32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2267 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2267  hypothetical protein  100 
 
 		 409 aa  823    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00968313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3303  hypothetical protein  42.75 
 
 		 396 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00716702  unclonable  0.0000000189971 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3185  hypothetical protein  43.46 
 
 		 396 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.624784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3233  hypothetical protein  43.55 
 
 		 396 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2655  hypothetical protein  44.19 
 
 		 396 aa  266  7e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03863  hypothetical protein  41.3 
 
 		 398 aa  254  2.0000000000000002e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2414  putative lipoprotein  39.95 
 
 		 410 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0286985  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3313  putative lipoprotein  38.5 
 
 		 411 aa  229  6e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.474661  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0639  hypothetical protein  37.77 
 
 		 400 aa  224  3e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0031  hypothetical protein  35.15 
 
 		 408 aa  223  4e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3536  putative lipoprotein  40.53 
 
 		 406 aa  219  7e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000150558  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1068  putative lipoprotein  39.29 
 
 		 423 aa  212  7.999999999999999e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03650  putative lipoprotein  37.47 
 
 		 382 aa  211  2e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1225  hypothetical protein  34.11 
 
 		 401 aa  189  1e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.22049  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2969  hypothetical protein  35.92 
 
 		 418 aa  181  1e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0451316  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2701  hypothetical protein  35.62 
 
 		 405 aa  181  2e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.228985  normal  0.0970727 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3869  hypothetical protein  36.1 
 
 		 395 aa  179  7e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1265  putative lipoprotein  34.55 
 
 		 400 aa  172  1e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1706  hypothetical protein  32.9 
 
 		 401 aa  170  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.302597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0050  hypothetical protein  31.74 
 
 		 448 aa  135  9.999999999999999e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00013841  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0463  hypothetical protein  31.87 
 
 		 451 aa  135  9.999999999999999e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000505363  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0324  hypothetical protein  28.29 
 
 		 472 aa  125  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2166  putative lipoprotein  26.41 
 
 		 482 aa  114  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.843549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0465  hypothetical protein  28.61 
 
 		 329 aa  97.4  4e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.501265 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1099  hypothetical protein  24.28 
 
 		 464 aa  53.5  0.000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0734  outer membrane porin  29.13 
 
 		 384 aa  48.5  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.536638  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0366  outer membrane porin  27.14 
 
 		 403 aa  48.1  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000502534  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4630  hypothetical protein  21.94 
 
 		 419 aa  47.4  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1917  hypothetical protein  29.57 
 
 		 423 aa  46.6  0.0009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.50266  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0019  outer membrane porin  26.44 
 
 		 402 aa  46.2  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00360128  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1970  hypothetical protein  24.38 
 
 		 457 aa  43.9  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.231871 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0469  outer membrane porin  28.42 
 
 		 432 aa  43.1  0.008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000534788  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>