 
1816 aa  655    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  34.36 
 
 
4151 aa  651    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  36.15 
 
 
4968 aa  662    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1146  Beta-ketoacyl synthase  35.6 
 
 
2556 aa  653    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1509  KR domain protein  34.47 
 
 
2507 aa  686    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3010  polyketide synthase, type I, putative  35.06 
 
 
2486 aa  682    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.55 
 
 
7110 aa  714    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  32.89 
 
 
2462 aa  844    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2289  type I polyketide synthase WcbR  36.52 
 
 
2546 aa  653    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  30.42 
 
 
7210 aa  671    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  35.46 
 
 
3930 aa  666    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4286  6-deoxyerythronolide-B synthase  32.58 
 
 
1822 aa  864    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  34.08 
 
 
1349 aa  647    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2972  6-deoxyerythronolide-B synthase  34.79 
 
 
2136 aa  682    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118653 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2600  Beta-ketoacyl synthase  36.46 
 
 
2543 aa  690    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1541  Beta-ketoacyl synthase  36.11 
 
 
2547 aa  706    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2617  Beta-ketoacyl synthase  35.06 
 
 
2486 aa  682    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  34.08 
 
 
2791 aa  674    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  35.78 
 
 
3308 aa  653    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1322  6-deoxyerythronolide-B synthase  39.17 
 
 
1804 aa  1334    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000693596 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.98 
 
 
1874 aa  907    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  41.26 
 
 
1656 aa  679    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2378  amino acid adenylation domain protein  26.13 
 
 
3695 aa  697    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4742  Beta-ketoacyl synthase  44.08 
 
 
1144 aa  754    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  38.7 
 
 
1587 aa  645    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3286  capsular polysaccharide biosynthesis fatty acid synthase  36.32 
 
 
2546 aa  655    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2407  amino acid adenylation domain-containing protein  55.89 
 
 
3101 aa  3514    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.195315 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  33.87 
 
 
1939 aa  1016    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1010  KR domain-containing protein  33.04 
 
 
2604 aa  659    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1186  Acyl transferase  34.22 
 
 
2225 aa  781    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  37.13 
 
 
2232 aa  909    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1965  amino acid adenylation domain-containing protein  31.33 
 
 
2439 aa  833    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.229236 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3873  Beta-ketoacyl synthase  37.76 
 
 
2545 aa  668    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5757  amino acid adenylation domain protein  36.19 
 
 
2997 aa  694    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1341  putative type I polyketide synthase WcbR  37.68 
 
 
2543 aa  660    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3725  polyketide synthase modules and related proteins-like  100 
 
 
3111 aa  6465    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.816556 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0299  beta-ketoacyl synthase  35.34 
 
 
2544 aa  672    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2957  amino acid adenylation domain protein  30.61 
 
 
4882 aa  1113    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.221364 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0751  Beta-ketoacyl synthase  35.82 
 
 
2545 aa  676    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  34.02 
 
 
1349 aa  649    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  34.7 
 
 
2551 aa  719    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3821  beta-ketoacyl synthase  30.51 
 
 
1909 aa  819    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0798  amino acid adenylation domain protein  35.32 
 
 
4183 aa  683    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2873  bacitracin synthetase 1  35.87 
 
 
4960 aa  657    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3972  amino acid adenylation domain-containing protein  37.72 
 
 
1126 aa  671    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.47287  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1008  Beta-ketoacyl synthase  34.41 
 
 
1832 aa  971    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12948  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsD  30.74 
 
 
1827 aa  685    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.413378  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1748  amino acid adenylation domain protein  36.46 
 
 
7712 aa  738    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.970061 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0782  beta-ketoacyl synthase  35.34 
 
 
2544 aa  672    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0496  Acyl transferase  30 
 
 
2090 aa  674    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456019  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  32.12 
 
 
3676 aa  639    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2463  bacitracin synthetase 1  36.06 
 
 
4960 aa  659    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  31.25 
 
 
3696 aa  645    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1173  KR domain protein  31.37 
 
 
1966 aa  864    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1182  Acyl transferase  32.82 
 
 
2890 aa  888    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  37.12 
 
 
3176 aa  729    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  34.87 
 
 
3508 aa  683    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0539  type I polyketide synthase WcbR  36.32 
 
 
2546 aa  654    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  30.86 
 
 
3711 aa  674    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1061  type I polyketide synthase WcbR  36.32 
 
 
2546 aa  654    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.5 
 
 
5400 aa  649    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3235  type I polyketide synthase WcbR  36.03 
 
 
2546 aa  650    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.606406  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  35.41 
 
 
2230 aa  842    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3271  type I polyketide synthase WcbR  36.24 
 
 
2546 aa  654    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  31.29 
 
 
3449 aa  781    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2968  6-deoxyerythronolide-B synthase  32.29 
 
 
1909 aa  790    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00185411 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  31.43 
 
 
3645 aa  788    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  38.72 
 
 
1087 aa  658    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2166  type I polyketide synthase WcbR  36.32 
 
 
2546 aa  654    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  31.73 
 
 
3679 aa  642    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  35.36 
 
 
5255 aa  635  1e-180  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  35.4 
 
 
2033 aa  635  1e-180  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.53 
 
 
2551 aa  632  1e-179  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12954  multi-functional membrane-associated mycocerosic acid synthase mas  31.54 
 
 
2111 aa  632  1e-179  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  32.35 
 
 
3291 aa  630  1e-178  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  30.83 
 
 
3693 aa  627  1e-178  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3027  amino acid adenylation domain protein  33.13 
 
 
3086 aa  629  1e-178  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  30.83 
 
 
3693 aa  627  1e-178  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3094  amino acid adenylation domain protein  32.39 
 
 
3086 aa  628  1e-178  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.54199 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3129  amino acid adenylation domain-containing protein  33.19 
 
 
1816 aa  626  1e-177  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.975665  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1861  amino acid adenylation domain protein  34.66 
 
 
2571 aa  624  1e-177  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  30.83 
 
 
3702 aa  625  1e-177  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1835  amino acid adenylation domain protein  34.66 
 
 
2571 aa  624  1e-176  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  34.66 
 
 
9498 aa  624  1e-176  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11205  polyketide beta-ketoacyl synthase pks4  30.83 
 
 
2101 aa  624  1e-176  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  33.87 
 
 
4080 aa  623  1e-176  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  32.9 
 
 
3408 aa  621  1e-176  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3973  amino acid adenylation domain-containing protein  33.36 
 
 
6661 aa  617  1e-175  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7002  Acyl transferase  33.89 
 
 
1820 aa  618  1e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.132445 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  33.77 
 
 
2126 aa  620  1e-175  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  34.15 
 
 
3158 aa  618  1e-175  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  34.69 
 
 
2966 aa  620  1e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0980  amino acid adenylation domain protein  31.85 
 
 
2193 aa  616  9.999999999999999e-175  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  32.98 
 
 
1789 aa  614  9.999999999999999e-175  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4135  Acyl transferase  32.62 
 
 
2108 aa  616  9.999999999999999e-175  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>