More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3303 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3303  hypothetical protein  100 
 
 		 292 aa  592  1e-168  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.106094 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4953  transporter-associated region  57.3 
 
 		 279 aa  340  1e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1125  hypothetical protein  58.72 
 
 		 279 aa  338  4e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0631  CBS domain-containing protein  57.65 
 
 		 279 aa  338  8e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00687954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12300  hypothetical protein  58.01 
 
 		 279 aa  338  8e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4789  CBS domain containing protein  57.65 
 
 		 279 aa  336  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0871051 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4665  CBS domain-containing protein  57.65 
 
 		 279 aa  336  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.389317  normal  0.838167 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4843  CBS domain-containing protein  57.65 
 
 		 279 aa  336  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.71601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4348  CBS:transporter-associated region  57.45 
 
 		 280 aa  335  5e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4807  metal ion transporter, putative  57.45 
 
 		 280 aa  333  2e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3782  CBS domain-containing protein  56.94 
 
 		 279 aa  331  8e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.964712  normal  0.253 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09040  CBS domain-containing transporter  56.1 
 
 		 280 aa  310  1e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.157725  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2741  transporter-associated region  52.82 
 
 		 281 aa  302  5.000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.835583  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1005  CBS domain-containing protein  52.65 
 
 		 291 aa  298  6e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0718327 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1001  CBS domain-containing protein  52.65 
 
 		 291 aa  298  7e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.243259  normal  0.0641056 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1066  CBS domain-containing protein  52.65 
 
 		 291 aa  298  7e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.354605  normal  0.0599682 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1178  magnesium and cobalt efflux protein CorC  52.65 
 
 		 291 aa  298  8e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3474  CBS domain-containing protein  53.17 
 
 		 291 aa  296  2e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.42  hitchhiker  0.00607831 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1103  CBS domain containing protein  52.11 
 
 		 291 aa  295  4e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000107663 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3264  CBS domain-containing protein  52.11 
 
 		 291 aa  295  4e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3442  CBS domain-containing protein  52.11 
 
 		 291 aa  295  4e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000638255 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3306  CBS domain-containing protein  52.11 
 
 		 291 aa  295  4e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02233  Mg/Co transporter  51.94 
 
 		 285 aa  294  1e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.17166  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3699  CBS domain-containing protein  52.3 
 
 		 291 aa  294  1e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246978  hitchhiker  0.00355907 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2858  CBS domain-containing protein  52.11 
 
 		 291 aa  293  2e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0240  Mg2+/Co2+ transporter  55.72 
 
 		 291 aa  292  4e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2926  CBS domain-containing protein  52.11 
 
 		 291 aa  290  2e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00659921 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2578  magnesium and cobalt efflux protein CorC  51.94 
 
 		 292 aa  289  3e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0721434 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3140  CBS domain-containing protein  51.41 
 
 		 293 aa  289  4e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.328358  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1498  magnesium and cobalt efflux protein  51.24 
 
 		 283 aa  286  2e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2209  CBS domain-containing protein  51.76 
 
 		 286 aa  287  2e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2289  Mg2+/Co2+ transporter  53.99 
 
 		 289 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.977509  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0679  putative magnesium and cobalt efflux protein corC  50.88 
 
 		 279 aa  285  9e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0710  CBS domain-containing protein  50.53 
 
 		 292 aa  282  4.0000000000000003e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.592544  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0812  CBS:transporter associated  50.18 
 
 		 292 aa  281  7.000000000000001e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004214  magnesium and cobalt efflux protein CorC  48.93 
 
 		 299 aa  281  9e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.990364  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2136  CBS domain containing protein  51.7 
 
 		 311 aa  276  3e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0496158  normal  0.0714936 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2337  putative metal ion transporter  51.54 
 
 		 296 aa  275  5e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1216  transporter-associated region  51.2 
 
 		 292 aa  274  1.0000000000000001e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.14368  normal  0.614507 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1833  magnesium and cobalt efflux protein CorC  50.86 
 
 		 292 aa  274  1.0000000000000001e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0397  CBS domain-containing protein  46.69 
 
 		 291 aa  274  1.0000000000000001e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467149 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3008  transporter-associated region  50.86 
 
 		 292 aa  274  1.0000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.983177  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2918  magnesium and cobalt efflux protein CorC  50.86 
 
 		 292 aa  274  1.0000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0300566  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0785  magnesium and cobalt efflux protein CorC  52.71 
 
 		 292 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.971791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0711  magnesium and cobalt efflux protein CorC  52.71 
 
 		 292 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.037434  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0772  magnesium and cobalt efflux protein CorC  52.71 
 
 		 292 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0726  magnesium and cobalt efflux protein CorC  52.71 
 
 		 292 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.93581 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0481  putative hemolysin  50.36 
 
 		 291 aa  272  4.0000000000000004e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00948682  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0993  hemolysin  49.65 
 
