86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3197 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3197  putative sulfate uptake protein  100 
 
 		 268 aa  539  9.999999999999999e-153  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.155979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0886  putative sulfate transport protein CysZ  40 
 
 		 250 aa  167  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.693732 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1015  putative sulfate transport protein CysZ  38.98 
 
 		 253 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1177  cysZ protein  38.98 
 
 		 253 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0976  putative sulfate transport protein CysZ  39.22 
 
 		 246 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.828685  normal  0.13166 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3616  hypothetical protein  37.94 
 
 		 249 aa  158  7e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4674  putative sulfate transport protein CysZ  36.55 
 
 		 246 aa  158  8e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.581083  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53330  putative sulfate transport protein CysZ  36.95 
 
 		 246 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.442824 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1513  putative sulfate transport protein CysZ  36.51 
 
 		 264 aa  154  1e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.73829 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4409  putative sulfate transport protein CysZ  39.2 
 
 		 242 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.285932  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2899  putative sulfate transport protein CysZ  35.52 
 
 		 259 aa  152  7e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1014  putative sulfate transport protein CysZ  36.4 
 
 		 263 aa  150  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000500888  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3189  protein of unknown function DUF540  35.96 
 
 		 256 aa  150  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000074726  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1834  putative sulfate transport protein CysZ  39.85 
 
 		 253 aa  150  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.724541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2464  putative sulfate transport protein CysZ  36.11 
 
 		 257 aa  150  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000013069  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0819  putative sulfate transport protein CysZ  39.6 
 
 		 242 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0808  putative sulfate transport protein CysZ  39.2 
 
 		 242 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00684995  normal  0.0715554 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0785  putative sulfate transport protein CysZ  39.2 
 
 		 242 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0197776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1505  putative sulfate transport protein CysZ  35 
 
 		 259 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000542518  hitchhiker  0.0000000567341 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1572  putative sulfate transport protein CysZ  35 
 
 		 259 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000851255  hitchhiker  0.00212574 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1566  putative sulfate transport protein CysZ  35 
 
 		 259 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000261033  hitchhiker  0.0000695889 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0777  putative sulfate transport protein CysZ  36.02 
 
 		 263 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000677117  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1686  putative sulfate transport protein CysZ  37.45 
 
 		 257 aa  146  3e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.04306  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1702  putative sulfate transport protein CysZ  35.8 
 
 		 259 aa  145  6e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000296404  hitchhiker  0.000000528176 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2761  putative sulfate transport protein CysZ  35.8 
 
 		 259 aa  145  6e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00115668  hitchhiker  0.0000596308 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2682  putative sulfate transport protein CysZ  35.8 
 
 		 259 aa  145  6e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000538475  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01310  putative sulfate transport protein CysZ  35.02 
 
 		 249 aa  145  7.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1734  putative sulfate transport protein CysZ  38.82 
 
 		 257 aa  145  9e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.847735  hitchhiker  0.00000000137908 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2657  putative sulfate transport protein CysZ  35.41 
 
 		 259 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131365  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2517  putative sulfate transport protein CysZ  34.5 
 
 		 257 aa  144  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.160746  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2380  putative sulfate transport protein CysZ  38.1 
 
 		 257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0944134  hitchhiker  0.000158699 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2700  putative sulfate transport protein CysZ  34.39 
 
 		 253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000399677  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1265  putative sulfate transport protein CysZ  34.39 
 
 		 253 aa  140  3e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000198921  decreased coverage  0.0000225757 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2568  putative sulfate transport protein CysZ  34.39 
 
 		 253 aa  140  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000943682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2767  putative sulfate transport protein CysZ  34.39 
 
 		 253 aa  140  3e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000160365  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3644  putative sulfate transport protein CysZ  34.39 
 
 		 253 aa  140  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000423219  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02274  hypothetical protein  34.39 
 
 		 253 aa  140  3e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000358279  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2227  protein of unknown function DUF540  35.66 
 
 		 241 aa  140  3e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2548  putative sulfate transport protein CysZ  34.39 
 
 		 253 aa  140  3e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000814239  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1248  protein of unknown function DUF540  34.39 
 
 		 253 aa  140  3e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000124469  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4403  hypothetical protein  36.9 
 
 		 259 aa  140  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02313  putative sulfate transport protein CysZ  34.39 
 
