More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3138 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_3138  8-amino-7-oxononanoate synthase  100 
 
 
397 aa  817    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.743244  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4686  8-amino-7-oxononanoate synthase  59.69 
 
 
396 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2100  8-amino-7-oxononanoate synthase  59.48 
 
 
386 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0495  8-amino-7-oxononanoate synthase  60 
 
 
396 aa  462  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5175  8-amino-7-oxononanoate synthase  59.57 
 
 
392 aa  457  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.701145  normal  0.281343 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0393  8-amino-7-oxononanoate synthase  61.46 
 
 
390 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221946  normal  0.405547 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4839  8-amino-7-oxononanoate synthase  60.65 
 
 
390 aa  450  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.908198 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05990  8-amino-7-oxononanoate synthase  60.66 
 
 
391 aa  446  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0363  8-amino-7-oxononanoate synthase  61.99 
 
 
390 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0601  8-amino-7-oxononanoate synthase  57.14 
 
 
401 aa  437  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06510  8-amino-7-oxononanoate synthase  57.4 
 
 
401 aa  437  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0267336  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0133  8-amino-7-oxononanoate synthase  58.07 
 
 
392 aa  432  1e-120  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4087  8-amino-7-oxononanoate synthase  58.86 
 
 
389 aa  432  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.996565  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0389  8-amino-7-oxononanoate synthase  61.73 
 
 
390 aa  428  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.598299 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1126  8-amino-7-oxononanoate synthase  59.68 
 
 
387 aa  426  1e-118  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2435  8-amino-7-oxononanoate synthase  54.4 
 
 
391 aa  423  1e-117  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0783032 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2755  8-amino-7-oxononanoate synthase  54.47 
 
 
394 aa  416  9.999999999999999e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1130  8-amino-7-oxononanoate synthase  53.65 
 
 
396 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2068  8-amino-7-oxononanoate synthase  51.3 
 
 
387 aa  378  1e-103  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1979  8-amino-7-oxononanoate synthase  50.26 
 
 
397 aa  373  1e-102  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2897  8-amino-7-oxononanoate synthase  49.61 
 
 
387 aa  364  2e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786658  normal  0.0952013 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3456  8-amino-7-oxononanoate synthase  52 
 
 
403 aa  361  1e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0094566  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1923  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.58 
 
 
392 aa  351  1e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00136658 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2288  8-amino-7-oxononanoate synthase  51.68 
 
 
393 aa  351  2e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.50363  normal  0.0796001 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4032  8-amino-7-oxononanoate synthase  48.04 
 
 
410 aa  350  2e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.749674 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1166  8-amino-7-oxononanoate synthase  53.39 
 
 
386 aa  344  2e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.609374  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2163  8-amino-7-oxononanoate synthase  52.51 
 
 
399 aa  338  7e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0962  8-amino-7-oxononanoate synthase  50.63 
 
 
402 aa  337  1.9999999999999998e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0636992  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3642  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.93 
 
 
408 aa  335  1e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1835  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.19 
 
 
384 aa  332  6e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1832  8-amino-7-oxononanoate synthase  50 
 
 
405 aa  331  2e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0859  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.74 
 
 
383 aa  326  4.0000000000000003e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0530  8-amino-7-oxononanoate synthase  48.9 
 
 
396 aa  324  2e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal  0.730891 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3246  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.46 
 
 
391 aa  322  5e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0411  8-amino-7-oxononanoate synthase  48.59 
 
 
394 aa  318  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.955865  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0101  8-amino-7-oxononanoate synthase  48.59 
 
 
394 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2963  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.59 
 
 
385 aa  318  1e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.11537  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1579  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.28 
 
 
405 aa  318  1e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.207826  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0390  8-amino-7-oxononanoate synthase  48.59 
 
 
394 aa  318  1e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2015  8-amino-7-oxononanoate synthase  48.59 
 
 
394 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2271  8-amino-7-oxononanoate synthase  48.59 
 
 
394 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3079  8-amino-7-oxononanoate synthase  48.59 
 
