More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2656 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2656  2-keto-3-deoxygluconate kinase  100 
 
 		 312 aa  642    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000013903  normal  0.883759 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3107  ribokinase-like domain-containing protein  41.56 
 
 		 313 aa  254  9e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3657  PfkB  38.14 
 
 		 307 aa  229  4e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2782  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  40.54 
 
 		 307 aa  221  9e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.191154  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2510  carbohydrate kinase, PfkB  39.19 
 
 		 307 aa  217  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0130  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  40.26 
 
 		 322 aa  216  4e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.760619 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0836  PfkB  39.46 
 
 		 315 aa  209  6e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.252584  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3280  2-keto-3-deoxygluconate kinase  37.38 
 
 		 312 aa  208  1e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.3989  normal  0.0530742 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3006  ribokinase-like domain-containing protein  40.07 
 
 		 325 aa  207  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2876  ribokinase-like domain-containing protein  38.13 
 
 		 312 aa  205  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.421827  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4750  ribokinase-like domain-containing protein  39.8 
 
 		 310 aa  203  3e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1969  PfkB  36.91 
 
 		 318 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.151768  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1269  2-keto-3-deoxygluconate kinase  38.97 
 
 		 296 aa  200  3e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0299866 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4546  PfkB domain protein  38.24 
 
 		 311 aa  199  6e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00872695  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3070  ribokinase-like domain-containing protein  38.21 
 
 		 312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2125  2-keto-3-deoxygluconate kinase  37.79 
 
 		 298 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190245  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0086  PfkB domain protein  37.62 
 
 		 310 aa  193  4e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0082  PfkB domain protein  37.62 
 
 		 310 aa  192  6e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3085  2-keto-3-deoxygluconate kinase  37.5 
 
 		 311 aa  191  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.235741  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3887  PfkB domain protein  36.75 
 
 		 310 aa  191  1e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3864  2-keto-3-deoxygluconate kinase  39.67 
 
 		 295 aa  190  2e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0735701 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0101  ribokinase-like domain-containing protein  37.46 
 
 		 314 aa  189  5.999999999999999e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4062  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  37.46 
 
 		 314 aa  189  5.999999999999999e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4070  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  37.46 
 
 		 314 aa  189  5.999999999999999e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.254909 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03374  ketodeoxygluconokinase  36.67 
 
 		 309 aa  188  8e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03327  hypothetical protein  36.67 
 
 		 309 aa  188  8e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3923  2-keto-3-deoxygluconate kinase  36.33 
 
 		 309 aa  188  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0187  PfkB domain protein  36.33 
 
 		 309 aa  187  3e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0191  ribokinase-like domain-containing protein  36.33 
 
 		 309 aa  187  3e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4014  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  36.33 
 
 		 309 aa  187  3e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3831  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  36.33 
 
 		 309 aa  187  3e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.15496 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3729  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  36.33 
 
 		 309 aa  187  3e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4890  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  36 
 
 		 309 aa  185  8e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.327816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000918  2-dehydro-3-deoxygluconate kinase  37.79 
 
 		 309 aa  185  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3890  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  36.03 
 
 		 304 aa  184  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.413281  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3932  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  36.09 
 
 		 309 aa  183  3e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0939  2-keto-3-deoxygluconate kinase  38.83 
 
 		 318 aa  182  5.0000000000000004e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170609  hitchhiker  0.00670311 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4075  PfkB domain protein  35.97 
 
 		 310 aa  181  1e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3109  PfkB domain protein  37.21 
 
 		 306 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.205766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2477  ribokinase-like domain-containing protein  35.67 
 
 		 325 aa  180  2.9999999999999997e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000321874 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1308  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  35.33 
 
 		 331 aa  179  7e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000271255  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06349  hypothetical protein  36.74 
 
 		 314 aa  178  8e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1367  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  35 
 
 		 309 aa  176  6e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000226917  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2574  2-keto-3-deoxygluconate kinase  39.67 
 
 		 299 aa  174  9.999999999999999e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.751635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2321  ribokinase-like domain-containing protein  38.74 
 
 		 310 aa  172  5e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.96044 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5059  ribokinase-like domain-containing protein  37.79 
 
 		 305 aa  172  5.999999999999999e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.542139 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0399  ribokinase-like domain-containing protein  35.28 
 
 		 326 aa  170  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0392221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5084  ribokinase-like domain-containing protein  35.86 
 
 		 311 aa  168  9e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.599555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2141  ribokinase-like domain-containing protein  37.41 
 
 		 302 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.117677  normal  0.398688 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1665  ribokinase-like domain-containing protein  39.16 
 
