167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3271 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1025  beta-hexosaminidase  47.74 
 
 		 879 aa  825    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3509  beta-hexosaminidase b precursor  48.64 
 
 		 896 aa  821    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3271  glycosyl hydrolase  100 
 
 		 889 aa  1848    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0765357  hitchhiker  0.00388677 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2936  Beta-N-acetylhexosaminidase  48.12 
 
 		 896 aa  812    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000338099  normal  0.491372 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3018  Beta-N-acetylhexosaminidase  47.9 
 
 		 896 aa  804    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00614959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3115  beta-N-acetylhexosaminidase  46.41 
 
 		 935 aa  807    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000817538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0943  Beta-N-acetylhexosaminidase  49.03 
 
 		 884 aa  832    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.125845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1405  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.03 
 
 		 910 aa  662    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1115  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.67 
 
 		 888 aa  788    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0366712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1075  Beta-N-acetylhexosaminidase  48.92 
 
 		 900 aa  806    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.513664  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1143  Beta-N-acetylhexosaminidase  47.55 
 
 		 932 aa  800    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000565131  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1396  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.55 
 
 		 913 aa  665    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1211  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.79 
 
 		 888 aa  811    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000482778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1100  Beta-N-acetylhexosaminidase  48.53 
 
 		 906 aa  839    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.494393  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1177  Beta-N-acetylhexosaminidase  47.44 
 
 		 932 aa  800    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0322091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1432  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.96 
 
 		 915 aa  671    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0561  Beta-N-acetylhexosaminidase  44.64 
 
 		 853 aa  764    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.910556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1311  Beta-N-acetylhexosaminidase  47.27 
 
 		 888 aa  815    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000578647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2949  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.53 
 
 		 913 aa  661    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0525073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3212  Beta-N-acetylhexosaminidase  47.5 
 
 		 935 aa  800    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000385036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1475  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.5 
 
 		 919 aa  579  1e-164  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0050  N,N'-diacetylchitobiase precursor (chitobiase)  37.65 
 
 		 881 aa  580  1e-164  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.304506  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1809  beta-N-acetylhexosaminidase  36.48 
 
 		 883 aa  564  1.0000000000000001e-159  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004191  beta-hexosaminidase  35.82 
 
 		 883 aa  561  1e-158  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.540073  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01265  hypothetical protein  35.54 
 
 		 883 aa  556  1e-157  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2903  chitobiase  35.99 
 
 		 891 aa  544  1e-153  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000114665  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2992  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.99 
 
 		 891 aa  544  1e-153  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.720324  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1232  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.57 
 
 		 885 aa  532  1e-149  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.12617  normal  0.176702 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0553  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.69 
 
 		 857 aa  481  1e-134  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2880  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.45 
 
 		 827 aa  457  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2738  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.16 
 
 		 827 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0451  beta-N-acetylhexosaminidase, putative  35.32 
 
 		 836 aa  445  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.899024  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2206  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.01 
 
 		 837 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.993622  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2820  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.01 
 
 		 837 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2831  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.01 
 
 		 828 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6150  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.77 
 
 		 827 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3173  beta-N-acetylhexosaminidase, putative  40.4 
 
 		 833 aa  437  1e-121  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0143  putative beta-N-acetylhexosaminidase  40.4 
 
 		 833 aa  436  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1445  putative beta-N-acetylhexosaminidase  40.4 
 
 		 833 aa  436  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0556  glycosy hydrolase family protein  40.23 
 
 		 833 aa  433  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2873  putative beta-N-acetylhexosaminidase  40.4 
 
 		 833 aa  436  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2797  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.3 
 
 		 858 aa  436  1e-120  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0725  chitinase  40.23 
 
 		 856 aa  432  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.540847  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0540  glycosy hydrolase family protein  40.07 
 
 		 833 aa  432  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.152646  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1487  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.93 
 
 		 866 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.61861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1285  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.54 
 
 		 852 aa  385  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6586  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.7 
 
 		 863 aa  366  1e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4327  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.4 
 
