More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2441 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2441  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 		 303 aa  634    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617876  normal  0.127265 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3389  ornithine carbamoyltransferase  68.12 
 
 		 301 aa  429  1e-119  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.345181  normal  0.187028 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0532  ornithine carbamoyltransferase  65.55 
 
 		 302 aa  423  1e-117  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0521808  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1101  ornithine carbamoyltransferase  68.12 
 
 		 303 aa  424  1e-117  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2430  ornithine carbamoyltransferase  67.34 
 
 		 304 aa  420  1e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2317  ornithine carbamoyltransferase  65.99 
 
 		 304 aa  417  9.999999999999999e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0451253  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2080  ornithine carbamoyltransferase  66.89 
 
 		 298 aa  410  1e-113  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4527  ornithine carbamoyltransferase  63.79 
 
 		 307 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2465  ornithine carbamoyltransferase  67 
 
 		 300 aa  404  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1108  ornithine carbamoyltransferase  65.99 
 
 		 306 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14030  ornithine carbamoyltransferase  62.79 
 
 		 308 aa  399  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1079  ornithine carbamoyltransferase  64.98 
 
 		 306 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4164  ornithine carbamoyltransferase  63.09 
 
 		 306 aa  395  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1120  ornithine carbamoyltransferase  65.32 
 
 		 306 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3901  ornithine carbamoyltransferase  62.75 
 
 		 306 aa  393  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0945  ornithine carbamoyltransferase  63.58 
 
 		 304 aa  393  1e-108  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0836212  normal  0.0898024 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4333  ornithine carbamoyltransferase  64.31 
 
 		 306 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18610  ornithine carbamoyltransferase  63.3 
 
 		 305 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0309685 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1609  ornithine carbamoyltransferase  63.3 
 
 		 305 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3342  ornithine carbamoyltransferase  62.63 
 
 		 306 aa  388  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0493063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0781  ornithine carbamoyltransferase  61.95 
 
 		 306 aa  385  1e-106  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0769217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2130  ornithine carbamoyltransferase  61.41 
 
 		 305 aa  384  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1461  ornithine carbamoyltransferase  61.28 
 
 		 305 aa  385  1e-106  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1345  ornithine carbamoyltransferase  61.95 
 
 		 312 aa  385  1e-106  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0726  ornithine carbamoyltransferase  62.29 
 
 		 300 aa  378  1e-104  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.853376  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0957  ornithine carbamoyltransferase  59.6 
 
 		 307 aa  375  1e-103  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0732  ornithine carbamoyltransferase  59.73 
 
 		 309 aa  364  1e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0405  ornithine carbamoyltransferase  59.87 
 
 		 311 aa  361  8e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.38298  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0569  ornithine carbamoyltransferase  59.87 
 
 		 311 aa  361  8e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0921  ornithine carbamoyltransferase  59.06 
 
 		 309 aa  359  4e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0124  ornithine carbamoyltransferase  59.06 
 
 		 309 aa  359  4e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0375  ornithine carbamoyltransferase  59.06 
 
 		 309 aa  359  4e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1073  ornithine carbamoyltransferase  59.06 
 
 		 309 aa  359  4e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2510  ornithine carbamoyltransferase  59.06 
 
 		 309 aa  359  4e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0675  ornithine carbamoyltransferase  59.06 
 
 		 309 aa  359  4e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0917  ornithine carbamoyltransferase  59.06 
 
 		 309 aa  359  4e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3032  ornithine carbamoyltransferase  57.38 
 
 		 306 aa  357  9.999999999999999e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.710258  normal  0.386116 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0743  ornithine carbamoyltransferase  58.39 
 
 		 309 aa  355  5e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.511035 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2601  ornithine carbamoyltransferase  57.72 
 
 		 560 aa  353  2e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.766266  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1850  ornithine carbamoyltransferase  57.05 
 
 		 305 aa  352  2.9999999999999997e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5885  ornithine carbamoyltransferase  57.72 
 
 		 309 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.718044 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2472  ornithine carbamoyltransferase  58.05 
 
 		 309 aa  352  4e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.893068  normal  0.0170187 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2577  ornithine carbamoyltransferase  57.72 
 
 		 309 aa  351  8e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1042  ornithine carbamoyltransferase  56.38 
 
 		 329 aa  351  8.999999999999999e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.246407  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0529  ornithine carbamoyltransferase  58.72 
 
 		 309 aa  351  8.999999999999999e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1942  ornithine carbamoyltransferase  57.72 
 
 		 309 aa  350  1e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2553  ornithine carbamoyltransferase  57.72 
 
 		 309 aa  350  1e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1469  ornithine carbamoyltransferase  56.52 
 
 		 326 aa  349  4e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.808206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1754  ornithine carbamoyltransferase  56.04 
 
 		 326 aa  348  6e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0940132  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1709  ornithine carbamoyltransferase  56.38 
 
 		 306 aa  348  8e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00976675  hitchhiker  0.00312362 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2675  ornithine carbamoyltransferase  55.45 
 
 		 308 aa  344  8e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0757  ornithine carbamoyltransferase  57 
 
