127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2843 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2843  extracellular nuclease-like  100 
 
 		 945 aa  1921    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0894144  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  50.23 
 
 		 2667 aa  593  1e-168  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  45.42 
 
 		 2775 aa  539  1e-151  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  46.92 
 
 		 2796 aa  510  1e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1033  endonuclease I  39.23 
 
 		 1503 aa  456  1.0000000000000001e-126  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.8795  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01770  predicted extracellular nuclease  37.36 
 
 		 863 aa  413  1e-114  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.609758  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1701  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.58 
 
 		 1148 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.427243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1683  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.75 
 
 		 1148 aa  382  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2774  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.44 
 
 		 1641 aa  360  5e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0508724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.75 
 
 		 2346 aa  352  2e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2828  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.53 
 
 		 1641 aa  348  3e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5031  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.51 
 
 		 1075 aa  345  2e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0324828  normal  0.671967 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3281  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.72 
 
 		 1123 aa  342  2.9999999999999998e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.310372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1201  PKD domain-containing protein  32.79 
 
 		 780 aa  321  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13340  extracellular nuclease  32.99 
 
 		 780 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0905495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0270  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.41 
 
 		 641 aa  315  2.9999999999999996e-84  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.527105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0358  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.87 
 
 		 826 aa  311  4e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1477  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.53 
 
 		 947 aa  310  5.9999999999999995e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0419  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.88 
 
 		 1052 aa  307  7e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0131268  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2272  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.9 
 
 		 942 aa  301  4e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000211243  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3284  extracellular nuclease-like protein  33.86 
 
 		 795 aa  294  6e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.512865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1361  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.15 
 
 		 573 aa  293  9e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.153605  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0972  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.45 
 
 		 1266 aa  287  8e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.705534  normal  0.368107 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01224  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  33.81 
 
 		 1346 aa  284  5.000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2634  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  31.15 
 
 		 1310 aa  283  9e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1911  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.76 
 
 		 940 aa  279  2e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000962851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1601  PKD domain-containing protein  32.81 
 
 		 948 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1595  PKD domain-containing protein  33.22 
 
 		 948 aa  273  1e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.230765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0758  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.57 
 
 		 818 aa  273  1e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0350969 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1568  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.35 
 
 		 942 aa  272  2e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.10217  normal  0.0647375 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1819  PKD domain-containing protein  32.64 
 
 		 944 aa  270  8.999999999999999e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2467  PKD domain containing protein  32.83 
 
 		 944 aa  270  8.999999999999999e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.183397  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1104  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.15 
 
 		 601 aa  269  2e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.604194 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1534  PKD domain-containing protein  32.73 
 
 		 948 aa  269  2e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.97112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1622  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.31 
 
 		 944 aa  269  2e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4989  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.88 
 
 		 848 aa  268  2.9999999999999995e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.170324  normal  0.316341 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2170  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.31 
 
 		 945 aa  267  7e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.160261 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1811  PKD domain-containing protein  32.52 
 
 		 944 aa  267  7e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1858  PKD domain-containing protein  32.29 
 
 		 944 aa  266  2e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0828  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.31 
 
 		 818 aa  264  6e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.182782 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1844  extracellular nuclease, putative  31.93 
 
 		 948 aa  261  5.0000000000000005e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4713  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.88 
 
 		 1284 aa  257  7e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814549 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4327  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.31 
 
 		 653 aa  254  4.0000000000000004e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.240387  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1707  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.46 
 
 		 955 aa  253  1e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5193  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.15 
 
 		 603 aa  245  3e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.79221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2637  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  33.39 
 
 		 624 aa  243  7.999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.541694  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0259  putative extracellular nuclease  33.39 
 
 		 624 aa  243  1e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1440  putative extracellular nuclease  33.39 
 
 		 624 aa  243  1e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1637  putative extracellular nuclease  33.39 
 
 		 624 aa  243  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2498  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  33.39 
 
