More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3321 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3321  histidine kinase  100 
 
 		 284 aa  580  1e-164  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000411841 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0694  hypothetical protein  59.21 
 
 		 279 aa  362  5.0000000000000005e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0969715  unclonable  0.00000000507336 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4212  DGPFAETKE family protein  62.76 
 
 		 144 aa  185  8e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380376 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3708  DGPFAETKE family protein  64.08 
 
 		 145 aa  181  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.229966  normal  0.769344 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3256  hypothetical protein  58.62 
 
 		 143 aa  175  8e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5112  DGPFAETKE family protein  58.62 
 
 		 143 aa  175  8e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5169  DGPFAETKE family protein  58.33 
 
 		 143 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0803026 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5048  DGPFAETKE family protein  63.5 
 
 		 143 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.291625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4525  DGPFAETKE family protein  64.23 
 
 		 143 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3488  DGPFAETKE  60.69 
 
 		 145 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3531  DGPFAETKE family protein  61.15 
 
 		 143 aa  168  9e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0310  DGPF domain-containing protein  57.75 
 
 		 246 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.471649  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0256  DGPF domain-containing protein  57.75 
 
 		 243 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.162797  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1126  DGPF domain-containing protein  58.99 
 
 		 145 aa  167  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0193856  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0988  DGPF domain-containing protein  57.75 
 
 		 145 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3123  DGPFAETKE family protein  56.64 
 
 		 141 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.265819  normal  0.0263064 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1339  DGPF domain-containing protein  57.75 
 
 		 145 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.071027  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0384  DGPF domain-containing protein  57.75 
 
 		 145 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391971  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1835  DGPF domain-containing protein  57.75 
 
 		 145 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.565065  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0528  hypothetical protein  62.5 
 
 		 143 aa  166  5e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252797  normal  0.454149 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4029  hypothetical protein  64.52 
 
 		 141 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2519  DGPFAETKE  58.09 
 
 		 141 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.278396  normal  0.095455 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1750  DGPF domain-containing protein  57.04 
 
 		 145 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.605944  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46770  hypothetical protein  64.52 
 
 		 141 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0208952  decreased coverage  0.000000131045 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2572  DGPFAETKE family protein  59.85 
 
 		 140 aa  161  9e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.725199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8315  YCII-related  57.86 
 
 		 140 aa  159  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11198  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2452  DGPFAETKE family protein  54.29 
 
 		 139 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0408545 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0795  hypothetical protein  54.29 
 
 		 139 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.999252  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1484  hypothetical protein  55.94 
 
 		 143 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.786004 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2458  YCII-related  56.43 
 
 		 140 aa  155  6e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2831  DGPFAETKE family protein  53.52 
 
 		 138 aa  149  7e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.618861  normal  0.707195 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1584  DGPFAETKE  50 
 
 		 143 aa  144  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1458  YCII-related  55.47 
 
 		 142 aa  143  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1320  DGPFAETKE family protein  56.56 
 
 		 122 aa  141  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.746126  normal  0.587484 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4110  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  48.89 
 
 		 137 aa  136  4e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.172223  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4025  hypothetical protein  50.78 
 
 		 149 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8414  YCII-related  54.84 
 
 		 144 aa  132  6e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0232  hypothetical protein  51.67 
 
 		 137 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3657  YCII-related  50 
 
 		 147 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5551  YCII-related protein  42.76 
 
 		 145 aa  131  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.622924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6196  YCII-related protein  50.36 
 
 		 140 aa  130  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0534  DGPF domain-containing protein  49.6 
 
 		 137 aa  129  6e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.362719  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3991  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  46.43 
 
 		 155 aa  129  6e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.463262  normal  0.542881 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3588  DGPFAETKE family protein  49.26 
 
 		 147 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3654  YCII-related protein  45.21 
 
 		 141 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.046895  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3924  hypothetical protein  48.39 
 
 		 141 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.762923  normal  0.122571 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2634  DGPF domain-containing protein  48.39 
 
