More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2093 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2093  GTP cyclohydrolase  100 
 
 		 179 aa  371  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.101734  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23690  GTP cyclohydrolase I  68.16 
 
 		 181 aa  276  1e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0310829  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2035  GTP cyclohydrolase I  69.83 
 
 		 181 aa  275  2e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31903  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1715  GTP cyclohydrolase I  69.27 
 
 		 181 aa  275  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1845  GTP cyclohydrolase I  69.83 
 
 		 181 aa  274  4e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.350099 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42850  GTP cyclohydrolase I  67.6 
 
 		 181 aa  275  4e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3598  GTP cyclohydrolase I  67.6 
 
 		 181 aa  274  5e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.812952  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1431  GTP cyclohydrolase I  68.16 
 
 		 181 aa  272  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.33903  normal  0.426591 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2744  GTP cyclohydrolase I  67.6 
 
 		 181 aa  270  9e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0752455  normal  0.719118 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1670  GTP cyclohydrolase I  67.42 
 
 		 185 aa  268  4e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2930  GTP cyclohydrolase I  69.14 
 
 		 182 aa  266  1e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1690  GTP cyclohydrolase I  66.85 
 
 		 186 aa  263  7e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19630  GTP cyclohydrolase I  66.85 
 
 		 186 aa  263  8e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1182  GTP cyclohydrolase I  66.85 
 
 		 187 aa  263  8.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1020  GTP cyclohydrolase I  66.85 
 
 		 187 aa  262  2e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0891  GTP cyclohydrolase I  66.85 
 
 		 186 aa  262  2e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2294  GTP cyclohydrolase I  66.29 
 
 		 184 aa  262  2e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2469  GTP cyclohydrolase I  67.43 
 
 		 181 aa  261  3e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3289  GTP cyclohydrolase  66.85 
 
 		 186 aa  261  4e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3207  GTP cyclohydrolase I  65.17 
 
 		 186 aa  258  2e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.574177  normal  0.0542023 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2512  GTP cyclohydrolase I  65.17 
 
 		 186 aa  258  3e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1401  GTP cyclohydrolase I  69.27 
 
 		 181 aa  258  4e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.154537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3888  GTP cyclohydrolase I  69.27 
 
 		 181 aa  258  4e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.299741 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1823  GTP cyclohydrolase I  69.27 
 
 		 190 aa  257  7e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00310183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2021  GTP cyclohydrolase I  65.17 
 
 		 186 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.780834  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2678  GTP cyclohydrolase I  64.8 
 
 		 180 aa  256  2e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.508198  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3782  GTP cyclohydrolase I  64.61 
 
 		 189 aa  255  2e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2814  GTP cyclohydrolase I  64.25 
 
 		 179 aa  255  3e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2683  GTP cyclohydrolase I  64.25 
 
 		 179 aa  254  6e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0548  GTP cyclohydrolase I  62.36 
 
 		 184 aa  252  2.0000000000000002e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1299  GTP cyclohydrolase  64.57 
 
 		 185 aa  252  2.0000000000000002e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1799  GTP cyclohydrolase I  60.67 
 
 		 198 aa  243  9.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.982751  hitchhiker  0.00000626036 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0955  GTP cyclohydrolase I  59.66 
 
 		 201 aa  241  3.9999999999999997e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000998174  hitchhiker  0.00336193 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1425  GTP cyclohydrolase I  61.85 
 
 		 203 aa  237  8e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.899017  normal  0.42931 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1153  GTP cyclohydrolase I  61.58 
 
 		 184 aa  237  8e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0863  GTP cyclohydrolase I  61.58 
 
 		 188 aa  236  1e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1393  GTP cyclohydrolase I  62.57 
 
 		 200 aa  236  1e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3350  GTP cyclohydrolase I  61.05 
 
 		 247 aa  235  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1044  GTP cyclohydrolase  58.96 
 
 		 203 aa  230  7.000000000000001e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.663333 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1390  GTP cyclohydrolase I  57.8 
 
 		 213 aa  228  4e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0969  GTP cyclohydrolase  57.54 
 
 		 243 aa  226  1e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0257975  normal  0.517316 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0859  GTP cyclohydrolase I  61.4 
 
 		 226 aa  225  2e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.323599 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2208  GTP cyclohydrolase  58.43 
 
 		 199 aa  226  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0579312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0402  GTP cyclohydrolase I  59.88 
 
 		 235 aa  224  6e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.160762  normal  0.817545 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0939  GTP cyclohydrolase I  56.42 
 
 		 239 aa  223  8e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0912  GTP cyclohydrolase I  56.42 
 
 		 239 aa  223  8e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2537  GTP cyclohydrolase I  56.42 
 
 		 235 aa  223  1e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1597  GTP cyclohydrolase I  60.12 
 
 		 213 aa  223  2e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.874876  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3367  GTP cyclohydrolase I  56.98 
 
 		 235 aa  222  2e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501269  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1588  GTP cyclohydrolase I  58.43 
 
 		 223 aa  222  3e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0206  GTP cyclohydrolase I  56.14 
 
