More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3611 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3611  homoserine O-acetyltransferase  100 
 
 		 699 aa  1414    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000219924  decreased coverage  0.00028675 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3776  TonB-dependent siderophore receptor  61.08 
 
 		 707 aa  814    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.658574  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0531  TonB-dependent siderophore receptor  42.57 
 
 		 702 aa  532  1e-149  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3500  TonB-dependent siderophore receptor  42.57 
 
 		 702 aa  532  1e-149  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  42.86 
 
 		 724 aa  512  1e-144  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2950  TonB-dependent siderophore receptor  41.18 
 
 		 720 aa  510  1e-143  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  42.86 
 
 		 724 aa  511  1e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  41.97 
 
 		 723 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3329  TonB-dependent siderophore receptor  40.83 
 
 		 720 aa  502  1e-141  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3287  TonB-dependent siderophore receptor  40.97 
 
 		 720 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1156  TonB-dependent receptor  42.07 
 
 		 715 aa  500  1e-140  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2881  TonB-dependent siderophore receptor  40.61 
 
 		 714 aa  501  1e-140  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1080  TonB-dependent siderophore receptor  40.68 
 
 		 720 aa  496  1e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210628 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3465  TonB-dependent siderophore receptor  40.68 
 
 		 720 aa  497  1e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.47616  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01528  TonB-dependent receptor  37.08 
 
 		 720 aa  446  1.0000000000000001e-124  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  37.89 
 
 		 712 aa  427  1e-118  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04088  TonB-dependent outer membrane Receptor  37.13 
 
 		 713 aa  411  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  35.21 
 
 		 722 aa  403  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  36.1 
 
 		 701 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  35.96 
 
 		 701 aa  399  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  35.75 
 
 		 701 aa  398  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  35.79 
 
 		 757 aa  390  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6494  TonB-dependent siderophore receptor  35.53 
 
 		 701 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6729  TonB-dependent siderophore receptor  35.53 
 
 		 701 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684633  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  36.63 
 
 		 689 aa  387  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6317  TonB-dependent siderophore receptor  35.25 
 
 		 701 aa  388  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585153  normal  0.21494 
 
 
-
 
NC_003296  RS03023  putative ferrisiderophore receptor protein  35.33 
 
 		 703 aa  382  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.269425 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  36.08 
 
 		 696 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  35.46 
 
 		 722 aa  379  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  35.79 
 
 		 696 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  33.75 
 
 		 701 aa  360  5e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  34.84 
 
 		 708 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  34.84 
 
 		 703 aa  353  8e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  34.12 
 
 		 709 aa  353  8.999999999999999e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  34.59 
 
 		 710 aa  350  6e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 701 aa  336  7.999999999999999e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  33.72 
 
 		 703 aa  333  5e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  33.97 
 
 		 692 aa  333  7.000000000000001e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  33.24 
 
 		 703 aa  328  3e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  31.42 
 
 		 708 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  31.79 
 
 		 741 aa  303  7.000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  31.24 
 
 		 710 aa  295  2e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  31.39 
 
 		 734 aa  294  3e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8274  TonB-dependent siderophore receptor  32.59 
 
 		 715 aa  294  4e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  31.8 
 
 		 710 aa  293  7e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  30.1 
 
 		 711 aa  293  7e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  30.4 
 
 		 708 aa  292  1e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4886  TonB-dependent siderophore receptor  32.14 
 
 		 730 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.928986 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  30.66 
 
 		 711 aa  283  8.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  31.75 
 
 		 732 aa  282  1e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5875  TonB-dependent siderophore receptor  32.53 
 
 		 689 aa  282  2e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18447 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  29.37 
 
 		 709 aa  282  2e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  31.63 
 
 		 738 aa  281  2e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  32.1 
 
 		 714 aa  281  4e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3406  TonB-dependent siderophore receptor  31.63 
 
 		 722 aa  277  4e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.155193  decreased coverage  0.0000340201 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  30.89 
 
