58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1850 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1850  sensor protein GLPS  100 
 
 		 302 aa  582  1.0000000000000001e-165  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.829384 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0781  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.06 
 
 		 295 aa  216  5e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1975  hypothetical protein  49.06 
 
 		 283 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0979714  hitchhiker  0.00214562 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2000  hypothetical protein  48.69 
 
 		 283 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389336  decreased coverage  0.00000000377823 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2087  LysR family transcriptional regulator  46.98 
 
 		 283 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.632032  hitchhiker  0.0000000953173 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2935  hypothetical protein  48.58 
 
 		 286 aa  209  6e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3109  hypothetical protein  46.35 
 
 		 289 aa  209  7e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0895719 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0646  hypothetical protein  42.56 
 
 		 288 aa  203  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00955347  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4266  hypothetical protein  44.33 
 
 		 295 aa  202  5e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0746  DMT family permease  43.43 
 
 		 297 aa  198  7.999999999999999e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4102  hypothetical protein  45.32 
 
 		 302 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.576037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1774  hypothetical protein  42.61 
 
 		 297 aa  195  7e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1346  hypothetical protein  43.34 
 
 		 314 aa  194  1e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3521  hypothetical protein  48.18 
 
 		 290 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349623  normal  0.801415 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2406  hypothetical protein  50.18 
 
 		 290 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.268881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001148  permease  43.51 
 
 		 289 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.270511  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1068  hypothetical protein  39.66 
 
 		 311 aa  182  6e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01739  hypothetical protein  42.7 
 
 		 303 aa  181  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1416  hypothetical protein  40.4 
 
 		 304 aa  181  1e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.732037  normal  0.239593 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1656  hypothetical protein  43.88 
 
 		 297 aa  180  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0479067  normal  0.122332 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0600  hypothetical protein  44.09 
 
 		 297 aa  179  4.999999999999999e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.172684 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1446  hypothetical protein  38.19 
 
 		 314 aa  177  1e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4790  membrane protein  39.01 
 
 		 285 aa  175  8e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.278325  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06636  hypothetical protein  42.31 
 
 		 289 aa  175  9e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38950  hypothetical protein  48 
 
 		 287 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2254  hypothetical protein  47.84 
 
 		 290 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.290541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5364  hypothetical protein  40.15 
 
 		 285 aa  171  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.278081  normal  0.929346 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1891  hypothetical protein  40.15 
 
 		 300 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3816  hypothetical protein  44.48 
 
 		 307 aa  160  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02132  permease of the drug/metabolite transporter superfamily protein  49.75 
 
 		 194 aa  157  3e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.259073  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3318  hypothetical protein  46.55 
 
 		 286 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3356  hypothetical protein  42.65 
 
 		 287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1051  DMT superfamily efflux pump  40.65 
 
 		 254 aa  141  9.999999999999999e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.226473  normal  0.464817 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6146  hypothetical protein  40.36 
 
 		 302 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2916  hypothetical protein  40.43 
 
 		 282 aa  140  3e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.264108  normal  0.862431 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6439  hypothetical protein  41.7 
 
 		 275 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.719443 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1433  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.22 
 
 		 296 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1087  hypothetical protein  46.77 
 
 		 281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.647653 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46360  hypothetical protein  46.21 
 
 		 285 aa  119  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.206778  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0856  hypothetical protein  37.64 
 
 		 288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0559005  normal  0.228089 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1689  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.75 
 
 		 301 aa  115  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.112167  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2262  hypothetical protein  42.86 
 
 		 319 aa  112  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.099345  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1613  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.97 
 
 		 307 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.76207  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3405  transporter, EamA family  21.51 
 
 		 294 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3401  integral membrane protein  21.51 
 
 		 294 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.531981  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3467  hypothetical protein  31.82 
 
 		 298 aa  51.2  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  27.78 
 
 		 289 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.46 
 
 		 299 aa  50.4  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.511844  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0925  hypothetical protein  25.09 
 
 		 304 aa  47.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.986628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1272  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.76 
 
 		 314 aa  47  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.162759  normal  0.535938 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0771  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.52 
 
 		 286 aa  45.4  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3424  eama family protein  21.13 
 
 		 294 aa  43.5  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3174  EamA family protein  21.13 
 
 		 294 aa  43.5  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0418  hypothetical protein  28.3 
 
 		 306 aa  42.7  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1612  integral membrane protein  29.61 
 
 		 298 aa  42.7  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.32939  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2588  hypothetical protein  23.62 
 
 		 293 aa  42.4  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0344975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3097  hypothetical protein  24.18 
 
 		 295 aa  42.4  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.27047  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1258  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.65 
 
 		 305 aa  42.4  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>