 		 868 aa  361  3e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03430  beta-N-hexosaminidase  32.28 
 
 		 639 aa  233  1e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002579  beta-hexosaminidase  33.12 
 
 		 639 aa  231  4e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2583  beta-hexosaminidase (beta-N-acetylglucosaminidase)  32.15 
 
 		 602 aa  228  3e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0142  beta-N-acetylhexosaminidase  31.34 
 
 		 637 aa  226  1e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3893  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.07 
 
 		 760 aa  221  3.9999999999999997e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.470709 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4336  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.6 
 
 		 553 aa  206  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.649243 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3756  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.51 
 
 		 636 aa  206  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.782699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3975  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.44 
 
 		 605 aa  206  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0128397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3454  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.37 
 
 		 636 aa  206  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2718  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.7 
 
 		 779 aa  203  9.999999999999999e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.954025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1388  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.87 
 
 		 905 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.351923  normal  0.145256 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2739  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.67 
 
 		 627 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4994  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.19 
 
 		 765 aa  198  4.0000000000000005e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00424832  normal  0.110436 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1350  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.41 
 
 		 775 aa  197  5.000000000000001e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6251  beta-N-acetylhexosaminidase  30.13 
 
 		 639 aa  196  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2638  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.6 
 
 		 613 aa  192  2.9999999999999997e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.33846  normal  0.654187 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2039  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.97 
 
 		 772 aa  191  4e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0674  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.46 
 
 		 766 aa  191  5.999999999999999e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2031  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.9 
 
 		 762 aa  190  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250491  normal  0.492134 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5260  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.54 
 
 		 609 aa  187  8e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0488918  hitchhiker  0.00217525 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0434  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.11 
 
 		 618 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1175  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.62 
 
 		 533 aa  185  3e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1614  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.7 
 
 		 634 aa  182  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6613  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.92 
 
 		 673 aa  182  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1798  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.07 
 
 		 618 aa  182  2.9999999999999997e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3656  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.14 
 
 		 655 aa  181  4e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.621281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01641  beta-hexosaminidase  31 
 
 		 736 aa  181  7e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108006  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1198  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.2 
 
 		 774 aa  179  2e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.263867  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4808  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.48 
 
 		 834 aa  179  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4653  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.13 
 
 		 639 aa  179  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292919  normal  0.0791763 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5673  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.16 
 
 		 673 aa  179  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.869284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  28.45 
 
 		 469 aa  178  4e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6221  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.42 
 
 		 795 aa  178  4e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.473929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0868  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.59 
 
 		 549 aa  178  4e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3037  glycosyl hydrolase  28.49 
 
 		 795 aa  174  6.999999999999999e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.542043  hitchhiker  0.0000668214 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.57 
 
 		 542 aa  172  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.106418 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2363  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.13 
 
 		 527 aa  171  7e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14021  normal  0.334984 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9002  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.24 
 
 		 545 aa  170  9e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5335  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0578  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.46 
 
 		 526 aa  169  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1915  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.1 
 
 		 790 aa  169  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3960  beta-hexosaminidase  26.85 
 
 		 776 aa  168  4e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2417  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.83 
 
 		 821 aa  168  4e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0043  beta-hexosaminidase  26.38 
 
 		 777 aa  167  5.9999999999999996e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9094  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.39 
 
 		 422 aa  167  6.9999999999999995e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0063  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.14 
 
 		 779 aa  167  1.0000000000000001e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0268197  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3399  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.95 
 
 		 613 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2148  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.94 
 
 		 549 aa  165  4.0000000000000004e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0482384  normal  0.117 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0201  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.35 
 
 		 481 aa  164  5.0000000000000005e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3427  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.28 
 
 		 785 aa  164  6e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0258977 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2279  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.32 
 
 		 529 aa  164  9e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.962324  hitchhiker  0.00828921 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  26.58 
 
 		 816 aa  164  9e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3807  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.06 
 
 		 593 aa  164  9e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0222239 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>