 		 624 aa  243  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.209723  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0292  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  33.39 
 
 		 624 aa  243  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.262594  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2760  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.62 
 
 		 604 aa  241  5e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5194  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.95 
 
 		 604 aa  240  6.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.337928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4098  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.2 
 
 		 604 aa  240  8e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.535753 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4749  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.2 
 
 		 604 aa  239  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3418  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.2 
 
 		 604 aa  239  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3357  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.1 
 
 		 604 aa  239  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0532  extracellular nuclease, putative  32.76 
 
 		 622 aa  238  3e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2286  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.88 
 
 		 621 aa  233  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.127089 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4553  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.57 
 
 		 620 aa  231  5e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3810  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.57 
 
 		 599 aa  231  6e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.193506 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3714  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.57 
 
 		 620 aa  230  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.495775 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5536  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.65 
 
 		 627 aa  226  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.8971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3711  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.8 
 
 		 600 aa  226  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.187879  normal  0.194712 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0934  extracellular nuclease  33.39 
 
 		 514 aa  224  7e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0110  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.73 
 
 		 586 aa  211  4e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.738543  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1364  putative exported nuclease  28.6 
 
 		 890 aa  211  7e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.587865  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00081  nuclease  27.6 
 
 		 982 aa  206  2e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3615  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.88 
 
 		 868 aa  204  6e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.705484  normal  0.0425486 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1063  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.53 
 
 		 554 aa  197  6e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002273  predicted extracellular nuclease  27.83 
 
 		 984 aa  196  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3943  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.91 
 
 		 885 aa  196  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.439448 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03816  nuclease  31.28 
 
 		 572 aa  196  2e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0201  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.59 
 
 		 481 aa  194  5e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.418254  normal  0.692055 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0677  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.81 
 
 		 1525 aa  193  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.608053  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3944  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.65 
 
 		 892 aa  191  5e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000110843  normal  0.791963 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1631  5'-Nucleotidase domain protein  29.14 
 
 		 1652 aa  190  1e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.453464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2322  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.5 
 
 		 929 aa  189  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.451149  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0890  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.97 
 
 		 870 aa  189  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.298934  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2198  hypothetical protein  26.2 
 
 		 869 aa  187  6e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0825  5'-Nucleotidase domain protein  30.1 
 
 		 1512 aa  187  9e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3595  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.86 
 
 		 870 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0433948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0697  5'-Nucleotidase domain protein  30.62 
 
 		 1506 aa  186  3e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.208594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3472  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.86 
 
 		 870 aa  183  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0137942  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3091  5'-Nucleotidase domain protein  29.35 
 
 		 1577 aa  182  2.9999999999999997e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3397  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.95 
 
 		 870 aa  181  7e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00146831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3033  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.64 
 
 		 870 aa  179  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.441038  normal  0.600162 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0941  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.53 
 
 		 870 aa  179  3e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.578163  normal  0.129599 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0904  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.96 
 
 		 870 aa  178  5e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00895191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1737  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.66 
 
 		 570 aa  177  7e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.979917  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1188  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.78 
 
 		 575 aa  176  9.999999999999999e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.219404  normal  0.0718602 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3009  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.7 
 
 		 876 aa  174  5e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00148055  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3718  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.51 
 
 		 870 aa  173  1e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33530  predicted extracellular nuclease  28.25 
 
 		 1591 aa  172  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0542188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2694  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.19 
 
 		 1010 aa  171  7e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.434546 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03610  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  28.97 
 
 		 902 aa  169  2e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.230337  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2945  extracellular nuclease  26.05 
 
 		 865 aa  169  2.9999999999999998e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.172583 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3193  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.28 
 
 		 871 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00309211  normal  0.0976082 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0364  5'-Nucleotidase domain protein  29.25 
 
 		 1577 aa  166  3e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.381679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2906  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.18 
 
 		 873 aa  164  9e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.435339  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>