 		 202 aa  220  8e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0372  GTP cyclohydrolase I  58.72 
 
 		 223 aa  220  9e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.884596  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4616  GTP cyclohydrolase I  58.33 
 
 		 212 aa  220  9e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0762321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0754  GTP cyclohydrolase I  57.47 
 
 		 216 aa  219  1.9999999999999999e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0859  GTP cyclohydrolase I  56.9 
 
 		 219 aa  219  1.9999999999999999e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.765891  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1858  GTP cyclohydrolase I  57.47 
 
 		 218 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1694  GTP cyclohydrolase I  56.73 
 
 		 195 aa  219  1.9999999999999999e-56  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1496  GTP cyclohydrolase I  54.1 
 
 		 190 aa  218  3e-56  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0225  GTP cyclohydrolase I  56.14 
 
 		 190 aa  218  3e-56  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0204  GTP cyclohydrolase I  56.73 
 
 		 190 aa  218  3e-56  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1778  GTP cyclohydrolase I  53.55 
 
 		 190 aa  218  3e-56  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3847  GTP cyclohydrolase I  57.74 
 
 		 218 aa  218  5e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0187  GTP cyclohydrolase I  55.56 
 
 		 190 aa  218  5e-56  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08636  GTP cyclohydrolase I  55.06 
 
 		 199 aa  216  1e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1481  GTP cyclohydrolase I  54.4 
 
 		 190 aa  216  1e-55  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2932  GTP cyclohydrolase I  57.65 
 
 		 201 aa  216  2e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0900198 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0976  GTP cyclohydrolase I  57.31 
 
 		 219 aa  215  2.9999999999999998e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.49412  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1949  GTP cyclohydrolase I  54.76 
 
 		 216 aa  214  7e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.414952 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2156  GTP cyclohydrolase I  56.73 
 
 		 193 aa  213  9.999999999999999e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0864  GTP cyclohydrolase I  52.51 
 
 		 214 aa  212  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0890  GTP cyclohydrolase I  52.51 
 
 		 214 aa  212  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.273347  normal  0.916518 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34960  GTP cyclohydrolase I (GTP-CH-I)  53.8 
 
 		 270 aa  211  5.999999999999999e-54  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0625  GTP cyclohydrolase I  54.49 
 
 		 193 aa  209  1e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.497078 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0041  GTP cyclohydrolase I  52.25 
 
 		 194 aa  209  2e-53  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2117  GTP cyclohydrolase I  54.07 
 
 		 203 aa  209  2e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08188  hypothetical protein similar to GTP cyclohydrolase I (Broad)  56.73 
 
 		 329 aa  207  1e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2086  GTP cyclohydrolase I  54.49 
 
 		 179 aa  206  1e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04920  GTP cyclohydrolase I, putative  52.33 
 
 		 435 aa  206  2e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4149  GTP cyclohydrolase I  53.41 
 
 		 210 aa  205  3e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0266568 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6956  GTP cyclohydrolase I  53.98 
 
 		 195 aa  204  5e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.837765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21868  predicted protein  50 
 
 		 186 aa  200  9.999999999999999e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.213311  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0193  GTP cyclohydrolase I  50 
 
 		 220 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0131  GTP cyclohydrolase I  51.19 
 
 		 206 aa  194  6e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0705  GTP cyclohydrolase I  50.58 
 
 		 226 aa  187  5e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0301  GTP cyclohydrolase I  48.84 
 
 		 225 aa  181  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000150261  normal  0.11188 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2980  GTP cyclohydrolase I  49.44 
 
 		 185 aa  177  5.999999999999999e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000239263  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1041  GTP cyclohydrolase I  49.7 
 
 		 213 aa  177  5.999999999999999e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.25698  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0017  GTP cyclohydrolase I  49.11 
 
 		 224 aa  177  8e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1075  GTP cyclohydrolase I  48.81 
 
 		 213 aa  176  1e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.76008  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0242  GTP cyclohydrolase I  47.19 
 
 		 206 aa  176  1e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.850043 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0811  GTP cyclohydrolase I  46.67 
 
 		 188 aa  176  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000676289  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0553  GTP cyclohydrolase I  47.78 
 
 		 188 aa  175  3e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4006  GTP cyclohydrolase I  45.56 
 
 		 203 aa  174  5e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.580102  normal  0.063729 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4310  GTP cyclohydrolase I  47.67 
 
 		 212 aa  174  8e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.208107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0641  GTP cyclohydrolase  47.67 
 
 		 212 aa  174  8e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104084 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0990  GTP cyclohydrolase I  45.81 
 
 		 203 aa  173  9.999999999999999e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4971  GTP cyclohydrolase I  49.43 
 
 		 199 aa  173  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.853969 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0445  GTP cyclohydrolase I  48.82 
 
 		 205 aa  173  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0408  GTP cyclohydrolase  49.42 
 
 		 185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.503604  normal  0.0142935 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4504  GTP cyclohydrolase I  47.7 
 
 		 210 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>