37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3508 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3508  resolvase, RNase H-like fold  100 
 
 		 217 aa  441  1e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2417  hypothetical protein  33.33 
 
 		 204 aa  97.8  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0242841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0404  hypothetical protein  28.57 
 
 		 203 aa  82  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0364  putative lipoprotein  30.51 
 
 		 201 aa  80.1  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.14709  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2634  hypothetical protein  30.25 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4087  hypothetical protein  27.22 
 
 		 188 aa  69.3  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00226644  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0230  hypothetical protein  25.88 
 
 		 241 aa  68.9  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0041  protein of unknown function DUF330  31.65 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0231  hypothetical protein  25 
 
 		 241 aa  67.8  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0667  hypothetical protein  31.21 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0652  hypothetical protein  27.85 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.049729  normal  0.69496 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3241  protein of unknown function DUF330  26.74 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0327  protein of unknown function DUF330  25.19 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0256  hypothetical protein  27.86 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1569  hypothetical protein  31.03 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.849012  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02852  hypothetical protein  26.2 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3139  hypothetical protein  26.16 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.260987  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2220  protein of unknown function DUF330  25.77 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000082506 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5507  hypothetical protein  25.56 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1055  protein of unknown function DUF330  27.82 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2001  protein of unknown function DUF330  27.52 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.142199  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1959  hypothetical protein  27.34 
 
 		 199 aa  52.8  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000996139  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44160  hypothetical protein  23.62 
 
 		 192 aa  47.4  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.266274  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5692  hypothetical protein  25.93 
 
 		 236 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0367  hypothetical protein  29.88 
 
 		 182 aa  46.6  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4854  hypothetical protein  29.88 
 
 		 182 aa  46.6  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000642046 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003027  putative lipoprotein  23.16 
 
 		 192 aa  46.2  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6349  hypothetical protein  26.29 
 
 		 225 aa  46.2  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.238642  normal  0.295075 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1921  hypothetical protein  31.25 
 
 		 199 aa  45.8  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0041  putative lipoprotein  29.59 
 
 		 206 aa  44.3  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.240026  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65590  hypothetical protein  25.4 
 
 		 236 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1866  hypothetical protein  29.79 
 
 		 197 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.235297 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0504  hypothetical protein  24.67 
 
 		 237 aa  43.1  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0320775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1747  hypothetical protein  26.83 
 
 		 185 aa  42.7  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00777543  decreased coverage  0.000000370009 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2112  hypothetical protein  29.08 
 
 		 197 aa  42.7  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.178277  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1982  putative lipoprotein  24.63 
 
 		 195 aa  42.4  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0024934  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2448  hypothetical protein  26.11 
 
 		 201 aa  41.6  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.136482  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>