More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3229 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3229  hypothetical protein  100 
 
 		 197 aa  403  1.0000000000000001e-112  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.474421  normal  0.780413 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3499  YceI family protein  42.17 
 
 		 179 aa  136  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0890239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2933  YceI family protein  34.12 
 
 		 182 aa  120  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.258273 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1405  YceI family protein  36.6 
 
 		 201 aa  120  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247492 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1317  hypothetical protein  38.51 
 
 		 191 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.269449  normal  0.532637 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2875  hypothetical protein  35.9 
 
 		 191 aa  117  9e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.367031  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03828  YceI  35.12 
 
 		 188 aa  117  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1092  YceI family protein  37.2 
 
 		 195 aa  116  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00011726  normal  0.0389048 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2790  hypothetical protein  34.59 
 
 		 193 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.234701  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1739  hypothetical protein  35.32 
 
 		 203 aa  115  3.9999999999999997e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000033243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1217  hypothetical protein  35.68 
 
 		 192 aa  115  5e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000670198  normal  0.302127 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3192  YceI family protein  33.71 
 
 		 182 aa  114  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3514  YceI family protein  38.69 
 
 		 285 aa  114  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0676  hypothetical protein  35.63 
 
 		 174 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0885359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0780  hypothetical protein  33.33 
 
 		 196 aa  112  3e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.263048  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  36.47 
 
 		 196 aa  112  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2128  hypothetical protein  36.9 
 
 		 191 aa  112  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000295006  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3198  hypothetical protein  35.12 
 
 		 191 aa  112  5e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000543452  normal  0.576975 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1323  hypothetical protein  35.12 
 
 		 191 aa  112  5e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00141701  normal  0.012746 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3055  hypothetical protein  35.12 
 
 		 191 aa  112  5e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0011163  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1178  hypothetical protein  34.22 
 
 		 191 aa  110  9e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1121  hypothetical protein  39.44 
 
 		 177 aa  110  9e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000345646  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01052  hypothetical protein  34.22 
 
 		 191 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2590  YceI family protein  34.22 
 
 		 191 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.549032  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3041  hypothetical protein  35.12 
 
 		 191 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000749458  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2074  hypothetical protein  34.22 
 
 		 191 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.598885  normal  0.498469 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01060  hypothetical protein  34.22 
 
 		 191 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1435  hypothetical protein  34.22 
 
 		 191 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383161  normal  0.170982 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2272  hypothetical protein  34.22 
 
 		 191 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3598  hypothetical protein  33.52 
 
 		 199 aa  109  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118422  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2032  hypothetical protein  33.69 
 
 		 191 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2216  hypothetical protein  33.69 
 
 		 191 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.933696  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1224  hypothetical protein  33.69 
 
 		 191 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.984654  normal  0.418516 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1268  hypothetical protein  33.69 
 
 		 191 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2544  hypothetical protein  33.69 
 
 		 191 aa  109  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.162419  normal  0.478359 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1179  hypothetical protein  33.69 
 
 		 191 aa  109  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.537467  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1026  YceI family protein  36.16 
 
 		 225 aa  108  4.0000000000000004e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00890  hypothetical protein  36.84 
 
 		 183 aa  108  4.0000000000000004e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000194  hypothetical protein  35.26 
 
 		 176 aa  108  4.0000000000000004e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000000352716  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0122  YceI family protein  35.06 
 
 		 187 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.409556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0621  YceI family protein  31.18 
 
 		 213 aa  108  5e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0461  YceI-like family protein  31.18 
 
 		 213 aa  108  5e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151619  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4409  YceI family protein  37.14 
 
 		 177 aa  108  7.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  33.52 
 
 		 182 aa  108  7.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1249  hypothetical protein  32.32 
 
 		 191 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00199018  normal  0.506862 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  35.47 
 
 		 196 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1253  hypothetical protein  33.16 
 
 		 191 aa  107  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.845086 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1179  hypothetical protein  34.52 
 
 		 191 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000115477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05924  hypothetical protein  35.36 
 
 		 189 aa  107  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2702  hypothetical protein  31.82 
 
