More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2434 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_2434  Serine/threonine protein kinase-like  100 
 
 
896 aa  1817    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0164734  normal  0.121518 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2313  protein kinase  44.94 
 
 
1018 aa  268  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000403487 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00875  serine/threonine protein kinase PpkA  48.33 
 
 
1032 aa  264  4e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.038169  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0145  serine/threonine protein kinase PpkA  47.96 
 
 
1032 aa  261  4e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  43.56 
 
 
666 aa  217  8e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2282  serine/threonine protein kinase  45.04 
 
 
646 aa  214  5.999999999999999e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  33.79 
 
 
638 aa  211  4e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  44.27 
 
 
627 aa  211  6e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3182  protein kinase  42.21 
 
 
494 aa  206  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0356849  normal  0.234738 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0115  serine/threonine protein kinase  40.2 
 
 
585 aa  204  8e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0109927  normal  0.0245304 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0525  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  43.91 
 
 
880 aa  201  7e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1535  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.68 
 
 
627 aa  199  2.0000000000000003e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0087  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  41.11 
 
 
645 aa  198  3e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3472  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  40.38 
 
 
916 aa  198  3e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00045069  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  42.59 
 
 
662 aa  198  4.0000000000000005e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1669  protein kinase  41.32 
 
 
1053 aa  197  7e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.421495  normal  0.873367 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1789  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  41.7 
 
 
666 aa  197  9e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1392  serine/threonine kinase protein  39.84 
 
 
623 aa  197  9e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0088  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  41.11 
 
 
520 aa  196  1e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  40.6 
 
 
625 aa  196  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0017  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  41.54 
 
 
658 aa  196  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0667  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  42.14 
 
 
652 aa  195  3e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0537547  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3043  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  41.45 
 
 
667 aa  195  3e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.756601  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1340  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.3 
 
 
662 aa  195  3e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.458756 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.3 
 
 
584 aa  195  3e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1067  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.26 
 
 
653 aa  195  3e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.12 
 
 
668 aa  194  5e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2811  serine/threonine kinase protein  40.97 
 
 
1057 aa  194  5e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3844  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.52 
 
 
579 aa  194  8e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501201  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  41.38 
 
 
863 aa  194  8e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2082  serine/threonine protein kinase  39.3 
 
 
625 aa  193  1e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2966  serine/threonine protein kinase  41.2 
 
 
569 aa  192  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0319  serine/threonine protein kinase  39.06 
 
 
651 aa  192  2e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2753  Serine/threonine protein kinase-related protein  40.8 
 
 
517 aa  192  2e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0943  serine/threonine protein kinase  42.75 
 
 
468 aa  192  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00674899  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1225  serine/threonine protein kinase  42.42 
 
 
612 aa  192  2e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0574  serine/threonine protein kinase  41.54 
 
 
703 aa  192  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.153609  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1169  protein kinase  39.22 
 
 
634 aa  193  2e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000304799  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2026  protein kinase  40.85 
 
 
561 aa  192  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.399882  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1479  serine/threonine protein kinase  42.08 
 
 
571 aa  191  5e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.336782 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  40.62 
 
 
612 aa  191  5.999999999999999e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2960  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.93 
 
 
602 aa  191  5.999999999999999e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602152  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0789  serine/threonine kinase protein  38.61 
 
 
614 aa  191  7e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.350319  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  42.58 
 
 
621 aa  190  9e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3659  protein kinase  41.31 
 
 
599 aa  190  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.340098  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2486  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.93 
 
 
715 aa  190  1e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  38.64 
 
 
692 aa  189  2e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  36.39 
 
 
691 aa  189  2e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1588  protein kinase  40.84 
 
 
604 aa  189  3e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0577  serine/threonine protein kinase  41.29 
 
 
520 aa  189  3e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0018  serine/threonine protein kinase  40.84 
 
 
502 aa  188  4e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2780  serine/threonine protein kinase  41.42 
 
 
642 aa  187  7e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440633  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1511  serine/threonine kinase protein  34.29 
 
 
641 aa  187  9e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0038  serine/threonine protein kinase  41.76 
 
