121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2138 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2138  tetratricopeptide repeat protein  100 
 
 		 401 aa  827    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00930218  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1378  tetratricopeptide repeat protein  36.21 
 
 		 389 aa  226  5.0000000000000005e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1374  tetratricopeptide repeat protein  35.92 
 
 		 389 aa  223  4.9999999999999996e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3221  TPR repeat-containing protein  32.48 
 
 		 392 aa  221  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0588004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1533  tetratricopeptide repeat protein  33.42 
 
 		 389 aa  217  2e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0185  tetratricopeptide repeat protein  37.5 
 
 		 387 aa  217  2.9999999999999998e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.340896  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0644  tetratricopeptide repeat protein  33.42 
 
 		 388 aa  217  2.9999999999999998e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132586  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2154  tetratricopeptide repeat protein  36.68 
 
 		 394 aa  211  2e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00078802  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2224  tetratricopeptide repeat protein  35.49 
 
 		 389 aa  209  5e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000811789  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2641  tetratricopeptide repeat protein  33.24 
 
 		 389 aa  209  7e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000590844  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2650  tetratricopeptide repeat protein  33.78 
 
 		 389 aa  206  4e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000174406  unclonable  0.0000000582873 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003023  putative heat shock protein  34.66 
 
 		 373 aa  206  5e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000120972  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2464  tetratricopeptide repeat protein  32.28 
 
 		 389 aa  205  1e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000301038  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2367  tetratricopeptide repeat protein  33.05 
 
 		 389 aa  205  1e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000126783  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02857  tetratricopeptide repeat protein  34.66 
 
 		 391 aa  204  2e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0934  tetratricopeptide repeat protein  38.03 
 
 		 389 aa  203  4e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2188  tetratricopeptide repeat protein  31.88 
 
 		 389 aa  203  4e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000146225  hitchhiker  0.0000569887 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1502  tetratricopeptide repeat protein  35.59 
 
 		 389 aa  203  5e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000018122  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01257  hypothetical protein  33.42 
 
 		 389 aa  202  6e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000160117  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2367  Tetratricopeptide domain protein  33.42 
 
 		 389 aa  202  6e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000651113  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1914  tetratricopeptide repeat protein  33.42 
 
 		 389 aa  202  6e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000156513  hitchhiker  3.47203e-22 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1391  tetratricopeptide repeat protein  33.42 
 
 		 389 aa  202  6e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  4.935719999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1482  tetratricopeptide repeat protein  33.42 
 
 		 389 aa  202  6e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000455068  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2346  tetratricopeptide repeat protein  33.42 
 
 		 389 aa  202  6e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000129079  unclonable  0.0000000238916 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1849  tetratricopeptide repeat protein  33.42 
 
 		 389 aa  202  6e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000245858  unclonable  5.61509e-21 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1508  tetratricopeptide repeat protein  33.42 
 
 		 389 aa  202  6e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000376435  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01268  hypothetical protein  33.42 
 
 		 390 aa  202  6e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000197215  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1702  tetratricopeptide repeat protein  31.89 
 
 		 389 aa  200  3e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000418527  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2234  tetratricopeptide repeat protein  31.36 
 
 		 389 aa  201  3e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000215898  hitchhiker  0.00382092 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1915  tetratricopeptide repeat protein  31.79 
 
 		 389 aa  200  5e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000481977  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2026  tetratricopeptide repeat protein  31.79 
 
 		 389 aa  200  5e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000487285  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0560  tetratricopeptide repeat protein  36.29 
 
 		 389 aa  198  1.0000000000000001e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.143452  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1283  tetratricopeptide repeat protein  33.6 
 
 		 390 aa  194  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.95391  normal  0.767339 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1735  tetratricopeptide repeat protein  32.67 
 
 		 389 aa  192  6e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000233751  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1030  tetratricopeptide repeat protein  34.5 
 
 		 390 aa  190  2.9999999999999997e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.457607  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1957  tetratricopeptide repeat protein  34.11 
 
 		 386 aa  190  4e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000379744  hitchhiker  0.0000558993 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1832  tetratricopeptide repeat protein  33.15 
 
 		 389 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00100254  unclonable  2.05101e-30 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1895  tetratricopeptide repeat protein  33.15 
 
 		 389 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000228715  hitchhiker  4.98218e-17 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1837  tetratricopeptide repeat protein  33.15 
 
 		 389 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000022719  hitchhiker  0.000343343 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02118  tetratricopeptide repeat protein  30.95 
 
 		 389 aa  188  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000128021  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1441  tetratricopeptide repeat protein  33.15 
 
 		 389 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000153911  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1622  tetratricopeptide repeat protein  33.15 
 
 		 389 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000649442  decreased coverage  2.66656e-22 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2076  tetratricopeptide repeat protein  32.38 
 
 		 386 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000100726  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00894  tetratricopeptide repeat protein  31.88 
 
 		 392 aa  184  3e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0775107  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1546  TPR repeat-containing protein  34.53 
 
 		 397 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.153552  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0924  tetratricopeptide repeat protein  33.05 
 
 		 387 aa  180  4e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.262727  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1068  tetratricopeptide repeat protein  33.05 
 
 		 387 aa  180  4e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.26691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2069  tetratricopeptide repeat protein  32.39 
 
