More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2233 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_2233  peptidase  100 
 
 
235 aa  485  1e-136  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000143948  hitchhiker  2.68833e-06 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2021  putative M22 peptidase-like protein YeaZ  38.63 
 
 
231 aa  155  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.839853  normal  0.532705 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1960  putative M22 peptidase homolog YeaZ  38.63 
 
 
231 aa  155  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.608794  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1496  glycoprotease family protein  38.2 
 
 
231 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.764772  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1311  glycoprotease family protein  38.2 
 
 
231 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0611537  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1964  glycoprotease family protein  38.2 
 
 
231 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01777  predicted peptidase  37.83 
 
 
231 aa  152  6e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01765  hypothetical protein  37.83 
 
 
231 aa  152  6e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.821026  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2534  glycoprotease family protein  37.83 
 
 
231 aa  150  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.219727  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1826  peptidase M22 glycoprotease  37.83 
 
 
231 aa  150  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.876091  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2033  glycoprotease family protein  37.83 
 
 
231 aa  150  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1895  glycoprotease family protein  37.83 
 
 
231 aa  150  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1836  peptidase M22 glycoprotease  37.83 
 
 
231 aa  150  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  2.8735e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2067  glycoprotease family protein  37.39 
 
 
231 aa  149  3e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1934  peptidase M22 glycoprotease  38.26 
 
 
233 aa  148  8e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.762827  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1991  peptidase M22 glycoprotease  38.26 
 
 
233 aa  148  9e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.931611  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2762  peptidase M22 glycoprotease  37.61 
 
 
233 aa  147  1e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00215046  hitchhiker  0.00129003 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2229  peptidase M22 glycoprotease  37.39 
 
 
233 aa  146  2e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2377  peptidase M22, glycoprotease  37.83 
 
 
231 aa  146  2e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2405  family M22 nonpeptidase-like protein  37.61 
 
 
232 aa  146  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000205018  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2127  peptidase M22 glycoprotease  37.61 
 
 
232 aa  146  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1381  glycoprotease family protein  36.24 
 
 
231 aa  146  3e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.132461  normal  0.678308 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2016  family M22 nonpeptidase-like protein  37.61 
 
 
232 aa  146  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0164135  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0910  glycoprotease  35.9 
 
 
233 aa  145  5e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0858  peptidase M22, glycoprotease  35.62 
 
 
228 aa  141  9e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1943  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2012  peptidase M22 glycoprotease  36.52 
 
 
233 aa  141  9e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.417971  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1574  hypothetical protein  35.54 
 
 
237 aa  139  3e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.366703  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004094  peptidase M22  35.65 
 
 
233 aa  138  7e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01375  hypothetical protein  36.32 
 
 
233 aa  137  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0734  glycoprotease family protein  35.86 
 
 
238 aa  133  2e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1185  putative glycoprotease family protein  34.87 
 
 
239 aa  133  2e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01132  peptidase M22, glycoprotease  33.33 
 
 
236 aa  130  1e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1257  peptidase M22 glycoprotease  33.47 
 
 
235 aa  128  9e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.924937 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2182  peptidase M22, glycoprotease  36.24 
 
 
236 aa  127  1e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2391  peptidase M22, glycoprotease  36.24 
 
 
236 aa  127  1e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.949893 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16710  hypothetical protein  32.17 
 
 
226 aa  125  5e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.016316  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2259  peptidase M22, glycoprotease  35.81 
 
 
236 aa  125  5e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1071  peptidase M22, glycoprotease  32.47 
 
 
224 aa  124  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106079  normal  0.108679 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1620  peptidase M22, glycoprotease  34.45 
 
 
234 aa  124  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2123  peptidase M22, glycoprotease  31.62 
 
 
223 aa  124  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2586  hypothetical protein  34.93 
 
 
236 aa  123  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1453  hypothetical protein  32.61 
 
 
226 aa  122  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39270  Peptidase M22, glycoprotease  35.86 
 
 
225 aa  122  6e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1510  hypothetical protein  33.05 
 
 
224 aa  122  7e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4110  peptidase M22 glycoprotease  33.91 
 
 
224 aa  121  8e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2528  hypothetical protein  33.48 
 
 
239 aa  121  1e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.721153  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2231  peptidase M22, glycoprotease  33.91 
 
 
233 aa  120  2e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.391268  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2193  peptidase M22, glycoprotease  33.61 
 
 
247 aa  120  2e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00327839 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2453  peptidase M22 glycoprotease  33.19 
 
 
238 aa  120  2e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1756  peptidase M22, glycoprotease  33.88 
 
 
236 aa  119  4e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.206802  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0447  glycoprotease family protein  32.49 
 
