More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2993 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  100 
 
 		 863 aa  1781    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  51.14 
 
 		 982 aa  437  1e-121  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2494  hypothetical protein  29.93 
 
 		 610 aa  202  3e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2929  hypothetical protein  41.81 
 
 		 673 aa  199  2.0000000000000003e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3003  hypothetical protein  38.49 
 
 		 1167 aa  198  3e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.25795  hitchhiker  0.000812606 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2832  hypothetical protein  38.72 
 
 		 877 aa  182  2.9999999999999997e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0897926  normal  0.0109857 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4512  Carbohydrate binding family 6  36.8 
 
 		 1391 aa  176  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472745 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4149  glycoside hydrolase family 5  25.42 
 
 		 590 aa  154  8e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.533031  normal  0.39445 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2580  glycoside hydrolase family 18  27.02 
 
 		 1115 aa  150  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.492458  normal  0.158237 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4045  glycoside hydrolase family 5  29.83 
 
 		 573 aa  144  6e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0652  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  34.33 
 
 		 569 aa  143  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05710  endoglucanase  27.72 
 
 		 601 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  33.23 
 
 		 1707 aa  140  8.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3753  Carbohydrate binding family 6  33.33 
 
 		 639 aa  124  8e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000661715 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7479  Carbohydrate binding family 6  31.65 
 
 		 918 aa  123  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  48.74 
 
 		 869 aa  117  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1779  Carbohydrate binding family 6  26.19 
 
 		 526 aa  116  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00214562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  41.73 
 
 		 1132 aa  115  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0078  Carbohydrate binding family 6  28.13 
 
 		 1234 aa  114  9e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.511687 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0488  Carbohydrate binding family 6  27.76 
 
 		 1799 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0943  glycoside hydrolase family protein  26.13 
 
 		 493 aa  112  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4284  Carbohydrate binding family 6  37.23 
 
 		 705 aa  111  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.162289  normal  0.0937971 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  38.73 
 
 		 389 aa  111  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1344  periplasmic copper-binding  29.06 
 
 		 954 aa  111  7.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283677  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0112  hypothetical protein  39.11 
 
 		 1024 aa  110  8.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2193  carbohydrate-binding family 6 protein  31.4 
 
 		 948 aa  110  9.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.43679  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1838  Carbohydrate binding family 6  29.7 
 
 		 1035 aa  110  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.533489  normal  0.441295 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4175  glycoside hydrolase family protein  36 
 
 		 541 aa  108  6e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1428  Ricin B lectin  38.04 
 
 		 1139 aa  107  8e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.737248  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39320  endoglucanase family 5 glycoside hydrolase  29.32 
 
 		 481 aa  106  2e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.280438 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2137  Carbohydrate binding family 6  28.06 
 
 		 1262 aa  103  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.138075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  39.67 
 
 		 884 aa  102  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1756  Carbohydrate binding family 6  26.67 
 
 		 930 aa  103  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.127893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2186  glycoside hydrolase family 18  42.98 
 
 		 536 aa  101  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0363978  hitchhiker  0.000898498 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0216  hypothetical protein  29.84 
 
 		 630 aa  100  8e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.80342 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1873  carbohydrate-binding family 6 protein  28.57 
 
 		 1091 aa  100  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00027012  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3787  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  30.56 
 
 		 945 aa  99.4  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339008  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07770  conserved hypothetical protein  26.56 
 
 		 847 aa  99  3e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.622601  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3892  hypothetical protein  38.67 
 
 		 550 aa  99.4  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0718789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  38.52 
 
 		 957 aa  99  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02120  expressed protein  27.41 
 
 		 470 aa  97.4  9e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3260  hypothetical protein  36.88 
 
 		 500 aa  97.1  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293464 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39160  Endoglucanase C (EGC) (Endo-1,4-beta-glucanase) (Cellulase C)  28.79 
 
 		 483 aa  97.1  1e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.151498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66312  Endo-1,4-beta-glucanase  28.86 
 
 		 481 aa  97.4  1e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0233843 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  25.29 
 
 		 2073 aa  95.9  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1104  glycoside hydrolase family protein  30.21 
 
 		 468 aa  95.1  5e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0389149  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1962  Endo-1,4-beta-xylanase  39.19 
 
