66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3272 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_3272  hypothetical protein  100 
 
 
552 aa  1123    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000109169  hitchhiker  0.00653931 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2478  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  46.41 
 
 
524 aa  155  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2795  hypothetical protein  42.42 
 
 
912 aa  109  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00123137  hitchhiker  0.0000146968 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0034  hypothetical protein  40.67 
 
 
768 aa  104  5e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1507  hypothetical protein  38.16 
 
 
873 aa  102  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.48117  hitchhiker  0.0000051412 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3390  coagulation factor 5/8 type domain protein  44.12 
 
 
1246 aa  95.5  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.032281  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3709  hypothetical protein  41.53 
 
 
818 aa  95.1  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.156868 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2009  Cellulase  40.77 
 
 
748 aa  93.6  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.428719  normal  0.0728263 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1503  ATPase  35.94 
 
 
674 aa  84.3  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000259399  hitchhiker  0.000359173 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3275  leucyl-tRNA synthetase class Ia  37.82 
 
 
892 aa  68.9  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00291513  normal  0.0104078 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1614  glycosy hydrolase family protein  29.12 
 
 
1471 aa  63.9  0.000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1021  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  36.24 
 
 
490 aa  62.4  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.278615  normal  0.298749 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2547  translation initiation factor SUI1  28.36 
 
 
611 aa  59.3  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.858491  hitchhiker  0.00146085 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1818  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  32.46 
 
 
477 aa  57.8  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000535261  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0821  coagulation factor 5/8 type-like protein  29.19 
 
 
558 aa  55.5  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000172205  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6675  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.33 
 
 
929 aa  52.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.692846  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2035  peptidase S45 penicillin amidase  33.62 
 
 
1070 aa  52.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.973933 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  27.52 
 
 
953 aa  51.6  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1919  Chitinase-like protein  32.35 
 
 
680 aa  52  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0112  hypothetical protein  32.14 
 
 
1024 aa  51.6  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292658  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3723  hypothetical protein  33.06 
 
 
449 aa  51.2  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.788097  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5990  Carbohydrate-binding CenC domain protein  34.81 
 
 
648 aa  50.4  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.793128  normal  0.422272 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4811  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.82 
 
 
971 aa  50.4  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000406891  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1459  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  35.17 
 
 
261 aa  49.7  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1052  coagulation factor 5/8 type domain protein  36.67 
 
 
1362 aa  50.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311777  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1957  heme-binding protein  28.8 
 
 
1439 aa  48.5  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.585406  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  28.99 
 
 
752 aa  48.5  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1480  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.46 
 
 
722 aa  48.5  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3845  Beta-glucosidase  34.15 
 
 
987 aa  48.5  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822537  normal  0.0429767 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1525  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  39.78 
 
 
695 aa  48.1  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.299502  hitchhiker  0.000931017 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2003  hypothetical protein  32.17 
 
 
850 aa  47.8  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614926  normal  0.156337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3396  hypothetical protein  35.04 
 
 
433 aa  47.8  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.494224 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2177  glycoside hydrolase family protein  27.07 
 
 
578 aa  47.8  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0141597  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4788  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.63 
 
 
1564 aa  47.8  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35795  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3165  Ricin B lectin  31.39 
 
 
2031 aa  47.4  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00144153 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0826  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.07 
 
 
159 aa  47  0.0009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0155823  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.36 
 
 
756 aa  46.6  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1445  Chitinase  35.83 
 
 
597 aa  47  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.586711  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0610  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.07 
 
 
159 aa  46.2  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.41 
 
 
986 aa  47  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0478  GTP-binding protein TypA  31.3 
 
 
1028 aa  45.8  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1551  hypothetical protein  30.58 
 
 
571 aa  45.8  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0569  putative secreted protein  33.9 
 
 
470 aa  45.8  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0881  carbohydrate-binding, CenC-like protein  27.53 
 
 
433 aa  45.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000527436  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4311  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.2 
 
 
755 aa  46.2  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0177286  hitchhiker  0.00166201 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5087  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  31.86 
 
 
487 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.800108 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4909  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.12 
 
 
915 aa  45.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.01005  normal  0.104643 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  35.87 
 
 
801 aa  45.4  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3281  coagulation factor 5/8 type-like  31.86 
 
 
487 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.71 
 
 
1158 aa  44.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4670  alpha-1,2-mannosidase  35.79 
 
 
899 aa  45.1  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00187508  normal  0.0229721 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5195  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  30.97 
 
 
480 aa  44.7  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4312  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.82 
 
 
1007 aa  45.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.382948  hitchhiker  0.000989115 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0379  protein of unknown function DUF291  29.03 
 
 
732 aa  45.1  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4947  Alpha-L-fucosidase  33.94 
 
 
644 aa  44.7  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00851313  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2796  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.67 
 
 
1139 aa  44.3  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.151007  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0859  alpha-N-acetylglucosaminidase family protein  27.33 
 
 
2095 aa  44.7  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4225  Carbohydrate-binding CenC domain protein  35.71 
 
 
551 aa  44.7  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0637754 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7911  hypothetical protein  31.78 
 
 
392 aa  44.3  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4499  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  33.05 
 
 
470 aa  44.3  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0097  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  24.26 
 
 
159 aa  43.9  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4065  F5/8 type C domain-containing protein  24.26 
 
 
159 aa  43.9  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5024  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  33.05 
 
 
470 aa  43.5  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0850  alpha-N-acetylglucosaminidase family protein  25.6 
 
 
2095 aa  43.9  0.009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.871673  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4066  F5/8 type C domain-containing protein  24.26 
 
 
159 aa  43.5  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.639135 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1220  Carbohydrate-binding CenC domain protein  35.92 
 
 
510 aa  43.5  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>