 
232 aa  119  6e-26  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.204444  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2146  peptidase M22 glycoprotease  34.06 
 
 
222 aa  118  7e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.472287  hitchhiker  0.00199457 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2516  hypothetical protein  34.06 
 
 
222 aa  118  7e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1112  peptidase M22 glycoprotease  32.61 
 
 
224 aa  118  8e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1507  hypothetical protein  31.44 
 
 
224 aa  118  9e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1193  peptidase M22, glycoprotease  34.93 
 
 
229 aa  118  1e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.215094 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1320  peptidase M22, glycoprotease  31.06 
 
 
224 aa  117  1e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00928754 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0917  peptidase M22, glycoprotease  38.6 
 
 
228 aa  116  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4215  peptidase M22, glycoprotease  31 
 
 
224 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.596707 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1859  peptidase M22 glycoprotease  32.07 
 
 
237 aa  115  6e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1893  peptidase M22 glycoprotease  32.07 
 
 
237 aa  115  7e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.546887 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2105  peptidase M22 glycoprotease  32.16 
 
 
239 aa  115  7e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.279787  normal  0.949739 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3357  peptidase M22, glycoprotease  31.2 
 
 
227 aa  114  9e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.756151  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2433  peptidase M22 glycoprotease  32.07 
 
 
237 aa  114  1e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.774053  normal  0.20354 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1886  peptidase M22 glycoprotease  32.07 
 
 
237 aa  114  1e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.174274  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1939  peptidase M22, glycoprotease  35.42 
 
 
282 aa  113  2e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132529  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0412  peptidase M22, glycoprotease  34.89 
 
 
231 aa  114  2e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1728  peptidase M22, glycoprotease  32.34 
 
 
233 aa  114  2e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1458  non-proteolytic protein, peptidase family M22  28.32 
 
 
226 aa  112  4e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1885  hypothetical protein  31.14 
 
 
223 aa  111  8e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1527  M22 peptidase homolog yeaZ  28.76 
 
 
226 aa  111  1e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0306852  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1896  hypothetical protein  29.82 
 
 
223 aa  109  3e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1395  peptidase M22, glycoprotease  30.83 
 
 
281 aa  108  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.834993 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1410  peptidase M22 glycoprotease  37.65 
 
 
266 aa  108  9e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0784  peptidase M22 glycoprotease  32.03 
 
 
229 aa  107  1e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.318216  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2808  peptidase M22, glycoprotease  33.05 
 
 
234 aa  106  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1240  peptidase M22 glycoprotease  30.24 
 
 
246 aa  106  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464937  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0872  hypothetical protein  34.06 
 
 
229 aa  105  5e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  3.81298e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0994  peptidase M22 glycoprotease  32.75 
 
 
237 aa  105  6e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0778  hypothetical protein  32.24 
 
 
239 aa  105  7e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1939  hypothetical protein  29.96 
 
 
236 aa  104  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.287611  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1673  peptidase M22, glycoprotease  29.07 
 
 
223 aa  103  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0356  hypothetical protein  31.25 
 
 
228 aa  103  3e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0444593 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01100  putative glycoprotease family exported protein  30.08 
 
 
222 aa  103  3e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1294  peptidase M22 glycoprotease  30.6 
 
 
233 aa  102  6e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.450316  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1367  putative transmembrane protein  32.34 
 
 
243 aa  101  9e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.742517  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2301  peptidase M22, glycoprotease  28.93 
 
 
237 aa  101  9e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110817  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2257  peptidase M22 glycoprotease  32.19 
 
 
230 aa  101  9e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0733925  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0915  peptidase M22, glycoprotease  31.86 
 
 
225 aa  101  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01598  glycoprotease family protein  30.04 
 
 
239 aa  100  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1725  glycoprotease  32.46 
 
 
229 aa  100  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.803312 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0927  peptidase M22 glycoprotease  29.79 
 
 
238 aa  99  5e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0099  M22 family peptidase  29.78 
 
 
225 aa  98.6  7e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00192145 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0400  peptidase M22 glycoprotease  30.13 
 
 
236 aa  98.2  9e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0240362 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0761  peptidase M22 glycoprotease  39.58 
 
 
229 aa  97.8  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.731351  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0489  peptidase M22, glycoprotease  28.44 
 
 
230 aa  97.8  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.650313  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2159  peptidase M22, glycoprotease  31.42 
 
 
228 aa  97.1  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000287799 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1306  peptidase M22 glycoprotease  31.56 
 
 
246 aa  97.1  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0447372  normal  0.269549 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1868  metal-dependent protease-like protein  31 
 
 
238 aa  96.3  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.01917  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3092  peptidase M22 glycoprotease  29.13 
 
 
237 aa  95.9  5e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.492072 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>