16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2985 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_2985  hypothetical protein  100 
 
 
667 aa  1357    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000400495  hitchhiker  0.00618409 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7141  coagulation factor 5/8 type domain protein  36.62 
 
 
538 aa  89.7  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174227  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3238  hypothetical protein  27.51 
 
 
652 aa  83.6  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000359216  normal  0.364609 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0761  hypothetical protein  25.94 
 
 
363 aa  79.3  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.842427 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7283  hypothetical protein  28.38 
 
 
377 aa  72.8  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.581256  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3918  hypothetical protein  41.18 
 
 
409 aa  68.2  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135148  normal  0.570167 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3428  hypothetical protein  37.25 
 
 
720 aa  67  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.660009  hitchhiker  0.0000342661 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2261  hypothetical protein  27.86 
 
 
832 aa  62.4  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000443628  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28530  hypothetical protein  28.95 
 
 
364 aa  59.7  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0528408  normal  0.0603049 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0704  16S rRNA dimethylase  37.5 
 
 
675 aa  55.5  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0839  hypothetical protein  29.11 
 
 
1331 aa  54.7  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3239  cellulase  41.46 
 
 
638 aa  51.6  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00277111  normal  0.266356 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2044  parallel beta-helix repeat-containing protein  24.31 
 
 
367 aa  50.1  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.039257  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  28.7 
 
 
1300 aa  47  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3196  hypothetical protein  24.27 
 
 
657 aa  45.1  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00339167  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1278  hypothetical protein  28.28 
 
 
663 aa  44.3  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>