More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2762 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2762  cellulose binding, type IV  100 
 
 		 449 aa  927    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000724406 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0891  putative site-specific integrase/recombinase protein  60.54 
 
 		 460 aa  541  1e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2634  prophage LambdaMc01, site-specific recombinase resolvase family protein  56.32 
 
 		 459 aa  481  1e-134  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3171  putative site-specific integrase/resolvase protein  56.25 
 
 		 462 aa  473  1e-132  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3247  putative site-specific integrase protein  56.49 
 
 		 462 aa  472  1e-132  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.964648 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1943  resolvase  54.23 
 
 		 443 aa  472  1e-132  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  51.02 
 
 		 445 aa  462  1e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3232  Resolvase domain protein  54.11 
 
 		 474 aa  455  1e-127  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  50.57 
 
 		 445 aa  456  1e-127  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  48.87 
 
 		 447 aa  450  1e-125  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  49.43 
 
 		 445 aa  447  1.0000000000000001e-124  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2081  recombinase  50.47 
 
 		 441 aa  435  1e-121  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0665131 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1951  resolvase  49.65 
 
 		 445 aa  421  1e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.666917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2777  recombinase  44.7 
 
 		 441 aa  418  1e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2926  resolvase domain-containing protein  45.16 
 
 		 441 aa  416  9.999999999999999e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.855729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1155  recombinase  57.65 
 
 		 343 aa  410  1e-113  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1227  resolvase domain-containing protein  45.66 
 
 		 441 aa  390  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254859 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  40 
 
 		 528 aa  374  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1449  resolvase-like protein  51.65 
 
 		 522 aa  365  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  47.38 
 
 		 528 aa  357  2.9999999999999997e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  48.08 
 
 		 527 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1522  resolvase domain-containing protein  42.82 
 
 		 568 aa  348  1e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40814  normal  0.455873 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  44.64 
 
 		 525 aa  338  9.999999999999999e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  45.8 
 
 		 525 aa  336  5e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0796  resolvase-like protein  47.79 
 
 		 506 aa  336  5.999999999999999e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.196824  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0172  recombinase  50.43 
 
 		 545 aa  330  2e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2336  resolvase  46.2 
 
 		 532 aa  324  2e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.930487 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0886  resolvase domain-containing protein  43.57 
 
 		 511 aa  324  2e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1145  recombinase  46.33 
 
 		 549 aa  318  2e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2945  resolvase  46.5 
 
 		 550 aa  316  5e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0594  Resolvase domain protein  41.03 
 
 		 525 aa  304  2.0000000000000002e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  40.51 
 
 		 534 aa  275  2.0000000000000002e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  40.85 
 
 		 534 aa  273  6e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  40.51 
 
 		 534 aa  272  1e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  40.23 
 
 		 534 aa  271  1e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  40.51 
 
 		 534 aa  271  2e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  40.51 
 
 		 537 aa  270  2.9999999999999997e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  40.23 
 
 		 534 aa  269  5.9999999999999995e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1125  recombinase  43.48 
 
 		 322 aa  264  2e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0324535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  39.72 
 
 		 537 aa  264  3e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  38.42 
 
 		 489 aa  262  8.999999999999999e-69  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  39.5 
 
 		 500 aa  259  1e-67  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0385  recombinase  40.39 
 
 		 412 aa  242  1e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.691654 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0512  resolvase domain-containing protein  40.59 
 
 		 299 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0859  Resolvase domain  34.92 
 
 		 544 aa  195  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.367879  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  31.76 
 
 		 546 aa  171  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  32.59 
 
 		 613 aa  162  1e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  31.02 
 
 		 665 aa  155  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  28.75 
 
 		 462 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0440  Resolvase domain protein  32.21 
 
 		 552 aa  145  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000141398  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2440  Resolvase domain protein  38.27 
 
 		 500 aa  145  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  29.28 
 
 		 542 aa  145  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  29.28 
 
 		 542 aa  145  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  29.05 
 
 		 542 aa  144  5e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  29.34 
 
 		 509 aa  140  3.9999999999999997e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  36.44 
 
 		 515 aa  136  7.000000000000001e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2606  resolvase family site-specific recombinase  24.47 
 
 		 534 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  30.52 
 
 		 475 aa  132  7.999999999999999e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0913  resolvase domain-containing protein  34.21 
 
 		 554 aa  132  9e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.955385  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  28.1 
 
 		 485 aa  128  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  24.34 
 
 		 515 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0910  recombinase  28.61 
 
 		 743 aa  124  3e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1608  putative resolvase  35.37 
 
 		 502 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0796  recombinase  28.62 
 
 		 421 aa  118  3e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  30.66 
 
 		 546 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  29.51 
 
 		 484 aa  113  6e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  26.05 
 
 		 522 aa  113  9e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  25 
 
 		 415 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  29.23 
 
 		 484 aa  111  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  27.78 
 
 		 521 aa  110  6e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2971  resolvase domain-containing protein  28.83 
 
 		 474 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0952966  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2833  prophage LambdaMc01, site-specific recombinase resolvase family protein  38.12 
 
 		 154 aa  108  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1561  resolvase-like protein  28.3 
 
 		 546 aa  108  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.571827 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  24.56 
 
 		 506 aa  107  5e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  26.4 
 
 		 540 aa  106  8e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  26.97 
 
 		 494 aa  106  8e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1282  ssrA integrase  24.52 
 
 		 558 aa  105  2e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000313732  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  26.99 
 
 		 558 aa  104  3e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0102  resolvase domain-containing protein  26.74 
 
 		 537 aa  102  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218605 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3384  resolvase domain-containing protein  28 
 
 		 590 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1430  Resolvase domain protein  26.57 
 
 		 607 aa  101  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0277  resolvase domain-containing protein  25.51 
 
 		 551 aa  100  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738521  normal  0.0325045 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  24.38 
 
 		 561 aa  98.6  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0336  Resolvase domain  27.04 
 
 		 500 aa  99  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.484454  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0273  resolvase domain-containing protein  26.3 
 
 		 500 aa  99  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4182  resolvase domain-containing protein  29.84 
 
 		 579 aa  97.4  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1152  Resolvase domain protein  27.96 
 
 		 460 aa  95.5  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  35.95 
 
 		 196 aa  95.1  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  26.39 
 
 		 522 aa  95.5  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4193  Resolvase domain  26.21 
 
 		 555 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  26.78 
 
 		 539 aa  93.2  9e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  25.58 
 
 		 554 aa  92.4  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5555  integrase  25.72 
 
 		 272 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14894e-26 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  26.69 
 
 		 519 aa  92.8  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  37.04 
 
 		 188 aa  92.4  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1490  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  28.17 
 
 		 553 aa  92.4  1e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  25.78 
 
 		 542 aa  92  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1292  ssrA integrase  23.15 
 
 		 550 aa  92  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00290655  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0427  Resolvase domain protein  25.95 
 
 		 534 aa  92  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1297  resolvase domain-containing protein  23.15 
 
 		 555 aa  92  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.023509  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>