 		 191 aa  107  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.120827  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1570  hypothetical protein  33.16 
 
 		 192 aa  106  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.599107 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  35.67 
 
 		 183 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4326  YceI family protein  32.77 
 
 		 187 aa  106  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.113695  normal  0.313074 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1821  hypothetical protein  33.87 
 
 		 192 aa  105  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.129752  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1722  YceI family protein  33.88 
 
 		 183 aa  105  3e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1931  hypothetical protein  33.87 
 
 		 192 aa  105  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2224  hypothetical protein  33.87 
 
 		 192 aa  105  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0021514  hitchhiker  0.00838786 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  35.67 
 
 		 183 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1178  hypothetical protein  33.93 
 
 		 191 aa  105  4e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000879388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24290  hypothetical protein  34.12 
 
 		 176 aa  105  5e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0570577  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3307  YceI family protein  33.14 
 
 		 182 aa  105  5e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.872006  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3257  YceI family protein  34.27 
 
 		 178 aa  105  6e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0987348  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05510  hypothetical protein  36.69 
 
 		 191 aa  104  8e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1041  hypothetical protein  35.19 
 
 		 189 aa  104  8e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.570231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  31.96 
 
 		 201 aa  104  9e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2890  hypothetical protein  36.09 
 
 		 189 aa  104  9e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.11559  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0473  hypothetical protein  33.33 
 
 		 189 aa  104  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  1.81293e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0523  hypothetical protein  36.69 
 
 		 191 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1680  YceI family protein  35.36 
 
 		 200 aa  103  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2518  hypothetical protein  33.33 
 
 		 192 aa  103  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1733  YceI family protein  35.23 
 
 		 177 aa  103  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1609  YceI family protein  30.77 
 
 		 192 aa  103  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1457  YceI family protein  35.09 
 
 		 177 aa  102  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.83368  normal  0.522042 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0932  YceI  33.73 
 
 		 183 aa  102  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0950  hypothetical protein  35.12 
 
 		 190 aa  102  5e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000269923  normal  0.477847 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4627  YceI family protein  34.86 
 
 		 175 aa  101  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  31.67 
 
 		 182 aa  101  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0333  YceI family protein  35.71 
 
 		 199 aa  101  8e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192845  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2823  hypothetical protein  32.72 
 
 		 192 aa  101  8e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3757  YceI family protein  33.52 
 
 		 181 aa  101  8e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2880  YceI family protein  33.52 
 
 		 181 aa  100  9e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3066  YceI family protein  35.67 
 
 		 197 aa  100  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0262369 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0484  hypothetical protein  34.73 
 
 		 192 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.611751  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0607  YceI family protein  37.41 
 
 		 178 aa  100  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.372987 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0081  YceI  32.32 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0195  YceI family protein  33.11 
 
 		 187 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2307  YceI family protein  33.72 
 
 		 204 aa  99.8  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000152609  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1917  hypothetical protein  31.89 
 
 		 207 aa  99.4  3e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000543514  hitchhiker  0.00086053 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2435  YceI family protein  35.14 
 
 		 188 aa  99.4  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.832405  normal  0.0582212 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2208  YceI  31.82 
 
 		 207 aa  99.4  3e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.690389  normal  0.024147 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5030  hypothetical protein  34.13 
 
 		 192 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.727283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4425  YceI family protein  30.64 
 
 		 188 aa  99  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0382  YceI family protein  34.5 
 
 		 175 aa  99  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350696 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4854  hypothetical protein  33.53 
 
 		 192 aa  99  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.393068  normal  0.0523451 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4981  hypothetical protein  33.53 
 
 		 204 aa  98.6  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4751  YceI family protein  33.14 
 
 		 182 aa  98.6  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2451  YceI family protein  31.71 
 
 		 205 aa  98.6  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3639  YceI family protein  32.34 
 
 		 182 aa  98.2  6e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.162528 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  30.59 
 
 		 177 aa  97.1  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1887  YceI family protein  32.09 
 
 		 192 aa  97.4  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.810222  hitchhiker  0.000541612 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>