More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3364 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3364  inorganic diphosphatase  100 
 
 		 178 aa  365  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0851639 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0606  inorganic diphosphatase  63.79 
 
 		 175 aa  249  1e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.943403  hitchhiker  0.00000000378375 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00215  inorganic pyrophosphatase  64.2 
 
 		 176 aa  241  3e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3965  inorganic pyrophosphatase  65.14 
 
 		 175 aa  240  6e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3767  inorganic pyrophosphatase  65.14 
 
 		 175 aa  240  6e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3622  inorganic pyrophosphatase  65.14 
 
 		 175 aa  240  6e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0598  inorganic pyrophosphatase  64.97 
 
 		 177 aa  239  2e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00625335  normal  0.0259189 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1702  inorganic diphosphatase  62.36 
 
 		 180 aa  239  2e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.149662  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3767  Inorganic diphosphatase  65.71 
 
 		 176 aa  238  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0825  Inorganic diphosphatase  65.68 
 
 		 176 aa  238  2.9999999999999997e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.445819  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4704  inorganic pyrophosphatase  65.71 
 
 		 176 aa  238  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1289  inorganic pyrophosphatase  61.85 
 
 		 182 aa  238  2.9999999999999997e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.939108  normal  0.351885 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5743  inorganic pyrophosphatase  65.71 
 
 		 176 aa  238  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4858  inorganic pyrophosphatase  65.71 
 
 		 176 aa  238  2.9999999999999997e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4479  inorganic pyrophosphatase  65.71 
 
 		 176 aa  238  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04095  inorganic pyrophosphatase  64.57 
 
 		 176 aa  236  1e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.124061  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0411  inorganic pyrophosphatase  63.48 
 
 		 176 aa  236  1e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1652  inorganic pyrophosphatase  62.71 
 
 		 206 aa  236  1e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.0000000710747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3784  inorganic pyrophosphatase  64.57 
 
 		 176 aa  236  1e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04059  hypothetical protein  64.57 
 
 		 176 aa  236  1e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0955766  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4795  inorganic pyrophosphatase  64.57 
 
 		 176 aa  236  1e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4694  inorganic pyrophosphatase  62.92 
 
 		 176 aa  236  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4834  inorganic pyrophosphatase  62.92 
 
 		 176 aa  236  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.108749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2123  inorganic pyrophosphatase  65.09 
 
 		 176 aa  235  2e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2300  inorganic diphosphatase  62.92 
 
 		 179 aa  236  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4813  inorganic pyrophosphatase  62.92 
 
 		 176 aa  236  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4779  inorganic pyrophosphatase  62.92 
 
 		 176 aa  236  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.659439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4683  inorganic pyrophosphatase  62.92 
 
 		 176 aa  236  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.301438  normal  0.846206 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1292  Inorganic diphosphatase  64 
 
 		 175 aa  235  3e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001690  inorganic pyrophosphatase  63.07 
 
 		 176 aa  233  8e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3413  inorganic pyrophosphatase  66.29 
 
 		 176 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.785492  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0791  Inorganic diphosphatase  66.27 
 
 		 176 aa  231  5e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2681  inorganic pyrophosphatase  61.27 
 
 		 178 aa  231  5e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3572  inorganic pyrophosphatase  65.14 
 
 		 176 aa  230  7.000000000000001e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0140  inorganic diphosphatase  60.45 
 
 		 177 aa  230  8.000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00784  inorganic pyrophosphatase  64.5 
 
 		 182 aa  229  1e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2093  inorganic diphosphatase  58.43 
 
 		 182 aa  229  1e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2812  inorganic pyrophosphatase  59.55 
 
 		 178 aa  229  2e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1164  Inorganic diphosphatase  61.24 
 
 		 178 aa  229  2e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.289996 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2005  inorganic diphosphatase  58.52 
 
 		 176 aa  229  2e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0775435  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0112  inorganic pyrophosphatase  58.86 
 
 		 182 aa  228  4e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.560152  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1513  inorganic pyrophosphatase  61.71 
 
 		 175 aa  228  4e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000365711  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0685  inorganic diphosphatase  60.8 
 
 		 178 aa  227  7e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.772503  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2565  inorganic pyrophosphatase  60.57 
 
 		 175 aa  225  2e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2358  Inorganic diphosphatase  59.43 
 
 		 175 aa  226  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.607966  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2972  inorganic diphosphatase  60.8 
 
 		 179 aa  225  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2669  inorganic diphosphatase  61.14 
 
 		 178 aa  226  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.708414  normal  0.133967 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2160  inorganic pyrophosphatase  60 
 
 		 175 aa  224  4e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.521563  normal  0.987317 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0462  inorganic pyrophosphatase  67.31 
 