 		 309 aa  344  1e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3573  ornithine carbamoyltransferase  55.85 
 
 		 329 aa  343  2e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.510034  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3205  ornithine carbamoyltransferase  56.67 
 
 		 309 aa  342  5e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.820291  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2554  ornithine carbamoyltransferase  54.82 
 
 		 308 aa  340  1e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0520201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3149  ornithine carbamoyltransferase  53.49 
 
 		 303 aa  340  2e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2424  ornithine carbamoyltransferase  54.7 
 
 		 308 aa  339  2.9999999999999998e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.586584 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3742  ornithine carbamoyltransferase  53.16 
 
 		 303 aa  339  4e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3637  ornithine carbamoyltransferase  53.49 
 
 		 303 aa  338  5e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2830  ornithine carbamoyltransferase  54.36 
 
 		 308 aa  338  5e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.998909  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1451  ornithine carbamoyltransferase  54.52 
 
 		 311 aa  338  5e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2120  ornithine carbamoyltransferase  55.18 
 
 		 302 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0533894  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3012  ornithine carbamoyltransferase  54.64 
 
 		 309 aa  336  1.9999999999999998e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2763  ornithine carbamoyltransferase  54.82 
 
 		 307 aa  336  2.9999999999999997e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0227  ornithine carbamoyltransferase  52.65 
 
 		 305 aa  335  3.9999999999999995e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2178  ornithine carbamoyltransferase  54.43 
 
 		 310 aa  335  5e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.280829  normal  0.684526 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2902  ornithine carbamoyltransferase  54.49 
 
 		 307 aa  335  5.999999999999999e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.674769  normal  0.667761 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1163  ornithine carbamoyltransferase  53.85 
 
 		 309 aa  335  5.999999999999999e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.100026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3003  ornithine carbamoyltransferase  53.49 
 
 		 305 aa  333  3e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2430  ornithine carbamoyltransferase  53.49 
 
 		 305 aa  333  3e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3743  ornithine carbamoyltransferase  55.88 
 
 		 321 aa  333  3e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0907  ornithine carbamoyltransferase  52.08 
 
 		 320 aa  328  5.0000000000000004e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1902  ornithine carbamoyltransferase  54 
 
 		 306 aa  328  8e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.24838  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0386  ornithine carbamoyltransferase  54.46 
 
 		 312 aa  327  1.0000000000000001e-88  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  52.94 
 
 		 315 aa  327  1.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3172  ornithine carbamoyltransferase  51.99 
 
 		 305 aa  325  4.0000000000000003e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0370415  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2685  ornithine carbamoyltransferase  53.72 
 
 		 309 aa  323  2e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.570167  normal  0.0624155 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2415  ornithine carbamoyltransferase  52.82 
 
 		 302 aa  322  5e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3030  ornithine carbamoyltransferase  50.97 
 
 		 320 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.883113 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0152  ornithine carbamoyltransferase  51.5 
 
 		 303 aa  319  3.9999999999999996e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0151  ornithine carbamoyltransferase  50.81 
 
 		 319 aa  318  5e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.950528 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0999  ornithine carbamoyltransferase  49.67 
 
 		 309 aa  317  2e-85  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0647018  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2492  ornithine carbamoyltransferase  49.33 
 
 		 305 aa  315  9e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1756  ornithine carbamoyltransferase  52.15 
 
 		 323 aa  315  9e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0839  ornithine carbamoyltransferase  50.99 
 
 		 303 aa  313  1.9999999999999998e-84  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.40698 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0382  ornithine carbamoyltransferase  53.14 
 
 		 308 aa  313  1.9999999999999998e-84  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.539911  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0742  ornithine carbamoyltransferase  50.98 
 
 		 312 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0343  ornithine carbamoyltransferase  50.98 
 
 		 309 aa  311  6.999999999999999e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0205  ornithine carbamoyltransferase  49.83 
 
 		 303 aa  311  7.999999999999999e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000336127 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1869  ornithine carbamoyltransferase  50.33 
 
 		 307 aa  311  7.999999999999999e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0323  ornithine carbamoyltransferase  50.5 
 
 		 309 aa  311  9e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0395  ornithine carbamoyltransferase  52.33 
 
 		 312 aa  310  2e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1057  ornithine carbamoyltransferase  49.5 
 
 		 301 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0302  ornithine carbamoyltransferase  52 
 
 		 312 aa  308  6.999999999999999e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0625047  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1232  ornithine carbamoyltransferase  51.29 
 
 		 311 aa  308  6.999999999999999e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0315  ornithine carbamoyltransferase  51.67 
 
 		 312 aa  307  1.0000000000000001e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3512  ornithine carbamoyltransferase  49 
 
 		 302 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.661553 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1542  ornithine carbamoyltransferase  50.16 
 
 		 308 aa  306  3e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5258  ornithine carbamoyltransferase  51.49 
 
 		 309 aa  306  3e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.802222  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0128  ornithine carbamoyltransferase  51.16 
 
 		 303 aa  304  1.0000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.673784 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>