26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3506 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3506  hypothetical protein  100 
 
 		 209 aa  431  1e-120  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.906839 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0387  hypothetical protein  50 
 
 		 212 aa  211  5.999999999999999e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2587  hypothetical protein  49.74 
 
 		 204 aa  207  1e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2009  hypothetical protein  47.74 
 
 		 200 aa  204  6e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.567228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2490  hypothetical protein  48.21 
 
 		 204 aa  202  3e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.144778  normal  0.0598589 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3661  hypothetical protein  47.4 
 
 		 231 aa  187  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0598103  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0569  hypothetical protein  46.23 
 
 		 210 aa  185  3e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8251  hypothetical protein  45.18 
 
 		 210 aa  185  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0194223 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2147  hypothetical protein  45.18 
 
 		 205 aa  182  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2876  hypothetical protein  44.56 
 
 		 210 aa  180  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5475  hypothetical protein  42.71 
 
 		 223 aa  175  4e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.156291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5096  hypothetical protein  41.46 
 
 		 223 aa  175  5e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0823672  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1102  hypothetical protein  44.1 
 
 		 224 aa  175  5e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5184  hypothetical protein  41.46 
 
 		 223 aa  175  5e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.858071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3869  hypothetical protein  44.06 
 
 		 233 aa  174  9e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3597  hypothetical protein  45.41 
 
 		 235 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2796  hypothetical protein  44.1 
 
 		 222 aa  171  7.999999999999999e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.551909  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5715  hypothetical protein  43.01 
 
 		 227 aa  169  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0013  hypothetical protein  43.92 
 
 		 190 aa  166  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0009  hypothetical protein  42.64 
 
 		 205 aa  159  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.198242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0492  hypothetical protein  41.24 
 
 		 267 aa  131  6e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1944  putative methyltransferase  23.88 
 
 		 243 aa  49.7  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.197915  hitchhiker  0.0000642802 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0148  hypothetical protein  27.14 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.434014 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0289  hypothetical protein  25.33 
 
 		 239 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.159555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2745  hypothetical protein  23.12 
 
 		 378 aa  44.3  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0205  hypothetical protein  25.9 
 
 		 222 aa  43.9  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.314754 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>