 		 176 aa  224  4e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.160345  normal  0.807275 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1758  inorganic diphosphatase  60.57 
 
 		 186 aa  224  5.0000000000000005e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1306  inorganic pyrophosphatase  59.2 
 
 		 178 aa  224  6e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.502558  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1473  inorganic diphosphatase  58.86 
 
 		 178 aa  224  6e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4879  inorganic diphosphatase  59.77 
 
 		 175 aa  224  6e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.453832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1964  Inorganic diphosphatase  60.57 
 
 		 176 aa  223  8e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.437334  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1372  inorganic pyrophosphatase  59.2 
 
 		 178 aa  223  1e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2120  inorganic diphosphatase  60.57 
 
 		 179 aa  223  1e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.312385 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2613  inorganic pyrophosphatase  58.86 
 
 		 175 aa  221  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1376  inorganic diphosphatase  58.24 
 
 		 176 aa  221  4e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0875  inorganic pyrophosphatase  60 
 
 		 175 aa  221  4e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.639124 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0878  inorganic pyrophosphatase  60 
 
 		 175 aa  221  6e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2173  inorganic pyrophosphatase  60 
 
 		 175 aa  221  6e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000976999 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3002  inorganic diphosphatase  58.05 
 
 		 178 aa  219  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0736  inorganic pyrophosphatase  60 
 
 		 175 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.325229  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5744  inorganic pyrophosphatase  60 
 
 		 175 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.590412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1590  inorganic pyrophosphatase  60 
 
 		 175 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.613446  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2421  inorganic pyrophosphatase  60 
 
 		 175 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.241168 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1805  inorganic pyrophosphatase  60 
 
 		 175 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3007  inorganic pyrophosphatase  60 
 
 		 175 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2417  inorganic pyrophosphatase  60 
 
 		 175 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2277  inorganic pyrophosphatase  60 
 
 		 175 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2349  inorganic pyrophosphatase  58.86 
 
 		 175 aa  219  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.665297 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0678  inorganic pyrophosphatase  57.71 
 
 		 175 aa  219  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.179328 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2462  inorganic pyrophosphatase  60 
 
 		 204 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.152305  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2327  inorganic pyrophosphatase  60 
 
 		 175 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1237  inorganic pyrophosphatase  60 
 
 		 175 aa  218  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1084  inorganic pyrophosphatase  60 
 
 		 175 aa  218  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2240  inorganic diphosphatase  61.71 
 
 		 175 aa  218  3e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0556655 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1078  inorganic pyrophosphatase  60 
 
 		 175 aa  218  3e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96809  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02598  inorganic pyrophosphatase  59.89 
 
 		 178 aa  218  3.9999999999999997e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4154  inorganic pyrophosphatase  58.76 
 
 		 177 aa  218  5e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1496  inorganic diphosphatase  57.87 
 
 		 177 aa  216  1e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000501214  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3400  inorganic pyrophosphatase  58.29 
 
 		 175 aa  216  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.403166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3439  inorganic diphosphatase  57.47 
 
 		 175 aa  216  1e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0879166  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2496  inorganic pyrophosphatase  57.3 
 
 		 180 aa  215  2e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.81481  normal  0.71583 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2974  inorganic pyrophosphatase  60 
 
 		 199 aa  216  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07940  inorganic pyrophosphatase  59.43 
 
 		 175 aa  216  2e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1096  inorganic pyrophosphatase  58.29 
 
 		 175 aa  214  4e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1272  Inorganic diphosphatase  57.71 
 
 		 176 aa  214  4e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2712  Inorganic diphosphatase  56 
 
 		 178 aa  213  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.31283  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3318  inorganic pyrophosphatase  62.13 
 
 		 178 aa  213  9.999999999999999e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.514905 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1025  Inorganic diphosphatase  56.74 
 
 		 179 aa  212  1.9999999999999998e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0131884 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0608  inorganic pyrophosphatase  57.39 
 
 		 177 aa  212  1.9999999999999998e-54  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0773758  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0268  inorganic pyrophosphatase  56.74 
 
 		 178 aa  212  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3708  inorganic pyrophosphatase  58.29 
 
 		 178 aa  211  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.539271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0610  inorganic pyrophosphatase  57.95 
 
 		 176 aa  211  4.9999999999999996e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.409428  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2281  inorganic diphosphatase  56 
 
 		 176 aa  210  7e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.575051  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0484  inorganic pyrophosphatase  57.56 
 
 		 176 aa  210  1e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0961372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0106  inorganic pyrophosphatase  55.06 
 
 		 178 aa  209  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3230  inorganic pyrophosphatase  56.18 
 
 		 178 aa  209  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0583  inorganic diphosphatase  57.65 
 
 		 177 aa  209  1e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.297464 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>