More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2941 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2941  glutamine amidotransferase related enzyme  100 
 
 		 237 aa  487  1e-137  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3925  peptidase C26  43.04 
 
 		 240 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.792522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3159  peptidase C26  38.49 
 
 		 261 aa  166  2e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2009  peptidase C26  37.56 
 
 		 245 aa  165  6.9999999999999995e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4921  peptidase C26  35.48 
 
 		 299 aa  162  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0191  peptidase C26  36.61 
 
 		 274 aa  156  3e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.300566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2749  peptidase C26  36.96 
 
 		 262 aa  152  4e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.101154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2671  peptidase C26  37.16 
 
 		 229 aa  150  1e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0625878 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1160  peptidase C26  37.5 
 
 		 222 aa  150  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1620  glutamine amidotransferase-like  32.95 
 
 		 278 aa  145  5e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000108554  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1378  peptidase C26  40.74 
 
 		 253 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.735257  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1636  peptidase C26  35.06 
 
 		 252 aa  123  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.370641  normal  0.14821 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0982  glutamine amidotransferase, class I  40.21 
 
 		 278 aa  122  6e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1964  peptidase C26  38.14 
 
 		 239 aa  122  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.918763 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0921  glutamine amidotransferase, class I  40.21 
 
 		 278 aa  122  6e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.216457  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0954  peptidase C26  38.83 
 
 		 264 aa  121  9.999999999999999e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000028221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0608  peptidase C26  40.88 
 
 		 237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.982002  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3248  peptidase C26  40.33 
 
 		 251 aa  119  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4408  peptidase C26  43.37 
 
 		 262 aa  117  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0361  peptidase C26  39.55 
 
 		 253 aa  117  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4064  peptidase C26  33.47 
 
 		 256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.529097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2021  peptidase C26  35.32 
 
 		 250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3050  peptidase C26  36.56 
 
 		 250 aa  116  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2428  peptidase C26  37.5 
 
 		 248 aa  115  5e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2164  peptidase C26  37.23 
 
 		 233 aa  115  6.9999999999999995e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000115799  hitchhiker  0.0000699279 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3790  hypothetical protein  34.71 
 
 		 254 aa  112  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0319  peptidase C26  36.36 
 
 		 233 aa  112  6e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.783639 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1477  peptidase C26  35.44 
 
 		 237 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21880  peptidase C26  34.92 
 
 		 231 aa  112  7.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2155  peptidase C26  30.94 
 
 		 250 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159832 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2528  glutamine amidotransferase, class I  30.94 
 
 		 250 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2816  peptidase C26  38.1 
 
 		 255 aa  111  9e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3375  peptidase C26  31.47 
 
 		 259 aa  111  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.290232 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2162  peptidase C26  33.93 
 
 		 238 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1878  hypothetical protein  35.75 
 
 		 230 aa  110  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1031  glutamine amidotransferase  36.51 
 
 		 245 aa  110  1.0000000000000001e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000341197  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2261  peptidase C26  35.68 
 
 		 312 aa  111  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19230  predicted glutamine amidotransferase  34.63 
 
 		 273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0453236 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3356  peptidase C26  33.86 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.95955  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3677  Gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  32.23 
 
 		 259 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.272698 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4207  peptidase C26  34.92 
 
 		 298 aa  109  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.914824 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0438  peptidase C26  34.72 
 
 		 255 aa  110  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35287  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48870  glutamine amidotransferase  34.36 
 
 		 250 aa  109  4.0000000000000004e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0730  peptidase C26  36.07 
 
 		 238 aa  108  6e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1701  glutamine amidotransferase, class II/dipeptidase  35.36 
 
 		 602 aa  107  1e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12875  amidotransferase  31.02 
 
 		 272 aa  107  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.853598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4137  peptidase C26  37.13 
 
 		 251 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0651  glutamine amidotransferase class-I  33.76 
 
 		 242 aa  107  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.64648  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0983  peptidase C26  37.13 
 
 		 396 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.290196  normal  0.093467 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0545  peptidase C26  37.13 
 
