58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2450 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2450  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase HemN  100 
 
 		 253 aa  520  1e-146  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.846103  normal  0.839506 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3166  MltA-interacting MipA family protein  23.71 
 
 		 257 aa  76.6  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0454156  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3708  MltA-interacting MipA family protein  23.17 
 
 		 256 aa  74.7  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1860  MltA-interacting MipA family protein  23.68 
 
 		 248 aa  72.8  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000393444  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01739  hypothetical protein  23.68 
 
 		 248 aa  72.8  0.000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.923789  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2030  MltA-interacting protein MipA  23.68 
 
 		 248 aa  72.8  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1409  MltA-interacting protein MipA  23.68 
 
 		 248 aa  72.8  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.543769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1850  MltA-interacting MipA family protein  23.68 
 
 		 248 aa  72.8  0.000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.112768  hitchhiker  0.0014018 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2006  MltA-interacting protein MipA  23.68 
 
 		 248 aa  72.8  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.666046  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1867  MltA-interacting protein MipA  23.68 
 
 		 248 aa  72.8  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00884269  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01751  scaffolding protein for murein synthesizing machinery  23.68 
 
 		 248 aa  72.8  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.910835  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2506  MltA-interacting protein MipA  23.68 
 
 		 248 aa  72.4  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0237592  normal  0.810887 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2070  MltA-interacting protein  23.95 
 
 		 248 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000515947 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1889  MltA-interacting protein  23.95 
 
 		 248 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.310283  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1380  MltA-interacting protein  23.95 
 
 		 274 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.215527 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1413  MltA-interacting protein  23.95 
 
 		 248 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.598328  normal  0.558802 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1397  MltA-interacting protein  23.95 
 
 		 274 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000401837 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03124  hypothetical protein  24.77 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2586  scaffolding protein for murein-synthesizing holoenzyme putative outermembrane protein  25.66 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2564  MltA-interacting MipA family protein  26.88 
 
 		 270 aa  62.4  0.000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.295331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2258  MltA-interacting MipA family protein  25 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1656  putative outer membrane protein/scaffolding protein MipA  27.08 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0234795  normal  0.604065 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4564  MltA-interacting MipA  20.89 
 
 		 497 aa  57.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.672306  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1672  MltA-interacting MipA family protein  25.1 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.594604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1891  MltA-interacting MipA  25.72 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0905177 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2376  MltA-interacting MipA  24.61 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.487283  normal  0.1296 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2218  MltA-interacting MipA family protein  21.97 
 
 		 249 aa  55.5  0.0000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3438  MltA-interacting MipA family protein  23.56 
 
 		 271 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3404  MltA-interacting MipA  21.1 
 
 		 282 aa  54.7  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1962  MltA-interacting MipA family protein  23.66 
 
 		 249 aa  55.1  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.433624  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1724  hypothetical protein  24.44 
 
 		 267 aa  54.3  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4081  MltA-interacting MipA family protein  23.56 
 
 		 271 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1976  MltA-interacting MipA family protein  26.47 
 
 		 249 aa  52.8  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1171  MltA-interacting MipA  27.1 
 
 		 256 aa  52  0.000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.731654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2639  MltA-interacting MipA family protein  19.57 
 
 		 252 aa  51.6  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3701  MltA-interacting MipA family protein  20.96 
 
 		 250 aa  52  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1090  MltA-interacting MipA family protein  20.85 
 
 		 250 aa  51.2  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3975  MltA-interacting MipA family protein  23.33 
 
 		 257 aa  49.7  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.859945  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2644  MltA-interacting protein  22.86 
 
 		 259 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0158606  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3569  MltA-interacting MipA  23.94 
 
 		 292 aa  49.7  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000215128  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1684  MltA-interacting MipA family protein  21.37 
 
 		 263 aa  48.5  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000137839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0478  MltA-interacting MipA family protein  23.87 
 
 		 272 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2535  hypothetical protein  25.42 
 
 		 429 aa  47.8  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0449668  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1315  MltA-interacting MipA  19.29 
 
 		 261 aa  47.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00759705  normal  0.297084 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2730  MltA-interacting MipA family protein  26.2 
 
 		 254 aa  47  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.207086  hitchhiker  0.000331014 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1099  hypothetical protein  22.01 
 
 		 254 aa  47  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1413  MltA-interacting MipA family protein  25.6 
 
 		 272 aa  46.6  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2733  outer membrane protein  22.22 
 
 		 272 aa  46.6  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.244653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2146  putative MltA-interacting protein MipA  21.11 
 
 		 250 aa  45.4  0.0008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0292974  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2098  MltA-interacting MipA family protein  24.35 
 
 		 256 aa  45.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2353  hypothetical protein  24.35 
 
 		 273 aa  44.7  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000266286  normal  0.096147 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1990  MltA-interacting protein  24.35 
 
 		 256 aa  45.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000189285  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0808  MltA-interacting MipA family protein  24.29 
 
 		 247 aa  43.9  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.121594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0649  MltA-interacting MipA family protein  26.67 
 
 		 466 aa  44.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0235984  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2966  MltA-interacting MipA family protein  22.26 
 
 		 266 aa  43.5  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0602503  hitchhiker  0.00558879 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0775  MltA-interacting MipA family protein  19.7 
 
 		 454 aa  43.9  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1012  MltA-interacting MipA family protein  20.44 
 
 		 288 aa  43.1  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00934718  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000689  outer membrane protein OmpV  24.89 
 
 		 258 aa  42.7  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.419049  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>