 		 253 aa  140  3e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000659923  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2367  putative sulfate transport protein CysZ  34.24 
 
 		 259 aa  140  3e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0829317  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2850  putative sulfate transport protein CysZ  37.3 
 
 		 257 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000397841 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2355  putative sulfate transport protein CysZ  38.74 
 
 		 250 aa  138  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3267  protein of unknown function DUF540  34.52 
 
 		 256 aa  137  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000136601  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3468  putative sulfate transport protein CysZ  35.07 
 
 		 251 aa  135  5e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2339  hypothetical protein  34.78 
 
 		 263 aa  135  5e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.747358  normal  0.0441816 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2941  putative sulfate transport protein CysZ  34.39 
 
 		 253 aa  135  6.0000000000000005e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000526268  normal  0.109677 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01847  putative sulfate transport protein CysZ  33.08 
 
 		 245 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2573  putative sulfate transport protein CysZ  32.82 
 
 		 287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000546131  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2794  putative sulfate transport protein CysZ  32.82 
 
 		 287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0621521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004155  sulfate transporter CysZ-type  34.87 
 
 		 228 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000767256  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2664  putative sulfate transport protein CysZ  32.82 
 
 		 287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00333644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2622  putative sulfate transport protein CysZ  32.82 
 
 		 287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00041893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2688  putative sulfate transport protein CysZ  32.82 
 
 		 287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.211046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1319  putative sulfate transport protein CysZ  34.39 
 
 		 244 aa  133  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  3.35913e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1430  putative sulfate transport protein CysZ  34.39 
 
 		 244 aa  133  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000173702  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2746  putative sulfate transport protein CysZ  34.39 
 
 		 244 aa  133  3e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000416155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0490  putative sulfate transport protein CysZ  32.95 
 
 		 250 aa  132  6.999999999999999e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000555073  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10220  putative sulfate transport protein CysZ  38.46 
 
 		 240 aa  132  6.999999999999999e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0370  putative sulfate transport protein CysZ  34.26 
 
 		 257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.308056  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1773  hypothetical protein  36.9 
 
 		 244 aa  129  6e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3262  hypothetical protein  34.68 
 
 		 242 aa  127  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0899601  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2474  hypothetical protein  33.59 
 
 		 250 aa  126  5e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.030274  normal  0.489953 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3446  putative sulfate transport protein CysZ  33.59 
 
 		 253 aa  122  7e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00219453  hitchhiker  0.000157048 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1712  putative sulfate transport protein CysZ  30.36 
 
 		 234 aa  106  4e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1699  hypothetical protein  31.1 
 
 		 261 aa  101  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.195825  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2030  protein of unknown function DUF540  30.04 
 
 		 240 aa  96.3  5e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4416  hypothetical protein  28.57 
 
 		 261 aa  85.5  9e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.921944  normal  0.0304901 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1024  CysZ protein  27.38 
 
 		 258 aa  74.3  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000955852  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1581  protein of unknown function DUF540  28.76 
 
 		 212 aa  71.2  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.768375 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2099  protein of unknown function DUF540  26.72 
 
 		 269 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000514107 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1157  protein of unknown function DUF540  31.21 
 
 		 272 aa  65.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.377801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0890  hypothetical protein  23.55 
 
 		 285 aa  64.7  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.148607 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3441  hypothetical protein  28.52 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.169478  normal  0.0964499 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1126  protein of unknown function DUF540  31.82 
 
 		 272 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21450  uncharacterized protein involved in cysteine biosynthesis  24.63 
 
 		 253 aa  57  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.412828 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5501  protein of unknown function DUF540  24.34 
 
 		 256 aa  55.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000000395042  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7196  putative sulfate transport protein CysZ  27.41 
 
 		 249 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.053163 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0416  protein of unknown function DUF540  25.52 
 
 		 250 aa  54.7  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.881692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4000  protein of unknown function DUF540  24.69 
 
 		 279 aa  50.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.105937  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0202  protein of unknown function DUF540  25.38 
 
 		 252 aa  48.1  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2442  hypothetical protein  28.98 
 
 		 261 aa  47.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0221132 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0194  protein of unknown function DUF540  23.86 
 
 		 283 aa  47.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5770  hypothetical protein  22.33 
 
 		 251 aa  45.8  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.327277  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>