More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2784 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_2784  heterocyst specific ABC-transporter, ATP-binding subunit DevA-like  100 
 
 
227 aa  462  1e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000473881 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2892  putative phytochrome sensor protein  57.58 
 
 
453 aa  257  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3799  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  57.47 
 
 
237 aa  256  3e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3750  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  57.47 
 
 
237 aa  256  3e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3638  ABC transporter-like  56.5 
 
 
250 aa  254  8e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1234  ABC transporter-like  52.91 
 
 
237 aa  248  7e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0135817  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0008  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  54.67 
 
 
232 aa  246  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0599  ABC transporter-like  51.91 
 
 
246 aa  240  1e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2251  ABC transporter-like  53.67 
 
 
225 aa  239  2.9999999999999997e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00178125  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0332  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  52.75 
 
 
241 aa  238  4e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.240707  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4444  DevA family ABC exporter ATP-binding subunit  51.14 
 
 
231 aa  236  3e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3588  ABC transporter-like  52.04 
 
 
244 aa  234  7e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0246542 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2729  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  50.45 
 
 
242 aa  233  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0090  DevA family ABC exporter ATP-binding subunit  49.77 
 
 
242 aa  231  9e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0564  ATPase  50.23 
 
 
237 aa  230  1e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0266482 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4105  ABC transporter-like  51.13 
 
 
231 aa  229  3e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.479165 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10131  ABC transporter, ATP-binding component  48.4 
 
 
251 aa  220  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0945741 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1433  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  46.33 
 
 
408 aa  217  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.532362  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0758  ABC transporter ATP-binding protein  49.11 
 
 
242 aa  216  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16611  ABC transporter, ATP-binding component  48.87 
 
 
229 aa  214  9e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.480332 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0154  ABC transporter ATP-binding protein  46.36 
 
 
230 aa  213  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07861  ABC transporter, ATP-binding component  46.36 
 
 
230 aa  213  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0716769  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08111  ABC transporter, ATP-binding component  48.21 
 
 
242 aa  213  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08101  ABC transporter, ATP-binding component  48.21 
 
 
242 aa  213  2.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08341  ABC transporter, ATP-binding component  47.09 
 
 
237 aa  210  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.119889  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1219  ATPase  48.42 
 
 
225 aa  202  4e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0615432  normal  0.958487 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1250  ATPase  49.77 
 
 
237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00443791  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3713  ABC transporter related  44.1 
 
 
233 aa  195  5.000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4022  ABC transporter, ATPase subunit  44.69 
 
 
259 aa  194  8.000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.91478  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0697  ABC transporter related  43.38 
 
 
232 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10839 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1629  ABC transporter related  44.86 
 
 
315 aa  188  5e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7063  putative ABC transporter, ATP-binding protein  44.84 
 
 
239 aa  187  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.107717  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3084  ABC transporter related  43.38 
 
 
230 aa  186  3e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.319445  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  44.64 
 
 
232 aa  186  3e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  44.64 
 
 
239 aa  185  4e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3893  ABC transporter related  45.12 
 
 
242 aa  185  6e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4480  ABC transporter related  47.27 
 
 
217 aa  185  6e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.859777  normal  0.280923 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0826  ATPase  42.6 
 
 
233 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1554  ABC transporter related  42.48 
 
 
246 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2147  ABC transporter related  51 
 
 
252 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.852094 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0231  ABC transporter related  43.48 
 
 
244 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0970  ABC transporter related  44.44 
 
 
241 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0828  ABC transporter related  43.36 
 
 
228 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0964  ABC transporter related  42.73 
 
 
241 aa  181  7e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1659  ABC transporter related  44.89 
 
 
241 aa  181  9.000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  44 
 
 
230 aa  180  1e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3406  ABC transporter related  43.04 
 
 
240 aa  181  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.225311  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20470  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  44.84 
 
 
245 aa  181  1e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0202995  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  44.24 
 