 		 396 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.839837  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3012  peptidase C26  34.02 
 
 		 254 aa  108  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1024  peptidase C26  37.13 
 
 		 396 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2279  peptidase C26  31.84 
 
 		 280 aa  108  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249131 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2865  peptidase C26  36.55 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.136742  normal  0.196965 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2887  peptidase C26  32.09 
 
 		 268 aa  107  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1757  peptidase C26  31.3 
 
 		 231 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.721348  normal  0.077261 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2058  peptidase C26  30.8 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1963  peptidase C26  37.79 
 
 		 254 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.153313  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1429  glutamine amidotransferase (class I), putative  32.33 
 
 		 231 aa  107  2e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2371  peptidase C26  37.13 
 
 		 405 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0717  peptidase C26  35.54 
 
 		 479 aa  106  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.777258  normal  0.355316 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2104  peptidase C26  34.39 
 
 		 240 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.297238  normal  0.0236912 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2041  peptidase C26  34.39 
 
 		 240 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755428  normal  0.5084 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4065  peptidase C26  34.18 
 
 		 267 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.641789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08940  predicted glutamine amidotransferase  35.05 
 
 		 244 aa  105  4e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0342497  normal  0.666279 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0799  peptidase C26  35.08 
 
 		 235 aa  105  6e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1092  peptidase C26  32.31 
 
 		 253 aa  105  8e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.337501  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1072  peptidase C26  33.13 
 
 		 259 aa  105  8e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0143  peptidase C26  36.13 
 
 		 238 aa  105  8e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1141  putative transferase  36.08 
 
 		 266 aa  104  9e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0928367 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3598  peptidase C26  35.57 
 
 		 269 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.420407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3226  peptidase C26  40.12 
 
 		 285 aa  104  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2010  peptidase C26  35.6 
 
 		 243 aa  104  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0361829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0075  peptidase C26  35.2 
 
 		 244 aa  104  1e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.70164  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03870  putative glutamine amidotransferase  35.26 
 
 		 250 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0837  peptidase C26  34.8 
 
 		 277 aa  104  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.347165  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3742  peptidase C26  30.74 
 
 		 237 aa  104  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2318  peptidase C26  35.05 
 
 		 269 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2523  peptidase C26  35.83 
 
 		 252 aa  103  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3097  peptidase C26  35.57 
 
 		 269 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.925767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4215  peptidase C26  32.97 
 
 		 253 aa  103  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1082  peptidase C26  34.83 
 
 		 259 aa  103  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.3752 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0888  peptidase C26  35.8 
 
 		 427 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1789  glutamine amidotransferase  34.44 
 
 		 241 aa  103  2e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000030649  hitchhiker  5.3956e-25 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2112  glutamine amidotransferase class-I:peptidase C26  35.88 
 
 		 260 aa  103  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0486861  normal  0.283308 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0900  peptidase C26  35.8 
 
 		 399 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.332784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0954  putative amidotransferase  35.8 
 
 		 251 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.716357 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1822  peptidase C26  35.71 
 
 		 245 aa  103  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0388  putative glutamine amidotransferase  34.68 
 
 		 250 aa  102  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.55028  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0053  peptidase C26  31.12 
 
 		 256 aa  102  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2536  peptidase C26  33.87 
 
 		 237 aa  102  7e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1059  peptidase C26  31.79 
 
 		 253 aa  101  9e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.22875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2184  peptidase C26  33.33 
 
 		 275 aa  101  9e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.297323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0944  peptidase C26  34.71 
 
 		 253 aa  101  9e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3033  peptidase C26  35.4 
 
 		 493 aa  101  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.998523  decreased coverage  0.0021965 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3803  peptidase C26  33.67 
 
 		 267 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2465  peptidase C26  30.93 
 
 		 247 aa  100  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000302907  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1797  glutamine amidotransferase  34.24 
 
 		 238 aa  101  1e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.239238  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0076  peptidase C26  34.21 
 
 		 236 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.0652283 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2813  peptidase C26  33.66 
 
 		 269 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>