 		 311 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.304244  normal  0.0158043 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2840  PfkB domain protein  37.87 
 
 		 306 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0260  2-keto-3-deoxygluconate kinase  34.9 
 
 		 325 aa  162  9e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4495  2-keto-3-deoxygluconate kinase  36.49 
 
 		 304 aa  159  4e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.964854  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1890  2-keto-3-deoxygluconate kinase  33.88 
 
 		 309 aa  160  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0103461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0849  putative 2-dehydro-3-deoxygluconokinase  35.57 
 
 		 305 aa  159  5e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0858  2-dehydro-3-deoxygluconokinase, putative  35.23 
 
 		 305 aa  158  9e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.341435  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04804  sugar kinase  38.17 
 
 		 258 aa  153  4e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3673  2-keto-3-deoxygluconate kinase  35.47 
 
 		 290 aa  151  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.151137  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2368  ribokinase-like domain-containing protein  34.9 
 
 		 305 aa  150  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2414  ribokinase-like domain-containing protein  37.07 
 
 		 302 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.322028  normal  0.348643 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0490  2-keto-3-deoxygluconate kinase  37.85 
 
 		 250 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01490  putative ketodeoxygluconokinase  39.75 
 
 		 172 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1857  ribokinase-like domain-containing protein  34.32 
 
 		 297 aa  127  3e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.96427  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01471  putative ketodeoxygluconokinase  43.79 
 
 		 153 aa  112  6e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4023  PfkB  32.55 
 
 		 311 aa  106  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.102186  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26890  2-ketogluconate kinase  28.76 
 
 		 314 aa  106  6e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00940196  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  28.3 
 
 		 337 aa  102  8e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0275  PfkB domain-containing protein  32.57 
 
 		 312 aa  101  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0140  PfkB domain protein  29.13 
 
 		 326 aa  99.8  5e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4769  2-Keto-3-deoxygluconate kinase  31.72 
 
 		 311 aa  99.4  7e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2566  ribokinase-like domain-containing protein  29.24 
 
 		 316 aa  99  8e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255946  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2380  ribokinase-like domain-containing protein  27.45 
 
 		 316 aa  99  8e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3378  PfkB domain protein  27.87 
 
 		 316 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0607501 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2979  putative 2-ketogluconate kinase  29.05 
 
 		 316 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5479  PfkB domain protein  31.96 
 
 		 321 aa  95.5  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2902  PfkB  29.51 
 
 		 345 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.358173  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0115  PfkB domain protein  24.84 
 
 		 313 aa  93.2  5e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35340  putative 2-ketogluconate kinase  28.83 
 
 		 316 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00857937  normal  0.115887 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  27.94 
 
 		 317 aa  91.3  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0971  aminoimidazole riboside kinase  25.41 
 
 		 308 aa  91.3  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00309121  normal  0.0346902 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4464  aminoimidazole riboside kinase  27.41 
 
 		 319 aa  90.5  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0616  ribokinase-like domain-containing protein  29.21 
 
 		 315 aa  90.1  5e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00109848  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0635  ribokinase-like domain-containing protein  28.52 
 
 		 315 aa  89.7  5e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.377528  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  28.57 
 
 		 319 aa  89.7  5e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2569  ribokinase-like domain-containing protein  28.81 
 
 		 316 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0290  PfkB domain protein  26.1 
 
 		 325 aa  89.4  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1741  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  26.38 
 
 		 270 aa  89  9e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4283  aminoimidazole riboside kinase  27.1 
 
 		 319 aa  89  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4395  aminoimidazole riboside kinase  27.1 
 
 		 319 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  27.54 
 
 		 306 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1382  PfkB domain protein  30.91 
 
 		 326 aa  87.8  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.299274 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1849  PfkB domain protein  29.63 
 
 		 316 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541004  normal  0.0446674 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3180  ribokinase-like domain-containing protein  25.08 
 
 		 322 aa  87.8  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.714221  normal  0.0291745 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3559  ribokinase-like domain-containing protein  28.72 
 
 		 340 aa  87.4  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2067  ribokinase-like domain-containing protein  29.73 
 
 		 324 aa  87  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0314864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0395  aminoimidazole riboside kinase  27.01 
 
 		 311 aa  86.3  6e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0581877  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3290  PfkB domain protein  24.24 
 
 		 320 aa  86.3  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  25.61 
 
 		 320 aa  85.9  9e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4397  aminoimidazole riboside kinase  27.1 
 
 		 319 aa  85.1  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2336  ribokinase family sugar kinase  29.87 
 
 		 316 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197466  normal  0.0950231 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>