More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2069 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2069  succinyl-CoA ligase, alpha subunit  100 
 
 		 306 aa  627  1e-179  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.534339  normal  0.58415 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2279  hypothetical protein  59.27 
 
 		 305 aa  355  5e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26910  hypothetical protein  58.94 
 
 		 305 aa  352  4e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2450  ATPase  58.61 
 
 		 305 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.620681  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2248  moxR protein, putative  58.36 
 
 		 305 aa  350  2e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.161333  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1883  ATPase  56 
 
 		 306 aa  349  3e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.666763 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2370  MoxR-like ATPase  54.97 
 
 		 305 aa  345  4e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.470488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2348  ATPase  55.3 
 
 		 315 aa  345  5e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2053  moxR protein, putative  57.05 
 
 		 305 aa  345  7e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.528034 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2530  ATPase  55.67 
 
 		 303 aa  345  7e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1967  ATPase  54.33 
 
 		 303 aa  341  9e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.379731  normal  0.918061 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0819  ATPase  55.02 
 
 		 315 aa  341  1e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1752  ATPase  55.02 
 
 		 303 aa  340  2e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.682382  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1837  ATPase  57.3 
 
 		 302 aa  339  4e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0468  moxR protein, putative  55.25 
 
 		 303 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2416  ATPase  57.5 
 
 		 303 aa  334  9e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.858381  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1491  MoxR protein, putative  56.52 
 
 		 315 aa  334  1e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00106383  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3626  putative ATPase  56.58 
 
 		 308 aa  332  5e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3009  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  57.86 
 
 		 331 aa  331  9e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.116146  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2098  ATPase  54 
 
 		 303 aa  330  2e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1897  MoxR protein  56.64 
 
 		 309 aa  330  2e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.585542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2163  ATPase  52.15 
 
 		 306 aa  329  5.0000000000000004e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.591841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2107  ATPase  56.07 
 
 		 303 aa  328  6e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5567  ATPase  56.45 
 
 		 305 aa  328  7e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0627555  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2051  ATPase  53.67 
 
 		 303 aa  328  9e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.285449  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2126  ATPase  55.2 
 
 		 303 aa  326  3e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3377  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.66 
 
 		 306 aa  325  8.000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.28342  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.22 
 
 		 300 aa  323  2e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0353167  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02555  MoxR protein  52 
 
 		 315 aa  322  4e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.080155  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2623  ATPase  54.42 
 
 		 303 aa  322  4e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.3673  normal  0.0965943 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1245  putative MoxR like protein  52.94 
 
 		 306 aa  322  5e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0487098  normal  0.300383 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0889  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  55.76 
 
 		 329 aa  322  6e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2153  MoxR protein  54.36 
 
 		 303 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1676  methanol dehydrogenase regulatory protein  56.99 
 
 		 335 aa  320  1.9999999999999998e-86  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1945  ATPase  56.63 
 
 		 335 aa  319  3e-86  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2517  ATPase  56.21 
 
 		 315 aa  319  5e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.431864  normal  0.118214 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2096  ATPase  51.89 
 
 		 306 aa  318  5e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1856  ATPase  54.36 
 
 		 303 aa  318  7.999999999999999e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.195599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2242  ATPase  54.36 
 
 		 313 aa  318  9e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.839891  normal  0.451068 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2529  AAA_3 ATPase  52.25 
 
 		 306 aa  317  1e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1778  ATPase  54.01 
 
 		 303 aa  317  1e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2287  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  56.18 
 
 		 303 aa  317  1e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.243939  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1871  hypothetical protein  54.71 
 
 		 304 aa  316  3e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4561  hypothetical protein  54.01 
 
 		 303 aa  316  3e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2275  ATPase  54.01 
 
 		 303 aa  316  3e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1879  MoxR protein-like  57.04 
 
 		 312 aa  315  4e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1862  hypothetical protein  54.35 
 
 		 304 aa  315  6e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02436  methanol dehydrogenase regulator  51.02 
 
 		 308 aa  315  7e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.808259  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3854  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  55.29 
 
 		 323 aa  315  9e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.484851  normal  0.657971 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3968  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  55.29 
 
