More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2570 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_2570  OmpA family protein  100 
 
 
230 aa  469  1.0000000000000001e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2517  OmpA/MotB domain-containing protein  35.04 
 
 
249 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0742352  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2123  OmpA/MotB domain-containing protein  32.89 
 
 
238 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0746803  normal  0.0463791 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2493  OmpA/MotB domain-containing protein  32.77 
 
 
245 aa  108  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00791352  normal  0.694387 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1792  OmpA/MotB domain-containing protein  32.68 
 
 
251 aa  102  4e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00059964  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1624  OmpA/MotB domain-containing protein  28.57 
 
 
255 aa  99.4  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0548574  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2201  OmpA/MotB domain-containing protein  31.3 
 
 
264 aa  96.7  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.203533  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2004  OmpA family protein  30.63 
 
 
240 aa  89  6e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2449  OmpA/MotB domain protein  31.63 
 
 
276 aa  87  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000186851  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1828  OmpA/MotB domain-containing protein  31.63 
 
 
276 aa  86.7  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.124445  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1876  OmpA/MotB domain-containing protein  33.52 
 
 
276 aa  85.9  5e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0190834  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1842  OmpA/MotB domain-containing protein  33.52 
 
 
276 aa  85.5  6e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3984  ompA family protein  29.32 
 
 
278 aa  84.7  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.25861  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2411  OmpA/MotB domain-containing protein  32.42 
 
 
264 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00660043  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2278  OmpA/MotB domain-containing protein  31.32 
 
 
264 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000182136  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1066  OmpA/MotB  37.86 
 
 
264 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1275  OmpA/MotB domain protein  29.93 
 
 
227 aa  73.2  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0265448  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  37.37 
 
 
321 aa  70.5  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2305  peptidoglycan-associated lipoprotein  43.75 
 
 
187 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2195  peptidoglycan-associated lipoprotein  38.75 
 
 
192 aa  69.7  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.203407  normal  0.247452 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0327  OmpA/MotB  36.36 
 
 
170 aa  69.3  0.00000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.927231  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0589  peptidoglycan-associated lipoprotein  33.61 
 
 
179 aa  68.9  0.00000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000303526  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  37.62 
 
 
296 aa  68.6  0.00000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  29.03 
 
 
261 aa  68.6  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3986  OmpA/MotB domain-containing protein  38.18 
 
 
202 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3909  OmpA/MotB domain protein  38.18 
 
 
202 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  33.91 
 
 
374 aa  67.8  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  34.33 
 
 
261 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  32.81 
 
 
261 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1112  OmpA/MotB domain-containing protein  42.27 
 
 
369 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00190106  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  36.7 
 
 
263 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4321  OmpA family protein  39.09 
 
 
201 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1428  peptidoglycan-associated lipoprotein  44.16 
 
 
172 aa  67.4  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000158382  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1146  OmpA/MotB domain-containing protein  38.39 
 
 
369 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00262556  normal  0.603197 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6878  Outer membrane lipoprotein omp16 precursor (peptidoglycan-associated lipoprotein)  33.33 
 
 
149 aa  67.4  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.401181  normal  0.0290754 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3244  OmpA/MotB domain protein  42.27 
 
 
369 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0107614  hitchhiker  0.00411399 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  36.7 
 
 
262 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0815  putative lipoprotein  28.77 
 
 
223 aa  66.6  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1045  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 
363 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000183072  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2026  peptidoglycan-associated lipoprotein precursor (19 kDa surface antigen) (PPL)  35 
 
 
176 aa  66.2  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2021  peptidoglycan-associated lipoprotein precursor (19 kDa surface antigen) (PPL)  35 
 
 
176 aa  66.2  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3086  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  33.88 
 
 
169 aa  65.9  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000103923  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  35.78 
 
 
263 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1250  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  33.88 
 
 
169 aa  65.9  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000441417  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3595  OmpA/MotB domain-containing protein  37.27 
 
 
202 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1152  OmpA family protein  30.23 
 
 
233 aa  65.9  0.0000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000620554  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5488  peptidoglycan-associated lipoprotein  34.34 
 
 
172 aa  65.5  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.429117  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1050  OmpA/MotB domain-containing protein  42.27 
 
 
366 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0116313  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1732  peptidoglycan-associated lipoprotein  41.56 
 
 
184 aa  65.5  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.110246  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48650  OmpA/MotB family protein  32.74 
 