 
247 aa  180  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2318  ABC transporter related  45.21 
 
 
565 aa  179  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0254  ABC transporter related  43.5 
 
 
241 aa  180  2e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3710  ABC transporter related  45.95 
 
 
255 aa  179  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  43.11 
 
 
229 aa  179  4e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5675  ABC transporter related  42.79 
 
 
250 aa  179  4e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.216475  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  43.38 
 
 
246 aa  178  5.999999999999999e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0440126  decreased coverage  0.00217746 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4066  ABC transporter related  41.89 
 
 
293 aa  178  7e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.376431 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  44.39 
 
 
225 aa  177  9e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  42.99 
 
 
277 aa  177  9e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0947  ABC transporter, ATP-binding protein  42.42 
 
 
234 aa  177  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3198  ABC transporter related  44.84 
 
 
647 aa  177  1e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0833808  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0896  ABC transporter, ATPase subunit  43.3 
 
 
229 aa  177  1e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00595939  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  42.92 
 
 
277 aa  177  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2113  ABC transporter related  42.08 
 
 
240 aa  177  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000000136112  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  42.22 
 
 
228 aa  176  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  41.7 
 
 
653 aa  177  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1335  ABC transporter related  46.36 
 
 
238 aa  176  2e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.43014  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  42.34 
 
 
246 aa  176  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  42.22 
 
 
241 aa  177  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3865  hypothetical protein  42.22 
 
 
233 aa  176  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255505  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2351  ABC transporter related  43.38 
 
 
255 aa  176  4e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.234031  normal  0.139824 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7899  ABC transporter related  43.17 
 
 
277 aa  175  5e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0445  ABC transporter, ATP-binding protein  42.15 
 
 
232 aa  175  5e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168038  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1563  ABC transporter related  43.95 
 
 
249 aa  175  5e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2118  ABC transporter related  41.18 
 
 
259 aa  175  6e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.36781  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0103  ABC transporter related  42.11 
 
 
234 aa  175  6e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1745  efflux ABC transporter, lipoprotein translocase (LPT) family, ATP-binding protein  44.14 
 
 
256 aa  175  6e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.357481 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1364  ABC transporter-related protein  40.97 
 
 
237 aa  174  7e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00718085  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0641  ABC transporter, ATP-binding protein  46.98 
 
 
279 aa  174  9e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.202535 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  42.53 
 
 
255 aa  174  9e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0369  ABC transporter related  42.53 
 
 
234 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.548641  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6488  ABC transporter related protein  42.79 
 
 
246 aa  174  9.999999999999999e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2234  ABC transporter related  43.38 
 
 
255 aa  174  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184169  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  44 
 
 
226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  43.12 
 
 
244 aa  173  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0572  macrolide ABC transporter ATPase/inner membrane protein  47.56 
 
 
665 aa  173  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.412698  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  43.78 
 
 
221 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3149  ABC transporter related  42.08 
 
 
563 aa  173  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  41.78 
 
 
239 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  43.3 
 
 
642 aa  173  1.9999999999999998e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1081  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  43.24 
 
 
640 aa  173  1.9999999999999998e-42  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  44.29 
 
 
264 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  42.79 
 
 
231 aa  172  2.9999999999999996e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2467  ABC transporter related  44.44 
 
 
650 aa  172  2.9999999999999996e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.385523  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  41.44 
 
 
266 aa  172  2.9999999999999996e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  44.04 
 
 
262 aa  172  2.9999999999999996e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  43.69 
 
 
642 aa  172  2.9999999999999996e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  39.73 
 
 
280 aa  172  3.9999999999999995e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4480  ABC transporter related protein  44.34 
 
 
256 aa  172  3.9999999999999995e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.77881 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  40.18 
 
 
252 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2653  ABC transporter, ATP-binding protein  43.27 
 
 
214 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.670995  normal  0.0652814 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>