More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3383 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3383  ferrous iron transport protein B  100 
 
 		 683 aa  1384    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.378196 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0654  ferrous iron transport protein B  41.94 
 
 		 693 aa  526  1e-148  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0754  ferrous iron transport protein B  40.81 
 
 		 786 aa  520  1e-146  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0018483  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0648  ferrous iron transport protein B  37.89 
 
 		 727 aa  508  9.999999999999999e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004103  ferrous iron transport protein B  39.58 
 
 		 758 aa  496  1e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2517  ferrous iron transport protein B  37.17 
 
 		 764 aa  480  1e-134  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.487661  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2584  ferrous iron transporter B  38.1 
 
 		 751 aa  481  1e-134  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2258  ferrous iron transport protein FeoB  37.57 
 
 		 758 aa  477  1e-133  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.694686  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2711  ferrous iron transporter B  37.64 
 
 		 751 aa  477  1e-133  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2504  ferrous iron transport protein B  37.48 
 
 		 764 aa  478  1e-133  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00112841  hitchhiker  0.00221536 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2572  ferrous iron transport protein B  37.35 
 
 		 764 aa  475  1e-132  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.148151  normal  0.0102392 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3855  hypothetical protein  45.24 
 
 		 776 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.107886  normal  0.584174 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3822  ferrous iron transport protein B  38.78 
 
 		 772 aa  470  1.0000000000000001e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.848053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2690  ferrous iron transport protein B  36.83 
 
 		 764 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.878145  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1532  ferrous iron transport protein B  37.81 
 
 		 764 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3122  ferrous iron transport protein B  36.97 
 
 		 764 aa  462  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000440223 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1841  ferrous iron transport protein B  37.52 
 
 		 769 aa  464  1e-129  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.547404  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2414  ferrous iron transport protein B  38.02 
 
 		 772 aa  464  1e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.331306  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2616  ferrous iron transport protein B  36.03 
 
 		 770 aa  463  1e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1784  ferrous iron transport protein B  37.78 
 
 		 764 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1584  ferrous iron transport protein B  37.45 
 
 		 764 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000129381  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2071  ferrous iron transport protein B  47.59 
 
 		 774 aa  460  9.999999999999999e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1618  ferrous iron transport protein B  37.91 
 
 		 764 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00477082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2670  ferrous iron transport protein B  37.84 
 
 		 764 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.360786  normal  0.0737302 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1595  ferrous iron transport protein B  37.71 
 
 		 764 aa  462  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000195581  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2759  ferrous iron transport protein B  37.32 
 
 		 764 aa  457  1e-127  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383541  hitchhiker  0.00159456 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1481  ferrous iron transport protein B  37.4 
 
 		 764 aa  456  1e-127  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.725722  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01364  hypothetical protein  45.65 
 
 		 758 aa  455  1.0000000000000001e-126  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1933  ferrous iron transport protein B  45.95 
 
 		 774 aa  455  1.0000000000000001e-126  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.651093  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0321  ferrous iron transport protein B  46.94 
 
 		 751 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.397467  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0465  ferrous iron transport protein B  46.89 
 
 		 770 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2470  ferrous iron transport protein B  45.61 
 
 		 786 aa  442  1e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1818  Fe2+ transport system protein B  47.39 
 
 		 770 aa  442  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.375819  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0623  ferrous iron transport protein B  45.42 
 
 		 783 aa  439  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.626283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1664  ferrous iron transport protein B  46.71 
 
 		 758 aa  439  1e-121  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22730  ferrous iron transport protein B  46.2 
 
 		 778 aa  416  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.524583  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1215  ferrous iron transport protein B  42.39 
 
 		 764 aa  409  1e-113  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0169  ferrous iron transport protein B  44 
 
 		 778 aa  405  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0239  ferrous iron transport protein B  42.7 
 
 		 816 aa  386  1e-106  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4929  ferrous iron transport protein B  42.09 
 
 		 766 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.875416  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56680  ferrous iron transport protein B  42.09 
 
 		 766 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1959  ferrous iron transport protein B  42.49 
 
 		 816 aa  382  1e-104  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1913  ferrous iron transport protein B  34.81 
 
 		 587 aa  376  1e-103  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000339722  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1631  ferrous iron transport protein B  34.96 
 
 		 587 aa  376  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000698683  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3779  ferrous iron transport protein B  42.37 
 
 		 772 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03261  ferrous iron transport protein B  42.21 
 
 		 773 aa  367  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.313443  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0304  ferrous iron transport protein B  42.21 
 
 		 773 aa  367  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0304  ferrous iron transport protein B  42.21 
 
 		 773 aa  367  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0656913 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03213  hypothetical protein  42.21 
 
 		 773 aa  367  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.267012  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4716  ferrous iron transport protein B  42.21 
 
 		 773 aa  367  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3875  ferrous iron transport protein B  41.61 
 