 		 736 aa  270  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  31.47 
 
 		 850 aa  265  1e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4225  TonB-dependent siderophore receptor  31.26 
 
 		 689 aa  263  1e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  31.94 
 
 		 815 aa  248  3e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  29.27 
 
 		 707 aa  245  1.9999999999999999e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  31.73 
 
 		 825 aa  239  9e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  31.58 
 
 		 825 aa  238  3e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  31.42 
 
 		 837 aa  236  7e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1443  TonB-dependent siderophore receptor  27.97 
 
 		 743 aa  229  9e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281605  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  30.96 
 
 		 859 aa  228  3e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0150  TonB-dependent siderophore receptor  29.42 
 
 		 843 aa  227  5.0000000000000005e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13947  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  28.89 
 
 		 721 aa  227  6e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4588  TonB-dependent siderophore receptor  30.03 
 
 		 796 aa  226  9e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0858  TonB-dependent siderophore receptor  29.38 
 
 		 796 aa  226  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4504  TonB-dependent siderophore receptor  28.53 
 
 		 858 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198405  normal  0.487097 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4465  TonB-dependent siderophore receptor  28.55 
 
 		 796 aa  223  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0931  TonB-dependent siderophore receptor  28.87 
 
 		 809 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5579  TonB-dependent siderophore receptor  28.98 
 
 		 812 aa  222  1.9999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.761851 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01870  putative TonB-dependent receptor  29.63 
 
 		 795 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.554245 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0229  putative TonB-dependent receptor  30.09 
 
 		 795 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6052  putative TonB-dependent siderophore receptor  29.6 
 
 		 766 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0815  TonB-dependent siderophore receptor  27.81 
 
 		 714 aa  221  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0815  TonB-dependent siderophore receptor  27.81 
 
 		 714 aa  221  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806497  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  30.17 
 
 		 860 aa  221  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4606  TonB-dependent siderophore receptor  29.29 
 
 		 796 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4239  TonB-dependent siderophore receptor  29.62 
 
 		 781 aa  219  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.475083 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4917  TonB-dependent siderophore receptor  30.03 
 
 		 778 aa  217  7e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.705684  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0155  TonB-dependent siderophore receptor  27.97 
 
 		 677 aa  216  9.999999999999999e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000133249 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1126  TonB-dependent siderophore receptor  30.04 
 
 		 708 aa  216  9.999999999999999e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.984983  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3324  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  28 
 
 		 713 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.992566  normal  0.497085 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4343  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  28.14 
 
 		 713 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0879  TonB-dependent siderophore receptor  28.24 
 
 		 855 aa  213  9e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.136442  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1361  TonB-dependent siderophore receptor  28.24 
 
 		 855 aa  213  9e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.586931  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1933  TonB-dependent siderophore receptor  27.99 
 
 		 863 aa  213  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57776  hitchhiker  0.00557515 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  29.38 
 
 		 817 aa  210  7e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1381  TonB-dependent siderophore receptor  29.09 
 
 		 742 aa  210  9e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00176773  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1057  TonB-dependent siderophore receptor  29.19 
 
 		 719 aa  208  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  29.53 
 
 		 829 aa  206  9e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0391  TonB-dependent siderophore receptor  28.08 
 
 		 712 aa  205  2e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.196206  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3442  TonB-dependent siderophore receptor  28.12 
 
 		 713 aa  204  3e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.827795  normal  0.101631 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0020  TonB-dependent siderophore receptor  29.09 
 
 		 881 aa  204  5e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.655193  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1422  TonB-dependent siderophore receptor  29.09 
 
 		 881 aa  204  5e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0458  TonB-dependent siderophore receptor  28.21 
 
 		 705 aa  203  8e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1509  TonB-dependent siderophore receptor  29.09 
 
 		 882 aa  203  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826442  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  28.06 
 
 		 862 aa  202  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>