 		 137 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.821675  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2496  DGPF domain-containing protein  48.39 
 
 		 137 aa  125  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0929  DGPF domain-containing protein  48.39 
 
 		 137 aa  125  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7113  DGPFAETKE family protein  46.27 
 
 		 137 aa  125  7e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3500  DGPFAETKE  52.5 
 
 		 147 aa  125  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.161886  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4361  DGPFAETKE family protein  48.33 
 
 		 137 aa  124  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0261  hypothetical protein  47.58 
 
 		 137 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0294  DGPF domain-containing protein  47.58 
 
 		 137 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.360873  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1702  YCII-related protein  43.15 
 
 		 146 aa  123  3e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1639  DGPF domain-containing protein  47.58 
 
 		 137 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1442  DGPF domain-containing protein  47.58 
 
 		 137 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0410  DGPFAETKE family protein  46.04 
 
 		 137 aa  123  4e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00435378  normal  0.146566 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0021  hypothetical protein  46.28 
 
 		 137 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.512817 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4927  DGPFAETKE family protein  46.77 
 
 		 140 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0785882 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3712  DGPFAETKE family protein  45.97 
 
 		 139 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4551  hypothetical protein  45.97 
 
 		 139 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.626002  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3812  DGPFAETKE family protein  45.97 
 
 		 139 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5538  DGPFAETKE family protein  45.97 
 
 		 140 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2284  hypothetical protein  45.16 
 
 		 139 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4099  DGPFAETKE family protein  46.67 
 
 		 137 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3713  DGPFAETKE family protein  44.35 
 
 		 140 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.794137  normal  0.315323 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2105  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.76 
 
 		 144 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.225475 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4614  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  46.43 
 
 		 144 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749766 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5462  YCII-related protein  42.14 
 
 		 146 aa  116  5e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.330293 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4569  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  44.85 
 
 		 143 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.419653 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3497  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  44.85 
 
 		 143 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.35175  normal  0.404774 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4772  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  46.97 
 
 		 139 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.261659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3316  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  44.68 
 
 		 142 aa  113  3e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.918478  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3966  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  44.68 
 
 		 142 aa  113  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.591195  normal  0.267495 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0601  hypothetical protein  44.85 
 
 		 143 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03730  hypothetical protein  47.58 
 
 		 143 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.988914  normal  0.724741 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6889  putative glutathione S-transferase  43.07 
 
 		 391 aa  109  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0839725  normal  0.0391413 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8235  YCII-related protein  41.01 
 
 		 139 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1227  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  41.35 
 
 		 137 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61410  hypothetical protein  43.88 
 
 		 137 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.510351 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2359  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.38 
 
 		 151 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2255  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.76 
 
 		 151 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.260674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1724  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.38 
 
 		 151 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0853542  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5290  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase:3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  43.17 
 
 		 137 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.491308  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0580  DGPFAETKE family protein  46.09 
 
 		 261 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2375  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  44.76 
 
 		 151 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.614742  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2336  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.38 
 
 		 151 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5678  glyoxalase/bleomycin resistance protein  44.06 
 
 		 151 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3319  hypothetical protein  42.22 
 
 		 138 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0361879  normal  0.67973 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2421  DGPFAETKE domain-containing protein  46.28 
 
 		 145 aa  102  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1324  glyoxalase family protein  41.1 
 
 		 260 aa  102  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.228518  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4410  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.56 
 
 		 145 aa  100  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.148122  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5247  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase:3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  40 
 
 		 145 aa  99.8  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.554812  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1173  VOC metalloenzyme family protein  41.61 
 
 		 144 aa  99.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.71319  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1165  VOC metalloenzyme family protein  41.61 
 
 		 144 aa  99.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0941  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  39.55 
 
 		 149 aa  99.4  7e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000300848  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1941  glyoxalase family protein  41.18 
 
 		 144 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.758162  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0295  glyoxalase family protein  41.18 
 
 		 144 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.198245  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0853  glyoxalase family protein  41.18 
 
 		 144 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>