15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2742 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_2742  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  300  5.000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  1.60217e-16  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2137  hypothetical protein  39.23 
 
 
151 aa  101  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1147  hypothetical protein  39.13 
 
 
138 aa  97.4  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12620  hypothetical protein  39.13 
 
 
138 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.40597  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4773  hypothetical protein  41.44 
 
 
160 aa  96.7  9e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00410686 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4649  hypothetical protein  41.44 
 
 
139 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.560505  normal  0.168471 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4936  hypothetical protein  42.34 
 
 
139 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.441756 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4827  hypothetical protein  41.44 
 
 
139 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0647  hypothetical protein  42.34 
 
 
139 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.309841  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4332  hypothetical protein  40.54 
 
 
139 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4789  hypothetical protein  40.54 
 
 
139 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.722624  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2793  hypothetical protein  40.14 
 
 
154 aa  89.7  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0772673  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3890  hypothetical protein  37.29 
 
 
153 aa  87.4  5e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.849324  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3740  hypothetical protein  49.37 
 
 
139 aa  84  7e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09980  hypothetical protein  40.52 
 
 
139 aa  83.6  9e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.229302  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>