 
394 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0831  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.38 
 
 
389 aa  317  2e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0573  8-amino-7-oxononanoate synthase  48.33 
 
 
394 aa  317  3e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0172  8-amino-7-oxononanoate synthase  50.14 
 
 
394 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3430  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.81 
 
 
389 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0707061 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0154  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.86 
 
 
411 aa  313  3.9999999999999997e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2538  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.7 
 
 
384 aa  312  5.999999999999999e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00272507  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2629  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.83 
 
 
391 aa  311  1e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0339  8-amino-7-oxononanoate synthase  48.33 
 
 
394 aa  311  1e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0945  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.9 
 
 
385 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0094418  normal  0.966825 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1506  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.59 
 
 
385 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00648154  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0890  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.9 
 
 
385 aa  310  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.866629  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0922  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.64 
 
 
385 aa  310  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1372  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.9 
 
 
415 aa  309  5.9999999999999995e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.134715  normal  0.0814825 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0831  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.64 
 
 
385 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000743948  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0898  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.83 
 
 
405 aa  308  1.0000000000000001e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.632855 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2556  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.63 
 
 
410 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00135119  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01808  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.49 
 
 
383 aa  306  3e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1267  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.9 
 
 
384 aa  306  3e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.123615  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0859  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.38 
 
 
385 aa  306  5.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.123721  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0148  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.87 
 
 
408 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0247  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.9 
 
 
392 aa  304  1.0000000000000001e-81  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00743  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.26 
 
 
384 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000953076  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2867  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.26 
 
 
384 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00148387  normal  0.0589709 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00760  hypothetical protein  46.26 
 
 
384 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00012618  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0830  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.26 
 
 
384 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000670257  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0924  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.55 
 
 
384 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00304993  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0115  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.28 
 
 
406 aa  302  7.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.257966  normal  0.744496 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2866  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.98 
 
 
384 aa  301  1e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000062905  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3561  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.63 
 
 
397 aa  301  1e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0270592 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0168  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.53 
 
 
411 aa  301  1e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0839  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.26 
 
 
384 aa  300  2e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000113881  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0446  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.77 
 
 
394 aa  300  2e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0710  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.66 
 
 
401 aa  300  3e-80  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0628  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.66 
 
 
401 aa  300  3e-80  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0799  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.98 
 
 
384 aa  300  4e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000322202  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2576  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.26 
 
 
384 aa  300  4e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000828217  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003870  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.49 
 
 
383 aa  299  5e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.697906  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1436  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.91 
 
 
415 aa  298  1e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.469568 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02875  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.7 
 
 
379 aa  298  1e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4264  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.77 
 
 
394 aa  298  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.122877 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2045  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.3 
 
 
390 aa  298  2e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0152681  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1326  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.19 
 
 
384 aa  296  3e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2967  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.74 
 
 
396 aa  294  1e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0631  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.87 
 
 
384 aa  295  1e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00112054  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1041  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.93 
 
 
384 aa  294  2e-78  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.660772  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0842  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.41 
 
 
396 aa  294  2e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0934  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.64 
 
 
384 aa  294  2e-78  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3534  8-amino-7-oxononanoate synthase  49.43 
 
 
398 aa  294  2e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1478  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.06 
 
 
416 aa  293  3e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0815886  normal  0.237917 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3452  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.42 
 
 
397 aa  293  4e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.427892  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3843  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.12 
 
 
412 aa  292  6e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2811  8-amino-7-oxononanoate synthase  46 
 
 
410 aa  291  1e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0927448  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2441  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.04 
 
 
382 aa  290  2e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0723004  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1665  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.48 
 
 
390 aa  290  3e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000158621  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2093  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.7 
 
 
391 aa  290  3e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3602  8-amino-7-oxononanoate synthase  49.71 
 
 
398 aa  289  5.0000000000000004e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1802  aminotransferase class I and II  46.24 
 
 
397 aa  285  7e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2595  putative 7-keto-8-aminopelargonic acid synthetase  40.21 
 
 
382 aa  285  1.0000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.855243  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>