 
700 aa  186  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.55 
 
 
650 aa  186  1.0000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3400  Serine/threonine protein kinase-related protein  40.85 
 
 
1373 aa  186  1.0000000000000001e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27070  protein kinase family protein with PASTA domain  40.84 
 
 
692 aa  187  1.0000000000000001e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.93249  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1209  Serine/threonine protein kinase-related protein  37.74 
 
 
557 aa  186  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0025  Serine/threonine protein kinase-related protein  40 
 
 
635 aa  186  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.135449  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1337  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  44.55 
 
 
646 aa  186  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314134 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0812  protein kinase  38.24 
 
 
625 aa  186  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.978056  normal  0.726926 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0928  serine/threonine protein kinase  39.77 
 
 
761 aa  185  4.0000000000000006e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000612403  hitchhiker  1.21149e-16 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  36.75 
 
 
776 aa  184  5.0000000000000004e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2304  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.85 
 
 
632 aa  184  6e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.171539  hitchhiker  0.000365426 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00360  protein kinase family protein with PASTA domain protein  39.08 
 
 
668 aa  184  7e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0794  serine/threonine protein kinase  38.35 
 
 
623 aa  183  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.779291  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0809  protein kinase  38.35 
 
 
623 aa  183  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.386876  normal  0.0684467 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0789  protein kinase  38.35 
 
 
621 aa  183  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0666  protein kinase  43.3 
 
 
889 aa  183  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.415154 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00190  serine/threonine protein kinase  39.23 
 
 
596 aa  183  1e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.437157  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0438  protein kinase  41.7 
 
 
457 aa  182  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.841838  normal  0.0204841 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1041  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase:PASTA  39.92 
 
 
672 aa  182  2.9999999999999997e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.513032  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0021  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.23 
 
 
681 aa  182  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0020  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.03 
 
 
648 aa  182  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016475 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3910  serine/threonine protein kinase  42.19 
 
 
657 aa  181  4e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00106725  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3961  serine/threonine protein kinase  42.19 
 
 
657 aa  181  4e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.95648  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0015  serine/threonine protein kinase  38.85 
 
 
624 aa  181  4e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.230646  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11292  transmembrane serine/threonine-protein kinase H pknH  39.48 
 
 
626 aa  181  4e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000374937  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0023  serine/threonine protein kinase  38.85 
 
 
624 aa  181  4e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0133871 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0015  serine/threonine protein kinase  38.85 
 
 
624 aa  181  4e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.243084 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1282  serine/threonine protein kinase  42.19 
 
 
657 aa  181  4e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00711344 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3904  serine/threonine protein kinase  42.19 
 
 
657 aa  181  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.331218  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3713  serine/threonine protein kinase  42.69 
 
 
657 aa  181  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.465838  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3603  serine/threonine protein kinase  42.69 
 
 
657 aa  181  4.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3621  serine/threonine protein kinase  42.69 
 
 
657 aa  181  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4000  serine/threonine protein kinase  42.69 
 
 
657 aa  181  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3876  serine/threonine protein kinase  42.69 
 
 
657 aa  181  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95559e-22 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10014  transmembrane serine/threonine-protein kinase B pknB  38.7 
 
 
626 aa  181  5.999999999999999e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3119  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  41.77 
 
 
681 aa  181  5.999999999999999e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.417733  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0023  protein kinase  36.96 
 
 
625 aa  181  5.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0907172  normal  0.984932 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3845  protein kinase  40.53 
 
 
531 aa  181  7e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000111657  hitchhiker  0.000135014 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0072  protein kinase  37.55 
 
 
661 aa  181  7e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  37.36 
 
 
673 aa  180  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2514  protein kinase  42.19 
 
 
656 aa  180  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0149457  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0027  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.69 
 
 
664 aa  180  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1345  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.54 
 
 
641 aa  180  1e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03300  serine/threonine protein kinase  38.93 
 
 
651 aa  179  2e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0023  serine/threonine protein kinase  38.66 
 
 
746 aa  179  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3685  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  41.9 
 
 
657 aa  179  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.210183  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  40.38 
 
 
593 aa  178  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>