More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3717 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03509  ATP-dependent DNA helicase  55.8 
 
 
693 aa  721    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0053  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.65 
 
 
693 aa  719    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3884  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.73 
 
 
696 aa  733    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4103  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.8 
 
 
693 aa  723    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5310  ATP-dependent DNA helicase RecG  58.18 
 
 
692 aa  785    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0627539 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3863  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.09 
 
 
693 aa  724    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2025  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.47 
 
 
691 aa  660    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4156  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.8 
 
 
693 aa  723    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3183  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.48 
 
 
686 aa  746    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5219  ATP-dependent DNA helicase RecG  58.18 
 
 
692 aa  786    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.220014  normal  0.443316 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4976  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.9 
 
 
697 aa  733    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6122  ATP-dependent DNA helicase RecG  60.29 
 
 
691 aa  795    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4364  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.56 
 
 
688 aa  711    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0065  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.68 
 
 
691 aa  770    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4397  ATP-dependent DNA helicase RecG  59.71 
 
 
691 aa  790    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.338064 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4496  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.41 
 
 
693 aa  735    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0411  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.58 
 
 
704 aa  719    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000341612  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2010  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.9 
 
 
687 aa  646    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.38589  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2015  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.47 
 
 
690 aa  690    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2010  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.73 
 
 
690 aa  681    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0201  ATP-dependent DNA helicase RecG  58.12 
 
 
691 aa  777    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4070  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.38 
 
 
693 aa  728    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.75743 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4131  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.38 
 
 
693 aa  729    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.193478  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4180  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.94 
 
 
693 aa  729    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5025  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.94 
 
 
693 aa  724    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48450  ATP-dependent DNA helicase RecG  61.01 
 
 
691 aa  815    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0037  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.8 
 
 
693 aa  727    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4213  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.12 
 
 
693 aa  729    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1216  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.32 
 
 
712 aa  715    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.999568  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5559  ATP-dependent DNA helicase RecG  59.13 
 
 
691 aa  798    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0351  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.01 
 
 
696 aa  744    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4024  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.09 
 
 
693 aa  724    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00625  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.35 
 
 
693 aa  730    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0967  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.14 
 
 
691 aa  676    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.309793  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0163  ATP-dependent DNA helicase RecG  58.61 
 
 
692 aa  787    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0916873  normal  0.148249 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02362  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.99 
 
 
717 aa  650    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2153  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.43 
 
 
690 aa  690    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2283  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.77 
 
 
692 aa  701    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0087  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.49 
 
 
693 aa  705    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4871  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.52 
 
 
693 aa  733    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.708486  normal  0.0162728 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0640  ATP-dependent DNA helicase RecG  58.26 
 
 
691 aa  795    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0354  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.91 
 
 
691 aa  741    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000206115 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0450  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.3 
 
 
696 aa  748    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0344  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.87 
 
 
696 aa  743    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03461  hypothetical protein  55.8 
 
 
693 aa  721    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5358  ATP-dependent DNA helicase RecG  58.32 
 
 
692 aa  801    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419369  normal  0.636559 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00158  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.51 
 
 
690 aa  746    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3717  ATP-dependent DNA helicase RecG  100 
 
 
695 aa  1423    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0052  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.03 
 
 
686 aa  659    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3952  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.38 
 
 
693 aa  729    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0647882 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3476  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.2 
 
 
691 aa  725    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4592  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.07 
 
 
691 aa  741    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000346665 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3245  ATP-dependent DNA helicase RecG  58.84 
 
 
697 aa  774    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3256  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.09 
 
 
703 aa  676    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.481232  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3961  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.09 
 
 
693 aa  729    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3987  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.51 
 
 
693 aa  717    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0041  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.94 
 
 
693 aa  729    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3375  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.75 
 
 
691 aa  736    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0353  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.94 
 
 
691 aa  771    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001866  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.35 
 
 
689 aa  726    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0346  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.87 
 
 
696 aa  742    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3507  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.48 
 
 
691 aa  728    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1454  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.32 
 
 
693 aa  722    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.858115  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3952  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.98 
 
 
693 aa  727    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0354  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.72 
 
 
696 aa  714    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3672  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.44 
 
 
696 aa  713    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0149204  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2440  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.01 
 
 
705 aa  707    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.446021  normal  0.13154 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0356  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.07 
 
 
705 aa  719    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0329  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.92 
 
 
691 aa  750    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0231565 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70570  ATP-dependent DNA helicase RecG  60 
 
 
691 aa  792    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0059  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.09 
 
 
693 aa  724    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000405191 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3492  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.7 
 
 
690 aa  749    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000503881 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1776  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.58 
 
 
704 aa  719    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00133724  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4149  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.39 
 
 
693 aa  721    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0348  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.44 
 
 
696 aa  713    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0310483  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4390  ATP-dependent DNA helicase RecG  58.93 
 
 
693 aa  811    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2910  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.75 
 
 
693 aa  731    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2338  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.28 
 
 
747 aa  633  1e-180  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0761129 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2806  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.95 
 
 
728 aa  630  1e-179  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1872  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.36 
 
 
718 aa  627  1e-178  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1798  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.21 
 
 
718 aa  627  1e-178  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0822  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.44 
 
 
684 aa  624  1e-177  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2942  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.22 
 
 
737 aa  622  1e-177  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0112  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.62 
 
 
699 aa  624  1e-177  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2955  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.93 
 
 
715 aa  617  1e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.741369  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0356  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.29 
 
 
683 aa  617  1e-175  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.000000133204 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0614  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.36 
 
 
785 aa  615  1e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0697  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.3 
 
 
832 aa  618  1e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3988  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.81 
 
 
768 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0639  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.36 
 
 
792 aa  609  1e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3812  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.64 
 
 
777 aa  610  1e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0884  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.08 
 
 
692 aa  611  1e-173  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1280  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.8 
 
 
859 aa  610  1e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2545  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.78 
 
 
715 aa  612  1e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.419698  normal  0.139865 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0124  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.07 
 
 
692 aa  610  1e-173  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.336008  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3325  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.58 
 
 
902 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.97169  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0306  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.8 
 
 
902 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2575  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.8 
 
 
902 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0724  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.22 
 
 
771 aa  608  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3359  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.8 
 
 
902 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>