More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3349 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_3349  phosphatase/phosphohexomutase-like  100 
 
 
221 aa  455  1e-127  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0143367  normal  0.0340969 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03683  putative enzymatic protein  37.68 
 
 
232 aa  152  2.9999999999999998e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  35.27 
 
 
396 aa  132  5e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  35.02 
 
 
221 aa  119  3e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2205  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  33.01 
 
 
228 aa  113  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322675  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10160  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.85 
 
 
217 aa  112  5e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0708  HAD-superfamily hydrolase  28.49 
 
 
212 aa  102  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0614  HAD family hydrolase  28.49 
 
 
212 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.631998 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2523  HAD family hydrolase  31.98 
 
 
219 aa  99.8  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000119514  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2263  beta-phosphoglucomutase  33.01 
 
 
218 aa  99.4  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000132741  hitchhiker  0.000000451899 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.47 
 
 
218 aa  99  4e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0520  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.37 
 
 
217 aa  99  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0181  HAD superfamily hydrolase  33 
 
 
214 aa  98.6  6e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1040  HAD family hydrolase  32.11 
 
 
226 aa  98.6  7e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000171478  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1516  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.18 
 
 
227 aa  97.4  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1556  HAD family hydrolase  31.4 
 
 
232 aa  95.9  4e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000353855  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2777  HAD family hydrolase  32.51 
 
 
220 aa  95.5  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0810098  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0139  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.06 
 
 
220 aa  95.1  7e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000437323  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12643  Predicted phosphatase  28.86 
 
 
216 aa  95.1  8e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.128583  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00430  beta-phosphoglucomutase  31.75 
 
 
216 aa  94.7  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1752  HAD family hydrolase  31.43 
 
 
232 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4152  HAD family hydrolase  30.05 
 
 
217 aa  92.8  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2412  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.43 
 
 
222 aa  92.8  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1807  HAD superfamily hydrolase  28.09 
 
 
212 aa  92  7e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1593  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.26 
 
 
202 aa  91.7  9e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.113259 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0794  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  29.79 
 
 
197 aa  90.9  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0913327  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2594  hydrolase  25.81 
 
 
209 aa  91.3  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.537934  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32070  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  31.79 
 
 
227 aa  90.1  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466176  normal  0.444114 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3073  HAD family hydrolase  26.89 
 
 
223 aa  90.5  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00582956  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0471  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.54 
 
 
210 aa  90.5  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7029  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.78 
 
 
213 aa  90.1  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39300  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  33.86 
 
 
218 aa  89.7  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0457  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase cbbY-like protein  28.25 
 
 
236 aa  88.2  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0760422 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0271  hypothetical protein  30.81 
 
 
229 aa  87  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.586518  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0836  hypothetical protein  29.07 
 
 
195 aa  87  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  30.62 
 
 
219 aa  87  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2742  HAD family hydrolase  28.63 
 
 
218 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1980  HAD family hydrolase  32.07 
 
 
202 aa  87  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561924  normal  0.0500569 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1994  HAD family hydrolase  32.43 
 
 
202 aa  87  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000168215  unclonable  0.0000194697 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2067  HAD family hydrolase  32.07 
 
 
202 aa  87  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  hitchhiker  0.0000127527 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0452  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.38 
 
 
227 aa  86.7  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0096  HAD family hydrolase  29.25 
 
 
238 aa  86.7  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.803846  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2463  HAD family hydrolase  26.34 
 
 
209 aa  86.3  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2591  HAD family hydrolase  28.43 
 
 
220 aa  86.3  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000123522  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0304  HAD-superfamily hydrolase  26.4 
 
 
211 aa  86.7  3e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.61412  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2485  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.38 
 
 
238 aa  85.9  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  29.47 
 
 
456 aa  85.5  5e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1351  HAD family hydrolase  28.8 
 
 
236 aa  85.5  5e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00941248  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0473  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.5 
 
 
211 aa  85.9  5e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000148872  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1356  HAD family hydrolase  26.04 
 