 		 386 aa  179  9e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000265574  unclonable  0.00000000000285968 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3032  tetratricopeptide repeat protein  33.81 
 
 		 391 aa  178  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.362688  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2276  tetratricopeptide repeat protein  32.39 
 
 		 386 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000164995  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2393  tetratricopeptide repeat protein  32.39 
 
 		 386 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000487508  unclonable  0.0000114116 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2295  tetratricopeptide repeat protein  31.41 
 
 		 386 aa  177  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000258427  unclonable  0.000000000117137 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2120  tetratricopeptide repeat protein  31.71 
 
 		 386 aa  177  4e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000410522  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1739  tetratricopeptide repeat protein  33.06 
 
 		 386 aa  177  4e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000105333  hitchhiker  0.00275334 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2073  tetratricopeptide repeat protein  32.11 
 
 		 386 aa  176  6e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000729266  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2314  tetratricopeptide repeat protein  31.85 
 
 		 386 aa  176  6e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000283744  hitchhiker  0.000000379293 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0749  tetratricopeptide repeat protein  33.05 
 
 		 391 aa  176  9e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0880031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1649  tetratricopeptide repeat protein  32.82 
 
 		 392 aa  176  9e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.165991  normal  0.0903087 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2399  tetratricopeptide repeat protein  30.49 
 
 		 386 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1927  tetratricopeptide repeat protein  30.75 
 
 		 386 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000214151  unclonable  0.0000000000455272 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2051  tetratricopeptide repeat protein  30.75 
 
 		 386 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000458235  unclonable  0.0000309501 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1594  tetratricopeptide repeat protein  31.03 
 
 		 392 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.632242  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4163  tetratricopeptide repeat protein  31.52 
 
 		 390 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2039  tetratricopeptide repeat protein  30.75 
 
 		 386 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000051  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1980  tetratricopeptide repeat protein  30.49 
 
 		 386 aa  172  1e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000007627  unclonable  0.0000000000727651 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2566  tetratricopeptide repeat protein  32.75 
 
 		 407 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1537  tetratricopeptide repeat protein  30.75 
 
 		 392 aa  171  2e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2998  tetratricopeptide repeat protein  32.49 
 
 		 391 aa  170  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0827469  hitchhiker  0.0038903 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0782  tetratricopeptide repeat protein  30.9 
 
 		 424 aa  170  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0709697 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0959  tetratricopeptide repeat protein  32.11 
 
 		 394 aa  170  5e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.214004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1756  tetratricopeptide repeat protein  30.51 
 
 		 386 aa  169  6e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000020151  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0985  tetratricopeptide repeat protein  32.2 
 
 		 391 aa  169  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0502  tetratricopeptide repeat protein  31.59 
 
 		 403 aa  168  1e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.914976  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0853  tetratricopeptide repeat protein  30.9 
 
 		 424 aa  169  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.585626 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2254  tetratricopeptide repeat protein  31.87 
 
 		 390 aa  166  5e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1216  tetratricopeptide repeat protein  33.24 
 
 		 408 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.608666  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0912  tetratricopeptide repeat protein  31.03 
 
 		 425 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0926  tetratricopeptide repeat protein  31.88 
 
 		 390 aa  166  8e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.168968  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1641  tetratricopeptide repeat protein  31.62 
 
 		 389 aa  166  9e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0571  tetratricopeptide repeat protein  31.52 
 
 		 390 aa  166  9e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1050  tetratricopeptide repeat protein  31.52 
 
 		 390 aa  166  9e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1009  tetratricopeptide repeat protein  31.52 
 
 		 390 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0748562  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0424  tetratricopeptide repeat protein  31.09 
 
 		 389 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.393015  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2990  tetratricopeptide repeat protein  31.09 
 
 		 389 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2568  tetratricopeptide repeat protein  31.09 
 
 		 389 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0943  tetratricopeptide repeat protein  31.09 
 
 		 389 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2942  tetratricopeptide repeat protein  31.09 
 
 		 389 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0205  tetratricopeptide repeat protein  31.09 
 
 		 389 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0930  tetratricopeptide repeat protein  31.35 
 
 		 390 aa  164  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.583178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3010  tetratricopeptide repeat protein  30 
 
 		 390 aa  163  4.0000000000000004e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00816471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2879  tetratricopeptide repeat protein  30.83 
 
 		 389 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223768  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1306  tetratricopeptide repeat protein  30.85 
 
 		 403 aa  162  1e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.250179  hitchhiker  0.00000292633 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0725  tetratricopeptide repeat protein  30.71 
 
 		 409 aa  161  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0176529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1563  tetratricopeptide repeat protein  32.21 
 
 		 385 aa  158  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3288  tetratricopeptide repeat protein  32.86 
 
 		 385 aa  157  4e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.190691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4727  tetratricopeptide repeat protein  32.92 
 
 		 391 aa  154  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.841453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1786  tetratricopeptide repeat protein  31.19 
 
 		 381 aa  154  2.9999999999999998e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420165 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2799  tetratricopeptide repeat protein  32.38 
 
 		 381 aa  152  8.999999999999999e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000578522 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0973  tetratricopeptide repeat protein  31.48 
 
 		 398 aa  150  3e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000517245  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1611  tetratricopeptide repeat protein  31.39 
 
 		 392 aa  144  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>