73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2783 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2783  ABC transporter, membrane spanning subunit, devC-like  100 
 
 		 393 aa  785    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.301274  hitchhiker  0.000609554 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0600  DevC protein  42.71 
 
 		 388 aa  306  4.0000000000000004e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1233  DevC protein  41.13 
 
 		 392 aa  299  6e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000657909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2891  DevC protein  37.82 
 
 		 395 aa  267  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.822086  normal  0.492179 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3751  DevC protein  39.58 
 
 		 383 aa  265  8.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3800  DevC protein  39.32 
 
 		 383 aa  262  8e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0009  DevC protein  38.12 
 
 		 384 aa  260  3e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.611516 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1223  DevC protein  37.76 
 
 		 392 aa  259  6e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.933137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3587  DevC protein  38.02 
 
 		 385 aa  253  3e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.694594  normal  0.0264093 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0091  DevC protein  37.89 
 
 		 384 aa  251  2e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2250  DevC protein  37.14 
 
 		 385 aa  249  8e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0130513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2092  DevC protein  38.05 
 
 		 388 aa  245  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000758237 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0331  DevC protein  36.46 
 
 		 385 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3639  DevC protein  36.34 
 
 		 388 aa  239  5e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.543907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2730  DevC protein  33.16 
 
 		 397 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.890192 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4445  DevC protein  33.93 
 
 		 390 aa  229  4e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4104  DevC protein  33.16 
 
 		 385 aa  212  7.999999999999999e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.312226  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1218  DevC protein  34.38 
 
 		 389 aa  208  1e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.188524  normal  0.730906 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2586  DevC protein  34.61 
 
 		 392 aa  206  7e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.131635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16601  ABC-transporter, membrane spanning component  34.03 
 
 		 389 aa  205  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.513807 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08351  ABC-transporter, membrane spanning component  34.36 
 
 		 390 aa  203  4e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1251  DevC protein  33.77 
 
 		 389 aa  202  6e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0933437  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08091  ABC-transporter, membrane spanning component  32.81 
 
 		 390 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.270503  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08101  ABC-transporter, membrane spanning component  32.81 
 
 		 390 aa  199  5e-50  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0757  ABC transporter transmembrane protein  32.03 
 
 		 390 aa  194  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.750458  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10141  ABC-transporter, membrane spanning component  33.59 
 
 		 390 aa  192  8e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.8535  normal  0.0327944 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3920  DevC protein  32.32 
 
 		 392 aa  190  4e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07851  ABC-transporter, membrane spanning component  32.9 
 
 		 391 aa  186  7e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.165508  normal  0.803737 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0153  ABC transporter transmembrane protein  32.9 
 
 		 391 aa  186  8e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1432  hypothetical protein  29.04 
 
 		 402 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.696316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2146  protein of unknown function DUF214  26.84 
 
 		 392 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3709  protein of unknown function DUF214  26.77 
 
 		 406 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4023  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.61 
 
 		 375 aa  95.9  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7062  putative ABC transporter, permease protein  23.95 
 
 		 377 aa  92  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.549141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3894  hypothetical protein  24.1 
 
 		 402 aa  86.7  6e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3083  hypothetical protein  26.4 
 
 		 376 aa  86.3  8e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.262583  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0999  protein of unknown function DUF214  26.51 
 
 		 414 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.59064  normal  0.175396 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5155  protein of unknown function DUF214  33.75 
 
 		 407 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2797  hypothetical protein  24.88 
 
 		 415 aa  77.8  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0642464 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0698  protein of unknown function DUF214  24.94 
 
 		 376 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112552 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1117  protein of unknown function DUF214  23.99 
 
 		 381 aa  72  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1808  ABC-transporter permease protein, putative  22.61 
 
 		 366 aa  67.4  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.218527  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1553  hypothetical protein  22.05 
 
 		 376 aa  66.2  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2646  ABC transporter, permease component  24.09 
 
 		 374 aa  63.2  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3338  hypothetical protein  24.3 
 
 		 401 aa  61.6  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0313  protein of unknown function DUF214  25.23 
 
 		 380 aa  56.6  0.0000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1003  permease, putative  23.77 
 
 		 876 aa  55.1  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0149153  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2393  protein of unknown function DUF214  26.36 
 
 		 857 aa  54.7  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0227275  hitchhiker  0.00295901 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0827  ABC transporter, permease protein, putative  32.69 
 
 		 410 aa  53.9  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2114  hypothetical protein  21.9 
 
 		 380 aa  53.9  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000213217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1408  protein of unknown function DUF214  22.51 
 
 		 379 aa  52.4  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.485745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1505  hypothetical protein  23.86 
 
 		 378 aa  52.4  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.481293  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0167  hypothetical protein  26.46 
 
 		 380 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1630  protein of unknown function DUF214  21.43 
 
 		 382 aa  50.1  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4323  hypothetical protein  23.97 
 
 		 378 aa  49.3  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113559 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0010  protein of unknown function DUF214  24.68 
 
 		 380 aa  47.4  0.0004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000261565  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4544  protein of unknown function DUF214  22.59 
 
 		 372 aa  47.4  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0301435  normal  0.636617 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0545  protein of unknown function DUF214  28 
 
 		 386 aa  47  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1835  hypothetical protein  31.36 
 
 		 399 aa  46.6  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515684  normal  0.328379 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1686  protein of unknown function DUF214  31.36 
 
 		 399 aa  46.2  0.0009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0037  export ABC transporter permease protein  24.29 
 
 		 397 aa  45.8  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1336  ABC transporter efflux protein  25.19 
 
 		 421 aa  45.8  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2522  hypothetical protein  24.68 
 
 		 385 aa  45.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0126  hypothetical protein  22.7 
 
 		 384 aa  45.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.447116  normal  0.743413 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1534  protein of unknown function DUF214  26.8 
 
 		 421 aa  44.7  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  27.04 
 
 		 856 aa  43.9  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0161  cytochrome c oxidase subunit I  28.39 
 
 		 570 aa  43.5  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0469  protein of unknown function DUF214  19.15 
 
 		 386 aa  43.9  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  23.81 
 
 		 821 aa  43.5  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2873  protein of unknown function DUF214  27.91 
 
 		 792 aa  43.1  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2698  protein of unknown function DUF214  26.67 
 
 		 855 aa  43.1  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0506019  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3712  hypothetical protein  28.28 
 
 		 400 aa  43.1  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2440  protein of unknown function DUF214  27.55 
 
 		 416 aa  43.1  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.652514  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>