 		 411 aa  95.1  5e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3536  Carbohydrate binding family 6  39.02 
 
 		 726 aa  95.1  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.414252  normal  0.419471 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2693  glycoside hydrolase family protein  25.54 
 
 		 489 aa  94.4  8e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  29.04 
 
 		 618 aa  94.4  8e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  38.57 
 
 		 823 aa  92.8  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2807  glycoside hydrolase family protein  30 
 
 		 343 aa  92  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000151011  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  36.81 
 
 		 819 aa  92  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2996  endoglucanase-like  25.56 
 
 		 853 aa  91.3  6e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0689244  hitchhiker  0.000000433363 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1271  carbohydrate-binding family 6 protein  28.97 
 
 		 679 aa  90.9  8e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  37.59 
 
 		 870 aa  90.5  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2319  family 5 glycoside hydrolase  27.84 
 
 		 456 aa  90.5  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.182404  normal  0.298559 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  37.28 
 
 		 383 aa  90.1  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  35.21 
 
 		 1380 aa  89.4  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6229  Carbohydrate binding family 6  41.38 
 
 		 461 aa  89  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  35.21 
 
 		 1356 aa  88.6  5e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0129  carbohydrate-binding family 6 protein  39.1 
 
 		 469 aa  87.8  7e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.235369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  34.72 
 
 		 802 aa  87.8  8e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2178  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  27.92 
 
 		 673 aa  87  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00232015  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.03 
 
 		 1321 aa  86.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4084  Ricin B lectin  34.27 
 
 		 1413 aa  86.3  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  40.78 
 
 		 840 aa  86.3  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  33.57 
 
 		 845 aa  84.7  0.000000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4337  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.39 
 
 		 933 aa  84.3  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.202539 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  32.24 
 
 		 476 aa  84  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3324  carbohydrate-binding family 6 protein  34.81 
 
 		 972 aa  84.3  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4332  Ricin B lectin  36.5 
 
 		 615 aa  83.2  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.817761  normal  0.0720026 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  35.03 
 
 		 494 aa  83.2  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  35.42 
 
 		 719 aa  83.6  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  35.66 
 
 		 503 aa  82.8  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5224  Carbohydrate binding family 6  39.55 
 
 		 566 aa  82  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.105995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4856  Ricin B lectin  32.94 
 
 		 569 aa  81.6  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173308  normal  0.0148414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2671  Carbohydrate binding family 6  33.33 
 
 		 581 aa  81.6  0.00000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.684309 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0493  Carbohydrate binding family 6  30.23 
 
 		 627 aa  81.6  0.00000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  32.41 
 
 		 777 aa  81.3  0.00000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2194  carbohydrate-binding family 6 protein  39.53 
 
 		 501 aa  81.3  0.00000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.29628  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3927  peptidyl-Asp metallopeptidase. metallo peptidase. MEROPS family M72  38.52 
 
 		 465 aa  80.9  0.00000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1703  hypothetical protein  37.76 
 
 		 392 aa  80.1  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.595343 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  30.58 
 
 		 503 aa  79.3  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  34.81 
 
 		 691 aa  80.1  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2530  Ricin B lectin  39.71 
 
 		 412 aa  80.1  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00551776  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1656  Carbohydrate binding family 6  39.85 
 
 		 951 aa  80.1  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00148801  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  32.31 
 
 		 965 aa  79.3  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  27.3 
 
 		 1338 aa  79  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  33.33 
 
 		 537 aa  78.6  0.0000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  31.68 
 
 		 474 aa  78.6  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  37.96 
 
 		 786 aa  78.2  0.0000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  28.91 
 
 		 1295 aa  78.2  0.0000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1014  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  32.43 
 
 		 472 aa  77.8  0.0000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6290  Ricin B lectin  28.73 
 
 		 1259 aa  77  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0798248 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5674  Ricin B lectin  35.66 
 
 		 425 aa  77  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510311 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  39.62 
 
 		 855 aa  76.6  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0529993 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78873  Glucan 1,3-beta-glucosidase precursor (Exo-1,3-beta-glucanase)  28.05 
 
 		 438 aa  75.9  0.000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1290  endoglucanase  29.26 
 
 		 393 aa  75.5  0.000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00901224  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1445  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  32.82 
 
 		 473 aa  75.1  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>