 		 772 aa  368  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.551384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3813  ferrous iron transport protein B  41.83 
 
 		 772 aa  369  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3707  ferrous iron transport protein B  41.91 
 
 		 772 aa  369  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3790  ferrous iron transport protein B  42.21 
 
 		 773 aa  367  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3884  ferrous iron transport protein B  42.21 
 
 		 773 aa  367  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3690  ferrous iron transport protein B  42.21 
 
 		 773 aa  367  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3704  ferrous iron transport protein B  41.61 
 
 		 772 aa  368  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3606  ferrous iron transport protein B  42.21 
 
 		 773 aa  367  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0107  ferrous iron transport protein B  38.14 
 
 		 778 aa  360  5e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.803376  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3985  ferrous iron transport protein B  40.51 
 
 		 771 aa  356  5.999999999999999e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0168  ferrous iron transport protein B  40.51 
 
 		 771 aa  357  5.999999999999999e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.426324  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3746  ferrous iron transport protein B  40.25 
 
 		 771 aa  355  2e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4629  ferrous iron transport protein B  41.1 
 
 		 771 aa  350  3e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2723  ferrous iron transport protein B  33.58 
 
 		 631 aa  350  6e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000251574  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1657  ferrous iron transport protein B  33.13 
 
 		 631 aa  340  4e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000909964  hitchhiker  0.000224716 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2524  ferrous iron transport protein B  37.5 
 
 		 766 aa  327  4.0000000000000003e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2152  ferrous iron transport protein B  37.5 
 
 		 782 aa  327  4.0000000000000003e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.264076  hitchhiker  0.0000442692 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0307  ferrous iron transport protein B  29.92 
 
 		 662 aa  326  9e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4642  ferrous iron transport protein B  31.12 
 
 		 662 aa  300  5e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1938  ferrous iron transport protein B  34.32 
 
 		 647 aa  298  2e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.31907  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4932  ferrous iron transport protein B  31.12 
 
 		 662 aa  298  2e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1804  ferrous iron transport protein B  35.38 
 
 		 621 aa  297  4e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.529813  normal  0.0419932 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2878  ferrous iron transport protein B  30 
 
 		 606 aa  295  2e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0506695 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2451  ferrous iron transport protein B  32.53 
 
 		 621 aa  295  2e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0623  ferrous iron transport protein B  34.38 
 
 		 637 aa  291  2e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.356093  normal  0.228705 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1097  ferrous iron transport protein B  32.08 
 
 		 595 aa  291  3e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0110  ferrous iron transport protein B  31.49 
 
 		 668 aa  291  3e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0260348  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4703  ferrous iron transport protein B  30.42 
 
 		 662 aa  288  2e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580342  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4560  ferrous iron transport protein B  30.14 
 
 		 662 aa  288  2e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.185124  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5064  ferrous iron transport protein B  30.42 
 
 		 662 aa  288  2e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.939249  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1329  ferrous iron transport protein B  35.45 
 
 		 637 aa  288  2.9999999999999996e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4542  ferrous iron transport protein B  30.42 
 
 		 662 aa  288  2.9999999999999996e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4928  ferrous iron transport protein B  30.28 
 
 		 662 aa  287  4e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4947  ferrous iron transport protein B  30.56 
 
 		 662 aa  287  4e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5890  Fe2+ transport system protein B  33.82 
 
 		 620 aa  286  8e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2809  ferrous iron transport protein B  31.18 
 
 		 597 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.123024 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2434  ferrous iron transport protein B  35.57 
 
 		 633 aa  285  2.0000000000000002e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1860  ferrous iron transport protein B  34.46 
 
 		 617 aa  285  2.0000000000000002e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2074  ferrous iron transport protein B  30.05 
 
 		 712 aa  284  4.0000000000000003e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0599  ferrous iron transport protein B  32.37 
 
 		 640 aa  282  1e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0621968  normal  0.0719652 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00098  ferrous iron transport protein B  34.21 
 
 		 621 aa  280  5e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.069629  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2849  ferrous iron transport protein B  30.62 
 
 		 618 aa  279  1e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0856  hypothetical protein  32.69 
 
 		 649 aa  277  4e-73  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.935712  normal  0.465758 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1443  ferrous iron transport protein B  36.74 
 
 		 631 aa  276  7e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0983772  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5429  ferrous iron transport B domain-containing protein  35.36 
 
 		 617 aa  276  8e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.895542  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1161  ferrous iron transport protein B  36.88 
 
 		 632 aa  276  9e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.233706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1922  ferrous iron transport protein B  34.27 
 
 		 617 aa  274  4.0000000000000004e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4039  ferrous iron transport protein B  34.79 
 
 		 625 aa  273  8.000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129654 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4105  ferrous iron transport protein B  35.45 
 
 		 738 aa  271  2e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281443  normal  0.296674 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0793  ferrous iron transport protein B  35 
 
 		 728 aa  272  2e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.585929  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>