 		 291 aa  271  7e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0803506  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1184  CBS domain-containing protein  52.35 
 
 		 292 aa  271  9e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0632091 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0821  magnesium and cobalt efflux protein CorC  52.35 
 
 		 292 aa  270  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00626  predicted ion transport  52 
 
 		 292 aa  269  4e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2968  transporter-associated region  52 
 
 		 292 aa  269  4e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.386789  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0687  magnesium and cobalt efflux protein CorC  52 
 
 		 292 aa  269  4e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00083151  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0680  magnesium and cobalt efflux protein CorC  52 
 
 		 292 aa  269  4e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.262474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0751  magnesium and cobalt efflux protein CorC  52 
 
 		 292 aa  269  4e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.062635  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00617  hypothetical protein  52 
 
 		 292 aa  269  4e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1194  transporter-associated region  50.52 
 
 		 292 aa  269  4e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2987  transporter-associated region  52 
 
 		 292 aa  269  4e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.184587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0589  magnesium and cobalt efflux protein CorC  52 
 
 		 292 aa  269  4e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.315177  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0705  magnesium and cobalt efflux protein CorC  52 
 
 		 292 aa  269  4e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.505842  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3137  transporter-associated region  50.17 
 
 		 292 aa  269  5e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0890  CBS domain-containing protein  49.47 
 
 		 291 aa  268  7e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.192583  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1349  CBS domain containing protein  49.29 
 
 		 293 aa  268  1e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.038929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01227  hypothetical protein  47.42 
 
 		 299 aa  266  2.9999999999999995e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2912  CBS domain-containing protein  52.63 
 
 		 288 aa  265  5e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1951  magnesium and cobalt efflux protein  47.14 
 
 		 323 aa  265  8e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2951  CBS domain containing protein  51.99 
 
 		 289 aa  263  2e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.652307  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1886  CBS domain-containing protein  46.43 
 
 		 323 aa  263  3e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.112037  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2703  hypothetical protein  50.18 
 
 		 285 aa  261  6.999999999999999e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.313937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00451  polar amino acid transporter  48.58 
 
 		 292 aa  259  3e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0391689  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3575  magnesium and cobalt efflux protein CorC  49.12 
 
 		 292 aa  258  1e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1105  transporter-associated region  55.24 
 
 		 289 aa  256  3e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0237  magnesium and cobalt efflux protein  48.4 
 
 		 297 aa  256  4e-67  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.911698  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1456  magnesium and cobalt efflux protein CorC  48.63 
 
 		 284 aa  255  6e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00173357  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0601  CBS domain-containing protein  48.23 
 
 		 295 aa  254  8e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3530  CBS:transporter-associated region  49.1 
 
 		 282 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0231073 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2615  transporter-associated region  47.16 
 
 		 295 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0650038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0626  CorC family Mg2+ / Co2+ transporter  47.87 
 
 		 311 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.479043  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2750  transporter-associated region  47.16 
 
 		 295 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29691  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3333  transporter-associated region  47.87 
 
 		 311 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.240989 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0587  magnesium and cobalt efflux protein CorC  47.16 
 
 		 295 aa  252  6e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2086  transporter-associated region  47.16 
 
 		 295 aa  252  6e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0362455  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2725  CBS domain-containing protein  47.16 
 
 		 295 aa  252  6e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.49452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2698  CBS domain-containing protein  47.16 
 
 		 295 aa  252  6e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0164111  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6025  putative Mg2+ and Co2+ transporter CorC  47.16 
 
 		 295 aa  251  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.097804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2353  magnesium and cobalt efflux protein CorC  46.81 
 
 		 295 aa  250  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0704  magnesium and cobalt efflux protein CorC  46.81 
 
 		 295 aa  250  2e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.459975  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0221  magnesium and cobalt efflux protein CorC  46.81 
 
 		 295 aa  250  2e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0868  CBS domain containing protein  50.75 
 
 		 279 aa  250  2e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0719  magnesium and cobalt efflux protein CorC  46.81 
 
 		 295 aa  250  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.742148  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2433  magnesium and cobalt efflux protein CorC  46.81 
 
 		 295 aa  250  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2725  magnesium and cobalt efflux protein CorC  46.81 
 
 		 295 aa  250  2e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0528  hypothetical protein  48.56 
 
 		 298 aa  249  3e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0687971  normal  0.0248188 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0885  magnesium and cobalt efflux protein CorC  46.81 
 
 		 403 aa  249  4e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.216918  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0419  CBS domain containing protein  47.5 
 
 		 309 aa  248  6e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.622 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0404  CBS domain containing protein  47.14 
 
 		 309 aa  248  8e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.275188 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1181  CBS domain containing protein  45.83 
 
 		 299 aa  248  1e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1602  hypothetical protein  43.54 
 
 		 292 aa  247  2e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0450  CBS transporter-associated protein  47.23 
 
 		 295 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00559232  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>