 
221 aa  85.5  5e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.14421  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  29.95 
 
 
456 aa  85.5  6e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.6 
 
 
224 aa  85.1  8e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0108500000000004e-18 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2709  HAD family hydrolase  29.05 
 
 
230 aa  84.7  9e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.672792 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0994  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.11 
 
 
188 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000122872  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3074  HAD family hydrolase  27.1 
 
 
222 aa  84.3  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0110  HAD family hydrolase  30.6 
 
 
227 aa  84.3  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4313  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.89 
 
 
235 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2777  putative phosphatase  32.55 
 
 
224 aa  84.7  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.779945  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1573  HAD family hydrolase  27.98 
 
 
222 aa  84.3  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.670571  normal  0.310253 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2245  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.82 
 
 
247 aa  84  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.56873  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2877  beta-phosphoglucomutase  27.7 
 
 
219 aa  84  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5006  HAD family hydrolase  28.57 
 
 
229 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1875  beta-phosphoglucomutase  30.89 
 
 
215 aa  84  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0922  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  31.41 
 
 
235 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2065  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  29.9 
 
 
201 aa  84  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000166842  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0374  HAD family hydrolase  27.05 
 
 
456 aa  83.6  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000852801  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4107  HAD superfamily hydrolase  32.46 
 
 
221 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4427  HAD superfamily hydrolase  32.46 
 
 
221 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1634  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.63 
 
 
221 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0501975  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4498  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  29.85 
 
 
223 aa  83.2  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.511661  normal  0.0143777 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2141  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.53 
 
 
200 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.189137  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3082  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.11 
 
 
224 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.48861  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0845  fructose-1-phosphatase  30.11 
 
 
188 aa  82.8  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012907  hitchhiker  0.000000242912 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0350  HAD family hydrolase  24.06 
 
 
208 aa  83.2  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.373549  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2602  HAD family hydrolase  28.92 
 
 
227 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.852152 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3617  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.45 
 
 
256 aa  82.8  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1388  putative phosphatase  33.33 
 
 
218 aa  82.8  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00329661  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13910  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  30.6 
 
 
232 aa  82.4  0.000000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.491881  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0130  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.33 
 
 
232 aa  82.8  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0122  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.26 
 
 
229 aa  82.8  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2973  fructose-1-phosphatase  28.96 
 
 
188 aa  82  0.000000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000945965  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0192  beta-phosphoglucomutase  27.19 
 
 
220 aa  82  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.787129  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2812  fructose-1-phosphatase  28.96 
 
 
188 aa  82  0.000000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000062421  hitchhiker  0.000278868 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3936  fructose-1-phosphatase  28.96 
 
 
188 aa  82  0.000000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00199329  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2542  HAD family hydrolase  29.5 
 
 
214 aa  82  0.000000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.214098 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3281  HAD family hydrolase  27.8 
 
 
221 aa  82  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1487  putative phosphatase  32.71 
 
 
224 aa  82  0.000000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.751605  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05389  phosphatase YqaB  29.19 
 
 
200 aa  82  0.000000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3945  HAD superfamily hydrolase  31.94 
 
 
221 aa  81.6  0.000000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02545  predicted hydrolase  28.96 
 
 
188 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00348702  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1096  hypothetical protein  30.37 
 
 
222 aa  80.9  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2826  fructose-1-phosphatase  28.96 
 
 
188 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139827  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2387  HAD family hydrolase  28.08 
 
 
211 aa  81.3  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000185425  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1743  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.62 
 
 
227 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.293469  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2344  HAD family hydrolase  28.08 
 
 
211 aa  81.3  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000386998  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02510  hypothetical protein  28.96 
 
 
188 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00621233  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2757  beta-phosphoglucomutase  26.19 
 
 
216 aa  81.3  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1017  fructose-1-phosphatase  28.96 
 
 
188 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0370364  hitchhiker  0.0042534 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3956  HAD superfamily hydrolase  31.58 
 
 
220 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.945579  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1093  hypothetical protein  29.91 
 
 
222 aa  80.1  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>