 
261 aa  65.5  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  35.78 
 
 
263 aa  65.5  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0567  peptidoglycan-associated lipoprotein  33.06 
 
 
188 aa  65.1  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.22731  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5311  peptidoglycan-associated lipoprotein  34.34 
 
 
170 aa  65.1  0.0000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  30.56 
 
 
223 aa  65.1  0.0000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4843  peptidoglycan-associated lipoprotein  34.34 
 
 
170 aa  65.1  0.0000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.678153  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5389  peptidoglycan-associated lipoprotein  34.34 
 
 
170 aa  65.1  0.0000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  34.91 
 
 
1755 aa  64.7  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3545  OmpA family protein  43.02 
 
 
370 aa  64.3  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  35.92 
 
 
260 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1815  OmpA/MotB  29.71 
 
 
165 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.336374  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1395  OmpA/MotB  33.67 
 
 
178 aa  64.7  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000229219  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4144  OmpA/MotB  34.34 
 
 
165 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0100  peptidoglycan-associated lipoprotein precursor  31.63 
 
 
211 aa  64.7  0.000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.949654  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0380  OmpA/MotB domain-containing protein  36.36 
 
 
202 aa  64.7  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.700154  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0378  OmpA/MotB domain-containing protein  36.36 
 
 
202 aa  64.7  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4332  peptidoglycan-associated lipoprotein  33.33 
 
 
164 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0932864 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01611  hypothetical protein  41.56 
 
 
173 aa  63.5  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0876  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  41.56 
 
 
174 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.0023901  normal  0.278188 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0763  OmpA/MotB domain-containing protein  34.91 
 
 
189 aa  63.9  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000067511  unclonable  1.30394e-19 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  33.98 
 
 
656 aa  63.9  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2714  OmpA/MotB  34.34 
 
 
167 aa  63.9  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.358472  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2974  peptidoglycan-associated lipoprotein  38.75 
 
 
190 aa  64.3  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.113547  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4008  OmpA/MotB domain-containing protein  36.36 
 
 
202 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0899  OmpA/MotB  39.33 
 
 
205 aa  63.5  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000025431  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4102  OmpA/MotB domain-containing protein  36.36 
 
 
202 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2228  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein-like protein  33.67 
 
 
181 aa  63.9  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4748  OmpA/MotB  33.33 
 
 
166 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3509  OmpA/MotB  33.33 
 
 
164 aa  63.9  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.140214  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0812  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  41.56 
 
 
174 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.059882  normal  0.756228 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1280  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  36.73 
 
 
171 aa  63.9  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000137851  hitchhiker  0.0000238774 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2715  peptidoglycan-associated lipoprotein  37.97 
 
 
673 aa  63.9  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234601  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0908  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  41.56 
 
 
174 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00670429  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0845  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  41.56 
 
 
174 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00372041  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0785  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  41.56 
 
 
174 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000639422  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3646  OmpA/MotB domain-containing protein  36.36 
 
 
185 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0241  OmpA/MotB domain-containing protein  29.7 
 
 
184 aa  63.9  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3146  OmpA/MotB domain-containing protein  43.02 
 
 
373 aa  63.5  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000812337  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1584  peptidoglycan-associated lipoprotein  30.95 
 
 
199 aa  63.2  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.904402  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15220  outer membrane protein, OmpA/MotB family  37.62 
 
 
270 aa  63.5  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1528  OmpA domain-containing protein  31.36 
 
 
180 aa  63.2  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000113524  normal  0.565826 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1039  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  34.34 
 
 
183 aa  63.2  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.872127  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0432  OmpA/MotB domain-containing protein  35.45 
 
 
200 aa  63.5  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.161803  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1698  OmpA/MotB domain-containing protein  44.44 
 
 
189 aa  63.5  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000544254  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  25 
 
 
229 aa  62.8  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1239  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  40.26 
 
 
173 aa  63.2  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000216334  normal  0.113587 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2593  peptidoglycan-associated lipoprotein  33.33 
 
 
176 aa  62.8  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000155055  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2894  peptidoglycan-associated lipoprotein  40.26 
 
 
173 aa  62.4  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.67676e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1854  OmpA/MotB  42.31 
 
 
177 aa  62.4  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0764  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  40.26 
 
 
173 aa  62.4  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000105937  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0844  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  40.26 
 
 
173 aa  62.4  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000018572  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>