131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3036 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_3036  hypothetical protein  100 
 
 
303 aa  622  1e-177  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.364678  hitchhiker  0.000035288 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2706  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  47.99 
 
 
299 aa  301  1e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00102346  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1212  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  48.77 
 
 
298 aa  296  4e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000148671  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0944  hypothetical protein  50.53 
 
 
301 aa  289  3e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00274123  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1101  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  47.37 
 
 
298 aa  288  8e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0556162  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1312  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  47.08 
 
 
300 aa  288  8e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000103615  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1076  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  47.96 
 
 
318 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.651149  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1178  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  49.65 
 
 
311 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000024561  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3211  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  49.3 
 
 
311 aa  279  3e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000118856  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1084  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  49.3 
 
 
311 aa  278  6e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000500246  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3507  hypothetical protein  48.94 
 
 
300 aa  278  7e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3114  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  48.94 
 
 
302 aa  277  2e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000171707  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1026  BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family protein  45.83 
 
 
297 aa  276  3e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2935  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  48.94 
 
 
302 aa  276  3e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000122964  normal  0.641945 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1116  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  47.54 
 
 
299 aa  276  3e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0080309  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1144  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  48.94 
 
 
311 aa  276  3e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000862311  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3017  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  48.59 
 
 
302 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00939797  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0298  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  40.85 
 
 
327 aa  233  3e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3124  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  38.06 
 
 
299 aa  197  3e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.025848  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0124  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  37.37 
 
 
289 aa  186  4e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1653  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  37.11 
 
 
293 aa  185  7e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0892044  normal  0.99562 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00859  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  35.62 
 
 
304 aa  185  7e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.364641  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2582  glucosamine kinase  35 
 
 
291 aa  174  9.999999999999999e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03429  hypothetical protein  35.56 
 
 
296 aa  170  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0143  hypothetical protein  35.21 
 
 
294 aa  167  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002580  glucosamine kinase GpsK  34.86 
 
 
296 aa  166  2.9999999999999998e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0709  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  33.56 
 
 
297 aa  160  3e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.87452  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3677  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  33.45 
 
 
302 aa  154  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.284324  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0657  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  33.94 
 
 
303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3528  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  32.65 
 
 
304 aa  144  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.400784  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3136  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  38.56 
 
 
308 aa  145  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.235099  normal  0.216629 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3545  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  31.83 
 
 
295 aa  134  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00374918  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2647  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  32.37 
 
 
294 aa  132  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.43955  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0514  hypothetical protein  31.83 
 
 
295 aa  131  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.313056  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0448  hypothetical protein  31.83 
 
 
295 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2907  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  31.91 
 
 
294 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.610469  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1118  hypothetical protein  32.41 
 
 
288 aa  120  3.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.141712  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1023  hypothetical protein  32.41 
 
 
288 aa  120  3.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2984  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  31.13 
 
 
298 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000332837 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3407  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  32.03 
 
 
294 aa  105  8e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.971323  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2705  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  30.4 
 
 
286 aa  105  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4172  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  33.86 
 
 
293 aa  101  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2501  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  30.75 
 
 
322 aa  98.6  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.251781  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2861  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  32.1 
 
 
293 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0246  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  32.1 
 
 
293 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0228  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  32.1 
 
 
293 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0159  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  31.37 
 
 
293 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.850348  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0172  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  30.74 
 
 
293 aa  93.2  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0624  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  34.85 
 
 
296 aa  92.4  9e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.685104  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0958  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  32.1 
 
 
298 aa  91.7  1e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3348  BadF/BadG/BcrA/BcrD type ATPase  31 
 
 
293 aa  90.9  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.95774 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0155  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  31.65 
 
 
293 aa  90.5  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.999055 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1358  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  29.41 
 
 
300 aa  90.1  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.541544 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3866  BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family protein  30.07 
 
 
311 aa  90.1  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3827  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  27.46 
 
 
293 aa  89.4  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.594818  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3445  BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family protein  30.07 
 
 
311 aa  89  9e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.21954  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1674  BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family protein  30.07 
 
 
311 aa  89  9e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3947  BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family protein  30.07 
 
 
311 aa  89  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3105  BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family protein  30.07 
 
 
311 aa  89  9e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.104317  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2870  hypothetical protein  30.07 
 
 
296 aa  89  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0087  BadF/BadG/BcrA/BcrD family ATPase  30.07 
 
 
296 aa  89  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.992685  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0107  putative Aryl-alcohol dehydrogenase  27.08 
 
 
293 aa  88.6  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.135343  normal  0.592025 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34710  predicted N-acetylglucosamine kinase  33.2 
 
 
318 aa  89  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.11671  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4217  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  31.46 
 
 
305 aa  87  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0191296 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2474  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  29.96 
 
 
277 aa  85.9  8e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.21644 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1676  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  30.08 
 
 
326 aa  85.1  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2007  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  31.85 
 
 
320 aa  84  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0254624  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1791  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  26.77 
 
 
300 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.51133  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3192  BadF/BadG/BcrA/BcrD family ATPase  29.35 
 
 
296 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2852  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  34.01 
 
 
319 aa  77.8  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4169  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  31.27 
 
 
295 aa  77  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0976087  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1633  N-acetylglucosamine kinase  28.47 
 
 
307 aa  76.6  0.0000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.935257 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3151  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  26.69 
 
 
295 aa  75.9  0.0000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000102812  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1942  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  29.7 
 
 
344 aa  75.9  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.101492 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0319  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  28.81 
 
 
325 aa  73.9  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.414732  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2483  hypothetical protein  27.54 
 
 
299 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0974  hypothetical protein  29.07 
 
 
369 aa  72.4  0.000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.131863 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2257  ATPase family protein  27.54 
 
 
299 aa  72  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.163668  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3999  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  32.81 
 
 
332 aa  71.6  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2294  hypothetical protein  24.83 
 
 
303 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2466  hypothetical protein  24.83 
 
 
303 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.663759  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3614  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  32.65 
 
 
334 aa  70.1  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.480053  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1511  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  30.57 
 
 
299 aa  69.7  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4757  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  29.17 
 
 
316 aa  69.3  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2598  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  30.19 
 
 
295 aa  68.9  0.00000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3353  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  25.58 
 
 
300 aa  68.6  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0292  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  28.57 
 
 
335 aa  68.6  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.353366  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0391  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  33.9 
 
 
313 aa  68.9  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.453168  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2215  ATPase family protein  25.95 
 
 
299 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2562  hypothetical protein  25.85 
 
 
299 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.516208  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2794  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  29.28 
 
 
314 aa  67.4  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3942  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  32.32 
 
 
336 aa  66.2  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2499  hypothetical protein  26.47 
 
 
299 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0520559  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1855  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  29.02 
 
 
307 aa  65.9  0.0000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.591681 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1491  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  25.25 
 
 
319 aa  64.7  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.120756  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1539  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  25.25 
 
 
319 aa  64.7  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0371  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  23.84 
 
 
322 aa  64.7  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2421  hypothetical protein  27.5 
 
 
297 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2273  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  24.51 
 
 
299 aa  62.4  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.27571  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2909  hypothetical protein  26.16 
 
 
297 aa  62.4  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.464357 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>