 		 323 aa  315  9e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0680524 
 
 
-
 
NC_003296  RS03013  hypothetical protein  55.63 
 
 		 321 aa  314  9.999999999999999e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.601982 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1523  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.57 
 
 		 305 aa  313  1.9999999999999998e-84  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3277  ATPase  54.64 
 
 		 310 aa  313  1.9999999999999998e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2778  hypothetical protein  49.7 
 
 		 350 aa  313  2.9999999999999996e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2303  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.33 
 
 		 306 aa  312  3.9999999999999997e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2814  ATPase  51.33 
 
 		 306 aa  312  3.9999999999999997e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.826305  normal  0.378923 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3146  ATPase  54.09 
 
 		 306 aa  312  5.999999999999999e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.109548 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0864  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.84 
 
 		 317 aa  309  4e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1116  ATPase  49.66 
 
 		 317 aa  307  1.0000000000000001e-82  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2386  ATPase  51.9 
 
 		 306 aa  307  2.0000000000000002e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1210  methanol dehydrogenase regulatory protein  49.66 
 
 		 317 aa  306  3e-82  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1323  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  55.28 
 
 		 308 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.167846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1792  ATPase  56.51 
 
 		 317 aa  303  2.0000000000000002e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.611153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1219  ATPase  53.24 
 
 		 310 aa  303  2.0000000000000002e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.240667  normal  0.223931 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19020  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.14 
 
 		 313 aa  297  1e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2912  ATPase  53.93 
 
 		 349 aa  296  3e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.275117 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1359  ATPase  46.79 
 
 		 310 aa  291  1e-77  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.020418  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1760  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.08 
 
 		 333 aa  289  5.0000000000000004e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00353191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8515  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.08 
 
 		 327 aa  288  8e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0550529  normal  0.0546803 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21600  MoxR-like ATPase  47.45 
 
 		 322 aa  287  2e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.264241  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05630  MoxR-like ATPase  48.72 
 
 		 331 aa  286  2.9999999999999996e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.609898  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1119  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.1 
 
 		 318 aa  286  4e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0345  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.26 
 
 		 310 aa  283  2.0000000000000002e-75  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.898086  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0210  ATPase  49.29 
 
 		 347 aa  283  3.0000000000000004e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.283743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0280  ATPase  44.72 
 
 		 312 aa  282  4.0000000000000003e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.760866  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0438  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.38 
 
 		 316 aa  281  1e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0095  MoxR protein  49.14 
 
 		 317 aa  281  1e-74  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3201  ATPase  47.37 
 
 		 319 aa  280  3e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1709  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.77 
 
 		 321 aa  279  5e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1592  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.74 
 
 		 325 aa  279  5e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.488895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1288  ATPase  47.33 
 
 		 323 aa  278  6e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2197  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.84 
 
 		 318 aa  278  8e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.451133  decreased coverage  0.00303676 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0928  ATPase  44.09 
 
 		 314 aa  278  9e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0622  ATPase  46.47 
 
 		 327 aa  278  1e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6584  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.58 
 
 		 325 aa  278  1e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.597099 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0802  ATPase  47.27 
 
 		 317 aa  277  2e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.86 
 
 		 319 aa  276  3e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3181  MoxR protein  45.36 
 
 		 320 aa  276  4e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2134  MoxR protein  45.36 
 
 		 320 aa  276  4e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0692  ATPase  46.15 
 
 		 323 aa  276  4e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0485  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.92 
 
 		 327 aa  276  4e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.176782  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1183  ATPase  43.04 
 
 		 309 aa  276  4e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.247758  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0240  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.9 
 
 		 303 aa  275  6e-73  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.288695  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0704  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  41.34 
 
 		 314 aa  275  6e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1331  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.35 
 
 		 324 aa  275  7e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.280532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1399  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.29 
 
 		 306 aa  275  7e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1369  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.29 
 
 		 306 aa  275  7e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4014  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.21 
 
 		 312 aa  275  9e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1332  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.33 
 
 		 323 aa  274  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000274445 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4817  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.99 
 
 		 330 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>